| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 625,719 | A→C | intergenic (‑64/+185) | unknown ← / ← unknown | PTS system, N‑acetylglucosamine‑specific IIC component / PTS system, N‑acetylglucosamine‑specific IIB component (EC 2.7.1.193)/N‑acetylneuraminate epimerase (EC 5.1.3.24) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 625,719 | 0 | A | C | 100.0% | 133.9 / NA | 48 | intergenic (‑64/+185) | unknown/unknown | PTS system, N‑acetylglucosamine‑specific IIC component / PTS system, N‑acetylglucosamine‑specific IIB component (EC 2.7.1.193)/N‑acetylneuraminate epimerase (EC 5.1.3.24) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (24/24); total (24/24) | |||||||||||
CGATGATTGCCGCGCCGGACTTGATTAATAAGGCGGCAAGTTGGCTGTTTGCGCCCCAGCCGTCCGGGTCAAGCCAATAGCCGATCCCCATTAATACGGCGGCTGCCGGCAAAACGGCAACGGGTACCATTAAGGCTTGCCCGATTTTTTGGGCATAACTTAAAACACTCATACGAACTCCTTTAATTTATTTTTGATTC‑CATAAGATTTTTTATTAAACGGAAGAGAGCATATGACTATGCGATTTCCTTTGGCAAATAAAAA‑CTTCCGTTTTTGTGAGAAGTATCACGCAACGGCGTGGTATTAGCGGTGGCTTATTTTAAAA‑CGGTTCCCTTGTT‑CCGTAAA‑TTTGTGCCCGCCACAATAACAATGAAGGATTAAACGTCATTGGCGTAATCCTTCATTTTTTACGTCTTTGACAGGTTATTCGACACTTAATTTTTTGCCGTTGTAGCTCATGCTTTGTACGGAAGTTAA > 1/625484‑625957 | cGATGATTGCCGCGCCGGACTTGATTAATAAGGCGGCAAGTTGGCTGTTTGCGCCCCAGCCGTCCGGGTCAAGCCAATAGCCGATCCCCATTAATACGGCGGCTGCCGGCAAAACGGCAACGGGTACCATTAAGGCTTGCCCGATTTTTTGGGCATAACTTAAAACACTCATACGAACTCCTTTAATTTATTTTTGATTC‑CATAAGATTTTTTATTAAACGGAAGAGAGCATATGCCTATGCGATTTCCtt > 1:813603/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |