| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 614,240 | G→A | P23P (CCC→CCT) | unknown ← | DNA topoisomerase IV subunit B (EC 5.99.1.3) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 614,240 | 0 | G | A | 100.0% | 214.4 / NA | 77 | P23P (CCC→CCT) | unknown | DNA topoisomerase IV subunit B (EC 5.99.1.3) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (39/38); total (39/38) | |||||||||||
TAGTTTTTATTGGAGAATTTACCGCCGGCGTGCAATTTACTCATGATCACTTCCACACCGGAAACTTTTTCCACCGGGTGAATATCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCGGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGATTTGGCAAAAAGTGCGGTCGTTTTGGCAGGTGTTTTATTTTTTTGAGTAATGGCTCGTGTGGTGATAGCTTTAAAAAAGGTCTCGGCAGGTAA > 1/613995‑614486 | tAGTTTTTATTGGAGAATTTACCGCCGGCGTGCAATTTACTCATGATCACTTCCACACCGGAAACTTTTTCCACCGGGTGAATATCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGAc < 1:736368/250‑1 (MQ=255)tAGTTTTTATTGGAGAATTTACCGCCGGCGTGCAATTTACTCATGATCACTTCCACACCGGAAACTTTTTCCACCGGGTGAATATCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAAGGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTGCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGAc < 1:56753/250‑1 (MQ=255) ggAGAATTTACCGCCGGCGTGCAATTTACTCATGATCACTTCCACACCGGAAACTTTTTCCACCGGGTGAATATCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGAc > 1:782506/1‑249 (MQ=255) agaATTTACCGCCGGCGTGCAATTTACTCATGATCACTTCCACACCGGAAACTTTTTCCACCGGGTGAATATCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAgg < 1:655289/250‑1 (MQ=255) gaATTTACCGCCGGCGTGCAATTTACTCATGATCACTTCCACACCGGAAACTTTTTCCACCGGGTGAATATCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGtt > 1:58852/1‑251 (MQ=255) aaTTTACCGCCGGCGTGCAATTTACTCATGATCACTTCCACACCGGAAACTTTTTCCACCGGGTGAATATCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGtt < 1:485125/250‑1 (MQ=255) tACCGCCGGCGTGCAATTTACTCATGATCACTTCCACACCGGAAACTTTTTCCACCGGGTGAATATCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAgg < 1:544165/251‑1 (MQ=255) aTTTACTCATGATCACTTCCACACCGGAAACTTTTTCCACCGGGTGAATATCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAgg > 1:512262/1‑229 (MQ=255) cTCATGATCACTTCCACACCGGAAACTTTTTCCACCGGGTGAATATCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAAttt > 1:900233/1‑250 (MQ=255) cTCATGATCACTTCCACACCGGAAACTTTTTCCACCGGGTGAATATCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTc < 1:559311/251‑1 (MQ=255) cATGATCACTTCCACACCGGAAACTTTTTCCACCGGGTGAATATCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGt > 1:553723/1‑251 (MQ=255) cTTCCACACCGGAAACTTTTTCCACCGGGTGAATATCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGAc > 1:259364/1‑201 (MQ=255) cTTCCACACCGGAAACTTTTTCCACCGGGTGAATATCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTaaaa > 1:320948/1‑231 (MQ=255) cTTCCACACCGGAAACTTTTTCCACCGGGTGAATATCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGaa > 1:73227/1‑251 (MQ=255) gAAACTTTTTCCACCGGGTGAATATCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTg < 1:497340/250‑1 (MQ=255) cTTTTTCCACCGGGTGAATATCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGaat < 1:534158/237‑1 (MQ=255) tttCCACCGGGTGAATATCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATg < 1:555717/251‑1 (MQ=255) tttCCACCGGGTGAATATCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATg < 1:802541/251‑1 (MQ=255) gggTGAATATCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATggg > 1:285414/1‑245 (MQ=255) ggTGAATATCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGc > 1:91249/1‑176 (MQ=255) ggTGAATATCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATg > 1:662260/1‑242 (MQ=255) atCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATg < 1:723238/235‑1 (MQ=255) atCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAAt < 1:117328/251‑1 (MQ=255) tCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAAt > 1:371148/1‑250 (MQ=255) tCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATaaa < 1:674290/238‑1 (MQ=255) tCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCaaa > 1:584998/1‑251 (MQ=255) cccGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAg > 1:431744/1‑167 (MQ=255) cgTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTg < 1:622628/250‑1 (MQ=255) cgTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTg < 1:345904/250‑1 (MQ=255) tCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTgcg > 1:175953/1‑250 (MQ=255) aTCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTaa < 1:357947/179‑1 (MQ=255) aTCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGAtt > 1:689160/1‑251 (MQ=255) tGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGc < 1:849777/251‑1 (MQ=255) cTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGtt > 1:205678/1‑150 (MQ=255) tcactGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCaaaaa > 1:288487/5‑251 (MQ=255) tCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATggg > 1:250744/1‑203 (MQ=255) cAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCaaaaaa > 1:151966/1‑251 (MQ=255) cAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGCGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGc > 1:32114/1‑245 (MQ=255) ggATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAAtt < 1:290366/204‑1 (MQ=255) gtgCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATg > 1:342487/1‑184 (MQ=255) gtgCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGt < 1:504140/187‑1 (MQ=255) gtgCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAg > 1:231020/1‑228 (MQ=255) tCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAGTTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATgg < 1:538808/251‑1 (MQ=255) tCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAaac < 1:792714/223‑1 (MQ=255) tCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATgg < 1:781951/251‑1 (MQ=255) aaTTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGAt < 1:781371/251‑1 (MQ=255) aaaCCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGAc > 1:582829/1‑98 (MQ=255) aaaCCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGATTTGGCAAAAAGTg < 1:771497/251‑1 (MQ=255) ggCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATgg > 1:192846/1‑231 (MQ=255) cTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATgg > 1:303492/1‑212 (MQ=255) cTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGAt < 1:694613/214‑1 (MQ=255) cTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGATTTGGCAAAAAGTGCGGTCGTTTTGGCAGGTGTTTTAt > 1:366045/1‑251 (MQ=255) tGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGATTTGGCAAAAAGTGCGGTCGTTTTGGCAGGTGTTTTAtt < 1:221874/251‑1 (MQ=255) gTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATgg < 1:52647/210‑1 (MQ=255) gTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGAt > 1:18917/1‑212 (MQ=255) gTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGATTTGGCAAAAAGTGCGGTCGTTTTGGCAGGTGTTTTAttt > 1:299281/1‑251 (MQ=255) aTCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATgg < 1:508889/207‑1 (MQ=255) aTCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGATTTGGCa > 1:297291/1‑215 (MQ=255) tcttGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGATTTGGCAAAAAGTGCGGTCGTTTTGGCAGGTGTTTTATTTTTTTGAGTAATgg < 1:792056/251‑1 (MQ=255) ttGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGATTTGGCAAAAAGTGCGGTCGTTTTGGCAGGTGTTTTATTTTTTTGAGTAATGGCt < 1:163708/251‑1 (MQ=255) aTGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGATTTGGCAAAAAGTGCGGTCGTTTTGGCAGGTGTTTTATTTTTTTGAGTAATGGCTCGTgtgg < 1:122955/249‑1 (MQ=255) aTGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGATTTGGCAAAAAGTGCGGTCGTTTTGGCAGGTGTTTTATTTTTTTGAGTAATGGCTCGTgtgg < 1:294286/249‑1 (MQ=255) gTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGATTTGGCAAAAAGTGCGGTCGTTTTGGCAGGTGTTTTAt < 1:376053/222‑1 (MQ=255) gTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGATTTGGCAAAAAGTGCGGTCGTTTTGGCAGGTGTTTTATTTTTTTGAGTAATGGCTCGTGTGGTGATa > 1:176968/1‑251 (MQ=255) gggcgggTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGATTTGGCAAAAAGTGCGGTCGTTTTGGCAGGTGTTTTATTTTTTTGAGTAATGGCTCGTgtggtggt > 1:102483/1‑244 (MQ=255) ggcgggTGGTGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGATTTGGCAAAAAGTGCGGTCGTTTTGGCAGGTGTTTTATTTTTTTGAGTAATGGCTCGTGTGGTGATAGCttt > 1:895261/1‑251 (MQ=255) ggtggtGTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGAt < 1:251204/133‑1 (MQ=255) tggtgTCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGATTTGGCAAAAAGTGCGGTCGTTTTGGCAGGTGTTTTATTTTTTTGAGTAATGGCTCGTGTGGTGATAGCTTTaaaaa < 1:474481/250‑1 (MQ=255) gtCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGATTTGGCAAAAAGTGCGGTCGTTTTGGCAGGTGTTTTATTTTTTTGAGTAATGGCTCGTGTGGTGATAGCTTTAAAAAAGGt > 1:722198/1‑250 (MQ=255) gtCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGATTTGGCAAAAAGTGCGGTCGTTTTGGCAGGTGTTTTATTTTTTTGAGTAATGGCTCGTGTGGTGATAGCTTTAAAAAAGGt > 1:365837/1‑250 (MQ=255) tCCGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGATTTGGCAAAAAGTGCGGTCGTTTTGGc < 1:279219/195‑1 (MQ=255) ccGTGTACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAg > 1:179402/1‑130 (MQ=255) gtgtACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGATTTGGCAAAAAGTGCGGTCGTTTTGGCAGGTGTTTTATTTTTTTGAGTAATGGCt > 1:656714/1‑220 (MQ=255) gtACATGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGGGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAAt > 1:748612/1‑160 (MQ=255) tGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGATTTGGCAAAAAGTGCGGTCGTTTTGGCAGGTGTTTTATTTTTTTGAGTAATGGCTCGTGTGGTGATAGc < 1:372645/227‑1 (MQ=255) tGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGATTTGGCAAAAAGTGCGGTCGTTTTGGCAGGTGTTTTATTTTTTTGAGTAATGGCTCGTGTGGTGATAGCTTTAAAAAAGGTCTCGGc < 1:141711/245‑1 (MQ=255) tGCCAGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGATTTGGCAAAAAGTGCGGTCGTTTTGGCAGGTGTTTTATTTTTTTGAGTAATGGCTCGTGTGGTGATAGCTTTAAAAAAGGTCTCGGCAGGTaa > 1:577372/1‑251 (MQ=255) | TAGTTTTTATTGGAGAATTTACCGCCGGCGTGCAATTTACTCATGATCACTTCCACACCGGAAACTTTTTCCACCGGGTGAATATCCACCGGCATCCCGCGTCCGTTATCAATGACTTCAATGGATTGGTCTTTGTGCAAAATCACTTCAATTTTGGTGGCAAAACCGGCAAGAGCTTCGTCCACGCTGTTATCGATAACTTCTTGTGCAAGATGGTTCGGGCGGGTGGTGTCCGTGTACATGCCGGGACGCAGCTGGACAGGTTCGAGGTCTTTTAAAACGGTAATTTCGTTGGCGGAATAATTCGTTGTCATAATGGGTTAATTCATAAAATCGGGAAGCAAAATTGCGCGGGATTATAGCAAAAAACAACGGAATTTTTAACCGCACTTTAATGGATTTGGCAAAAAGTGCGGTCGTTTTGGCAGGTGTTTTATTTTTTTGAGTAATGGCTCGTGTGGTGATAGCTTTAAAAAAGGTCTCGGCAGGTAA > 1/613995‑614486 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |