| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 616,411 | A→G | G354G (GGT→GGC) | unknown ← | Energy‑dependent translational throttle protein EttA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 616,411 | 0 | A | G | 100.0% | 236.4 / NA | 83 | G354G (GGT→GGC) | unknown | Energy‑dependent translational throttle protein EttA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (48/35); total (48/35) | |||||||||||
CCTTTGAAGTTGAAGCGTCCTACATAAGCACGGCTTGGGATTTCAAAGTTACCGATGGTTAGAATATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATACCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAAGAGTTCGTTGGTTTCGTTACGTTTTTGATATTCGCCGGAATTAAGTTCTTCGAAGCGCGCCATACGGGCTTTGCTTTTCGCTTGGCGGCCTTTCGGATTTTGACGCACCCATTCCAATTC > 1/616166‑616656 | ccTTTGAAGTTGAAGCGTCCTACATAAGCACGGCTTGGGATTTCAAAGTTACCGATGGTTAGAATATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGa > 1:248863/1‑250 (MQ=255) gttgaagCGTCCTACATAAGCACGGCTTGGGATTTCAAAGTTACCGATGGTTAGAATATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCa > 1:295835/1‑250 (MQ=255) ttgaagCGTCCTACATAAGCACGGCTTGGGATTTCAAAGTTACCGATGGTTAGAATATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑‑TTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCAc < 1:137642/249‑1 (MQ=255) gCGTCCTACATAAGCACGGCTTGGGATTTCAAAGTTACCGATGGTTAGAATATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTGGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCg > 1:18187/1‑251 (MQ=255) tCCTACATAAGCACGGCTTGGGATTTCAAAGTTACCGATGGTTAGAATATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGCATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGaa > 1:700601/1‑251 (MQ=255) tCCTACATAAGCACGGCTTGGGATTTCAAAGTTACCGATGGTTAGAATATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGaa > 1:20420/1‑251 (MQ=255) tCCTACATAAGCACGGCTTGGGATTTCAAAGTTACCGATGGTTAGAATATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGaa > 1:293133/1‑251 (MQ=255) cTACATAAGCACGGCTTGGGATTTCAAAGTTACCGATGGTTAGAATATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCAc < 1:583126/240‑1 (MQ=255) cTACATAAGCACGGCTTGGGATTTCAAAGTTACCGATGGTTAGAATATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATg > 1:462343/1‑251 (MQ=255) aCATAAGCACGGCTTGGGATTTCAAAGTTACCGATGGTTAGAATATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGGTTTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATg > 1:660174/1‑250 (MQ=255) aCATAAGCACGGCTTGGGATTTCAAAGTTACCGATGGTTAGAATATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATg > 1:730108/1‑249 (MQ=255) aCATAAGCACGGCTTGGGATTTCAAAGTTACCGATGGTTAGAATATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATg > 1:588237/1‑249 (MQ=255) aCATAAGCACGGCTTGGGATTTCAAAGTTACCGATGGTTAGAATATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAAAACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATg > 1:692481/1‑249 (MQ=255) cACGGCTTGGGATTTCAAAGTTACCGATGGTTAGAATATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAgg < 1:642828/249‑1 (MQ=255) cGGCTTGGGATTTCAAAGTTACCGATGGTTAGAATATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATaa > 1:300228/1‑251 (MQ=255) gCTTGGGATTTCAAAGTTACCGATGGTTAGAATATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAAt > 1:781289/1‑251 (MQ=255) gCTTGGGATTTCAAAGTTACCGATGGTTAGAATATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAAt > 1:347447/1‑251 (MQ=255) ttACCGATGGTTAGAATATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTg < 1:893616/249‑1 (MQ=255) ttACCGATGGTTAGAATATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTg < 1:6001/249‑1 (MQ=255) ggTTAGAATATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAAt > 1:867219/1‑227 (MQ=255) gTTAGAATATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTa > 1:323179/1‑251 (MQ=255) gAATATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGa > 1:352936/1‑250 (MQ=255) aaTATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGGTTTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGa > 1:271266/1‑250 (MQ=255) aaTATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGac < 1:424116/250‑1 (MQ=255) aaTATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACAGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGac < 1:677726/250‑1 (MQ=255) atCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCAc > 1:737735/1‑194 (MQ=255) ccGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTg < 1:535254/225‑1 (MQ=255) ccGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATg < 1:573458/251‑1 (MQ=255) cGTTGGACACTTCTTCCTACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTTGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGTCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGt < 1:423455/251‑1 (MQ=255) cGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGt < 1:528627/251‑1 (MQ=255) gTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAg > 1:851472/1‑202 (MQ=255) ggACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAAt > 1:762820/1‑245 (MQ=255) cttcttCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGac > 1:346893/1‑230 (MQ=255) cttcttCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGt > 1:858614/1‑242 (MQ=255) cttcttCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCg > 1:835212/1‑251 (MQ=255) tcttcCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGAt > 1:670672/1‑251 (MQ=255) gTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAAt < 1:538081/215‑1 (MQ=255) tCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGATGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATCTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGAc < 1:762714/250‑1 (MQ=255) tCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGAc < 1:597777/250‑1 (MQ=255) tCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGAc < 1:726814/250‑1 (MQ=255) tCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGAc < 1:719172/250‑1 (MQ=255) tCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGAc < 1:227652/250‑1 (MQ=255) tCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGAc < 1:855707/250‑1 (MQ=255) tCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGAc < 1:471975/250‑1 (MQ=255) tAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGAc < 1:633763/246‑1 (MQ=255) gCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTgg > 1:519700/1‑251 (MQ=255) cATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTg < 1:549981/249‑1 (MQ=255) tCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAAt > 1:370450/1‑205 (MQ=255) tCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAAt < 1:480326/251‑1 (MQ=255) tCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAAt > 1:626493/1‑251 (MQ=255) aCGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATaa > 1:148330/1‑251 (MQ=255) gAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGac > 1:373672/1‑190 (MQ=255) gAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAag < 1:221954/250‑1 (MQ=255) gAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAag < 1:48162/250‑1 (MQ=255) aGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATg > 1:350721/1‑186 (MQ=255) aGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAAGAGTTCGTTGGTTTCGt > 1:639359/1‑251 (MQ=255) aGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGa > 1:510546/1‑118 (MQ=255) aGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGAc > 1:506791/1‑198 (MQ=255) aGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAagag > 1:182231/1‑214 (MQ=255) aGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAag < 1:346978/212‑1 (MQ=255) gTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAAGAGTTCGTTGGTTTCGTTACGTTTTTGATATTCGCCGGAAtt > 1:689384/1‑251 (MQ=255) gAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAag > 1:51547/1‑198 (MQ=255) gAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAAGAGTTCGTTGGTTTCGTTACGTTTTTGATATTCGCCGGAATTAAGTTCTTCGa < 1:779767/250‑1 (MQ=255) gAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAAGAGTTCGTTGGTTTCGTTACGTTTTTGATATTCGCCGGAATTAAGTTCTTCGa < 1:862563/250‑1 (MQ=255) tttGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAAGAGTTCGTTGGTTTCGTTACGTTTTTGATATTCGCCGGAATTAAGTTCTTCGAAGCGCGCCATACggg < 1:102029/251‑1 (MQ=255) ttGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAAGAGTTCGTTGGTTTCGTTACGTTTTTGATATTCGCCGGAATTAAGTTCTTCGAAGCGCGCCATACggg > 1:555638/1‑250 (MQ=255) ttGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAAGAGTTCGTTGGTTTCGTTACGTTTTTGATATTCGCCGGAATTAAGTTCTTCGAAGCGCGCCATACGGgc < 1:699053/251‑1 (MQ=255) gCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCGAATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAAGAGTTCGTTGGTTTCGTTACGTTTTTGATATTCGCCGGAATTAAGTTCTTCGAAGCGCGCCATACGGgc > 1:20790/1‑242 (MQ=255) gCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGAc > 1:357479/1‑159 (MQ=255) gCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAAGAGTTCGTTGGTTTCGTTACGTTTTTGATATTCGCCGGAATTAAGTTCTTCGAAGCGCGCCATACGGgct > 1:295535/1‑242 (MQ=255) gCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGCTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAAGAGTTCGTTGGTTTCGTTACGTTTTTGATATTCGCCGGAATTAAGt > 1:723565/1‑218 (MQ=255) aTACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAAGAGTTCGTTGGTTTCGTTACGTTTTTGATATTCGCCGGAATTAAGTTCTTCGAAGCGCGCCATACGGGCTTTGCTTTTCg > 1:278072/1‑250 (MQ=255) aCGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAAGAGTTCGTTGGTTTCGTTa < 1:168514/187‑1 (MQ=255) agGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAAt < 1:826689/112‑1 (MQ=255) agGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATg > 1:112521/1‑113 (MQ=255) gggTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAAGAGTTCGTTGGTTTCGTTACGTTTTTGATATTCGCCGGAATTAAGTTCTTCGAAGCGCGCCATACGGGCTTTGCTTTTCGCTTggcggc > 1:176845/1‑249 (MQ=255) ggATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAAGAGTTCGTTGGTTTCGTTACGTTTTTGATATTCGcc < 1:736688/192‑1 (MQ=255) ggATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAAGAGTTCGTTGGTTTCGTTACGTTTTTGATATTCGCCGGAATTAAGTTCTTCGAAGCGCGCCATAc < 1:530912/221‑1 (MQ=255) tACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAAGAGTTCGTTGGTTTCGTTACGTTTTTGATATTCGCCGGAATTAAGTTCTTCGAAGCGCGCCATACGGGCTTTGCTTTTCGCTTGGCGGCCTTTCGGAttt > 1:623471/1‑251 (MQ=255) ccGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGac < 1:450753/84‑1 (MQ=255) ccGTTGGCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAAGAGTTCGTTGGTTTCGTTACGTTTTTGATATTCGCCGGAATTAAGTTCTTCGAAGCGCGCCATACGGGCTTTGCTTTTCGCTTGGCGGCCTTTCGGATTTTGACGCa > 1:109859/1‑250 (MQ=255) ggCACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAAGAGTTCGTTGGTTTCGTTACGTTTTTGATATTCGCCGGAATTAAGTTCTTCGAAGCGCGCCATACGGGCTTTGCTTTTCGCTTGGCGGCCTTTCGGATTTTGACGCACCCAtt > 1:392189/1‑251 (MQ=255) cACCGATAATGCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAAGAGTTCGTTGGTTTCGTTACGTTTTTGATATTCGCCGGAATTAAGTTCTTCGAAGCGCGCCATACGGGCTTTGCTTTTCGCTTGGCGGCCTTTCGGATTTTGACGCACCCATTcc < 1:506369/251‑1 (MQ=255) ataatgCCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAAGAGTTCGTTGGTTTCGTTACGTTTTTGATATTCGCCGGAATTAAGTTCTTCGAAGCGCGCCATACGGGCTTTGCTTTTCGCTTGGCGGCCTTTCGGATTTTGACGCACCCATTCCAAttc < 1:849859/251‑1 (MQ=255) | CCTTTGAAGTTGAAGCGTCCTACATAAGCACGGCTTGGGATTTCAAAGTTACCGATGGTTAGAATATCTTGTCCGTTGGACACTTCTTCCCACACGG‑TTTTTTTTTCGTCCATAGCATCACGGAATTGATACACGGAAGCTAACACGACGGTTTCGCCCAAGGTAATGGTACCGGAATCTGGTTTTTCTTTGCCGGAAAGCATACGGAAGAGGGTGGATTTACCCGCGCCGTTGGCACCGATAATACCGACAATGGCACCTTTCGGAATGCTGAAGGATAAATCGTCG‑ATTAAAGTGCGGTCGCCGTAGGACTTACTTAAATGTTGCACCTCGATGACTTTTTCGCCCAGGCGTGGACCGGGTGGAATAAAGAGTTCGTTGGTTTCGTTACGTTTTTGATATTCGCCGGAATTAAGTTCTTCGAAGCGCGCCATACGGGCTTTGCTTTTCGCTTGGCGGCCTTTCGGATTTTGACGCACCCATTCCAATTC > 1/616166‑616656 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |