| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 604,869 | A→G | I227M (ATA→ATG) | unknown → | Glycosyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 604,869 | 0 | A | G | 100.0% | 177.7 / NA | 61 | I227M (ATA→ATG) | unknown | Glycosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (29/32); total (29/32) | |||||||||||
ATATTATAACATTTTAAAAAAGATGAATATTAACGTTGTTCCTAACCATGCAGATTATCGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATAGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTGTTAGTTTAATTTCACTGGCAATGGGAGGATGGGCACTAATTATAAAAATTTTTGGCAGTGGTATAGTACCCGGATGGGCGTCTACTGTTGTGCCTATGTATTTTTTAGGCGGTGTGCAACTTTTTACTTTAGGTATTATAGGTATCTATATTAGTAAAATATTCGAT > 1/604635‑605097 | atattataACATTTTAAAAAAGATGAATATTAACGTTGTTCCTAACCATGCAGATTATCGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGAt < 1:64791/251‑1 (MQ=255) tataACATTTTAAAAAAGATGAATATTAACGTTGTTCCTAACCATGCAGATTATCGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAg < 1:672307/251‑1 (MQ=255) aaCATTTTAAAAAAGATGAATATTAACGTTGTTCCTAACCATGCAGATTATCGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGc < 1:820782/251‑1 (MQ=255) aaCATTTTAAAAAAGATGAATATTAACGTTGTTCCTAACCATGCAGATTATCGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGc < 1:508766/251‑1 (MQ=255) tatTAACGTTGTTCCTAACCATGCAGATTATCGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATAtgtg > 1:473899/1‑221 (MQ=255) atTAACGTTGTTCCTAACCATGCAGATTATCGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGat < 1:30283/215‑1 (MQ=255) aCGTTGTTCCTAACCATGCAGATTATCGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATgg > 1:207679/1‑251 (MQ=255) gttCCTAACCATGCAGATTATCGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGAt < 1:234519/201‑1 (MQ=255) gttCCTAACCATGCAGATTATCGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGAt < 1:294143/201‑1 (MQ=255) gttCCTAACCATGCAGATTATCGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATGTGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAgg > 1:356583/1‑251 (MQ=255) gttCCTAACCATGCAGATTATCGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATAtgtg > 1:156081/1‑211 (MQ=255) gttCCTAACCATGCAGATTATCGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGAttt < 1:477375/216‑1 (MQ=255) gttCCTAACCATGCAGATTATCGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTttatta > 1:166954/1‑234 (MQ=255) gttCCTAACCATGCAGATTATCGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTAtatta > 1:274099/1‑243 (MQ=255) gttCCTAACCATGCAGATTATCGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATgg > 1:562000/1‑246 (MQ=255) ttCCTAACCATGCAGATTATCGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGt > 1:583176/1‑251 (MQ=255) tCCTAACCATGCAGATTATCGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTttatta > 1:726422/1‑232 (MQ=255) aCCATGCAGATTATCGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGata < 1:470089/200‑1 (MQ=255) ccATGCAGATTATCGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTg < 1:156037/251‑1 (MQ=255) tGCAGATTATCGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGAtt < 1:204354/204‑1 (MQ=255) gATTATCGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGata < 1:261249/192‑1 (MQ=255) cGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATgg > 1:377195/1‑225 (MQ=255) cGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGta < 1:220896/232‑1 (MQ=255) gTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATgg > 1:309385/1‑215 (MQ=255) gTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATgg > 1:395531/1‑215 (MQ=255) cTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGAt < 1:369077/167‑1 (MQ=255) gTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTGTTAGTTTAATTTCACTGGCAATGGGAGGATGGGCa > 1:118554/1‑250 (MQ=255) gCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATAtgtg > 1:529404/1‑163 (MQ=255) ggAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGat < 1:619107/153‑1 (MQ=255) gTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTGTTAGTTTAATTTCACTGGCAATggg > 1:340036/1‑226 (MQ=255) gTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTGTTAGTTTAATTTCACTGGCAATGGGAGGATGGGCACTAATTATAAAAAtt > 1:663900/1‑251 (MQ=255) aaTTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGta < 1:222250/181‑1 (MQ=255) atttatttCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGtat < 1:20849/181‑1 (MQ=255) tttatttCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTGTTAGTTTAATTTCACTGGCAATGGGAGGATGGGCACTAATTATAAAAATTTTTGGCAGTGGTATAg < 1:169806/251‑1 (MQ=255) tatttCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTGTTAGTTTAATTTCACTGGCAATGGGAGGATGGGCACTAATTATAAAAATTTTTGGCAGTGGTATAGTa < 1:800997/251‑1 (MQ=255) atttCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTGTTAGTTTAATTTCACTGGCAATGGGAGGATGGGCACTAATTATAAAAATTTTTGGCAGTGGTATAGTAc < 1:695216/251‑1 (MQ=255) gTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGAt > 1:359720/1‑113 (MQ=255) gTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGata > 1:496106/1‑119 (MQ=255) gTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATgg > 1:278037/1‑158 (MQ=255) gTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTGTTAGTTTAATTTCACTGGCAATGGGAGGATGGGCACTAATTATAAAAATTTTTGGCAGTGGTATAGTACCCGGa < 1:522120/245‑1 (MQ=255) gTATTGGTTCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGATGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTGTTAGTTTAATTTCACTGGCAATGGGAGGATGGGCACTAATTATAAAAATTTTTGGCAGTGGTATAGTACCCGGATGGGCg > 1:769128/1‑251 (MQ=255) cTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGAtt < 1:300838/116‑1 (MQ=255) cTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTGTTAGTTTAATTTCACTGGCAATGGGAGGATGGGCACTAATTATAAAAATTTTTGGCAGTGGTATAGTACCCGGATGGGCGTCTACtgttgt > 1:870533/1‑251 (MQ=255) tactacAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTGTTAGTTTAATTTCACTGGCAATGGGAGGATGGGCACTAATTATAAAAATTTTTGGCAGTGGTATAGTACCCGGATGGGCGTCTACTGTTGTGCCTATGTATTTTTTAg > 1:252982/1‑251 (MQ=255) acAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAgg > 1:495758/1‑131 (MQ=255) gTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGa > 1:703629/1‑82 (MQ=255) gTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTg > 1:39432/1‑136 (MQ=255) ttattaTGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTGTTAGTTTAATTTCACTGGCAATGGGAGGATGGGCACTAATTATAAAAATTTTTGGCAGTGGTATAGTACCCGGATGGGCGTCTACTGTTGTGCCTATGTATTTTTTAGGCGGtgtg > 1:274621/1‑250 (MQ=255) tCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTGTTAGTTTAATTTCACTGGCAATGGGAGGATGGGCACTAATTATAAAAATTTTTGGCAGTGGTATAGTAccc < 1:63138/182‑1 (MQ=255) tCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTGTTAGTTTAATTTCACTGGCAATGGGAGGATGGGCACTAATTATAAAAATTTTTGGCAGTGGTATAGTACCCGGATGGGCGTCTACTGTTGTGCCTATGTATTTTTTAGGCGGtgtg > 1:436760/1‑227 (MQ=255) ccGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTGTTAGTTTAATTTCACTGGCAATGGGAGGATGGGCACTAATTATAAAAATTTTTGGCAGTGGTATAGTACCCGGATGGGCGTCTACTGTTGTGCCTATGTATTTTTTAGGCGGTGTGCAACTTTTTACTTTAGGTATTATAgg < 1:749906/250‑1 (MQ=255) gATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTGTTAGTTTAATTTCACTGGCAATGGGAGGATGGGCACTAATTATAAAAATTTTTGGCAGTGGTATAGTACCCGGATGGGCGTCTACTGTTGTGCCTATGTATTTTTTAGGCGGTGTGCAACTTTTTACTTTAGGTATTATAgg < 1:550568/247‑1 (MQ=255) tAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTGTTAGTTTAATTTCACTGGCAATGGGAGGATGGGCACTAATTATAAAAATTTTTGGCAGTGGTATAGTACCCGGATGGGCGTCTACTGTTGTGCCTATGTATTTTTTAGGCGGTGTGCAACTTTTTACTTTAGGTATTATAGGTATCtata < 1:111509/251‑1 (MQ=255) gTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTGTTAGTTTAATTTCACTGGCAATGGGAGGATGGGCACTAATTATAAAAATTTTTGGCAGTGGTATAGTACCCGGATGGGCGTCTACTGTTGTGCCTATGTATTTTTTAGGCGGTGTGCAACTTTTTACTTTAGGTATTATAGGTATCTATAtt > 1:466000/1‑251 (MQ=255) tAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTGTTAGTTTAATTTCACTGGCAATGGGAGGATGGGCACTAATTATAAAAATTTTTGGCAGTGGTATAGTACCCGGATGGGCGTCTACTGTTGTGCCTATGTATTTTTTAGGCGGTGTGCAACTTTTTACTTTAGGTATTATAGGTATCTatat < 1:666660/249‑1 (MQ=255) atatAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGAt < 1:211225/50‑1 (MQ=255) atatAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTc < 1:678654/62‑1 (MQ=255) cTCGTATGATGCGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTGTTAGTTTAATTTCACTGGCAATGGGAGGATGGGCACTAATTATAAAAATTTTTGGCAGTGGTATAGTACCCGGATGGGCGTCTACTGTTGTGCCTATGTATTTTTTAGGCGGTGTGCAACTTTTTACTTTAGGTATTATAGGTATCTATATTAGTAAAATATTCGAt > 1:324412/1‑251 (MQ=255) cGTTTAGCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGtt < 1:9609/62‑1 (MQ=255) gCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTGTTAGTTTAATTTCACTGGCAATGGGAGGATGGGCACTAATTATAAAAATTTTTGGCAGTGGTATAGTACCCGGATGGGCGTCTACTGTTGTGCCTATGTAtttt < 1:153735/171‑1 (MQ=255) gCCATGGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTGTTAGTTTAATTTCACTGGCAATGGGAGGATGGGCACTAATTATAAAAATTTTTGGCAGTGGTATAGTACCCGGATGGGCGTCTACTGTTGTGCCTATGTAt < 1:886593/168‑1 (MQ=255) | ATATTATAACATTTTAAAAAAGATGAATATTAACGTTGTTCCTAACCATGCAGATTATCGTCTAATGAGTGCTAGAGCTTTGTCTGCTTTGGAATGTTTTAGGGAAAGTAATTTATTTCTTCGCGGTATTGTTCCACTTTTAGGATTTTCAAGTACTACAGTTTATTATGCACGTGAAGAAAGGATCGCCGGATTTAGTAAATATAGCATTCCTCGTATGATGCGTTTAGCCATAGATGGGATATGTGGATTTAGTGCAATTCCTTTATTATTTATATTATGGTTAGGTATTATTGTTAGTTTAATTTCACTGGCAATGGGAGGATGGGCACTAATTATAAAAATTTTTGGCAGTGGTATAGTACCCGGATGGGCGTCTACTGTTGTGCCTATGTATTTTTTAGGCGGTGTGCAACTTTTTACTTTAGGTATTATAGGTATCTATATTAGTAAAATATTCGAT > 1/604635‑605097 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |