| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 587,795 | T→G | L329F (TTA→TTC) | unknown ← | DNA gyrase subunit A (EC 5.99.1.3) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 587,795 | 0 | T | G | 100.0% | 225.4 / NA | 82 | L329F (TTA→TTC) | unknown | DNA gyrase subunit A (EC 5.99.1.3) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (55/27); total (55/27) | |||||||||||
ATTCACGTTTGGCGTTTTCCGGATTTGGTGCTTTGCGGATTAATTCGATAATCGGATCGACGTTTGCCAAGGCAATCGCCAAGCCTTCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCTAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGATGAGTTTCGCTTTGTTCACTTGATACGGAATTTCGTTCACGATGATGCTTTCACGGCCTTTTTCATCGGTTTCGATT > 1/587557‑588041 | aTTCACGTTTGGCGTTTTCCGGATTTGGTGCTTTGCGGATTAATTCGATAATCGGATCGACGTTTGCCAAGGCAATCGCCAAGCCTTCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTg > 1:683376/1‑250 (MQ=255) ttttCCGGATTTGGTGCTTTGCGGATTAATTCGATAATCGGATCGACGTTTGCCAAGGCAATCGCCAAGCCTTCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACg < 1:83103/250‑1 (MQ=255) tGCTTTGCGGATTAATTCGATAATCGGATCGACGTTTGCCAAGGCAATCGCCAAGCCTTCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTAttt < 1:809365/250‑1 (MQ=255) tGCTTTGCGGATTAATTCGATAATCGGATCGACGTTTGCCAAGGCAATCGCCAAGCCTTCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTa < 1:842430/251‑1 (MQ=255) gCTTTGCGGATTAATTCGATAATCGGATCGACGTTTGCCAAGGCAATCGCCAAGCCTTCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAgg > 1:557296/1‑243 (MQ=255) gCTTTGCGGATTAATTCGATAATCGGATCGACGTTTGCCAAGGCAATCGCCAAGCCTTCTAAGATGTGCGTACGGTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGt < 1:425390/244‑1 (MQ=255) cGATAATCGGATCGACGTTTGCCAAGGCAATCGCCAAGCCTTCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGAc > 1:50328/1‑250 (MQ=255) aCGTTTGCCAAGGCAATCGCCAAGCCTTCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGAt > 1:820761/1‑251 (MQ=255) tGCCAAGGCAATCGCCAAGCCTTCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGa > 1:256619/1‑251 (MQ=255) aaGGCAATCGCCAAGCCTTCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGAc < 1:17556/251‑1 (MQ=255) cAAGCCTTCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATAc < 1:335492/251‑1 (MQ=255) cAAGCCTTCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATAc < 1:824266/251‑1 (MQ=255) cAAGCCTTCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATAc < 1:847640/251‑1 (MQ=255) gCCTTCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAacac < 1:850855/201‑1 (MQ=255) gCCTTCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGt > 1:112181/1‑251 (MQ=255) ccTTCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTAttt > 1:639788/1‑195 (MQ=255) ccTTCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCg < 1:892918/249‑1 (MQ=255) ccTTCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCg < 1:6852/249‑1 (MQ=255) ccTTCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGt > 1:342665/1‑250 (MQ=255) cTTCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGt > 1:524634/1‑249 (MQ=255) cTTCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGt > 1:35010/1‑249 (MQ=255) cTTCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCt < 1:387576/251‑1 (MQ=255) tCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTa > 1:869833/1‑193 (MQ=255) tCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCttt > 1:348317/1‑251 (MQ=255) tgtgCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGAt < 1:835593/251‑1 (MQ=255) gtgCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTtgtg < 1:706393/164‑1 (MQ=255) ttCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCa > 1:164050/1‑251 (MQ=255) tGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATc < 1:147982/251‑1 (MQ=255) tGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATc < 1:811395/251‑1 (MQ=255) gCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTtgt > 1:475562/1‑142 (MQ=255) aTCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAAttttttt > 1:478910/1‑251 (MQ=255) tCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATAc > 1:704688/1‑201 (MQ=255) tCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATcg < 1:620898/221‑1 (MQ=255) tCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATc > 1:617920/1‑236 (MQ=255) tCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTg > 1:493456/1‑251 (MQ=255) tCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTg > 1:200110/1‑251 (MQ=255) gTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGt > 1:334033/1‑250 (MQ=255) tACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAgg < 1:729822/140‑1 (MQ=255) ggTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGa > 1:901709/1‑251 (MQ=255) ggTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGCTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGa > 1:502206/1‑251 (MQ=255) tCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATc > 1:814126/1‑224 (MQ=255) ccacTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCg > 1:318713/1‑251 (MQ=255) cggcggTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGAtt > 1:197406/1‑159 (MQ=255) cggcggTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAAtttt < 1:718967/251‑1 (MQ=255) ggTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAgg > 1:583159/1‑116 (MQ=255) gtgtAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTa < 1:101946/122‑1 (MQ=255) gtgtAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGa > 1:518213/1‑251 (MQ=255) gtgtAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGa > 1:860942/1‑251 (MQ=255) gtgtAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGa > 1:263060/1‑251 (MQ=255) gtgtAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGACAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGa > 1:90408/1‑251 (MQ=255) gtAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGATg > 1:824068/1‑251 (MQ=255) aaTACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGATGAg > 1:540146/1‑251 (MQ=255) aTACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGa < 1:891024/201‑1 (MQ=255) aCGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGATGAGttt > 1:643290/1‑251 (MQ=255) cGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAac > 1:638276/1‑112 (MQ=255) cGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGATGAGTTTCGCtt > 1:462205/1‑251 (MQ=255) ccTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCg > 1:776015/1‑161 (MQ=255) ccTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCAGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGATGAGTTTCGCtt > 1:437549/1‑249 (MQ=255) tCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAAcacc < 1:674513/111‑1 (MQ=255) tCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGtt < 1:663250/133‑1 (MQ=255) aaTGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGATGAGTTTCGCTTTGTTCa > 1:343646/1‑251 (MQ=255) aTGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTa > 1:314125/1‑103 (MQ=255) gTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGATGAGTTTCGCTTTGTTCACTTGATa > 1:58865/1‑250 (MQ=255) gTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTCTCGATGAGTTTCGCTTTGTTc > 1:129119/1‑242 (MQ=255) gTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATACGCATAc > 1:299004/1‑147 (MQ=255) tttAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGATGAGTTTCGCTTTGTTCACTTGATACgg < 1:537160/251‑1 (MQ=255) aaaTTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTCTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGATGAGTTTCGCTTTGTTCACTTGATACGGAAt < 1:597785/251‑1 (MQ=255) aTTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGATGAGTTTCGCt > 1:248880/1‑229 (MQ=255) cAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGATGAGTTTCGCTTTGTTCACTTGATACGGAATTTCGt > 1:188314/1‑251 (MQ=255) aGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATAc > 1:482223/1‑133 (MQ=255) tttGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGATGAGTTTCGCTTTGTTCACTTGATACGGAATTTCGTTCACg < 1:339530/250‑1 (MQ=255) gTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGATGAGTTTCGCTTTGTTCACTTGATACGGAATTTCGTTCACGATGATGCTTTCa > 1:753807/1‑250 (MQ=255) tGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGATGAGTTTCGCTTTGTTCACTTGATACGGAATTTCGTTCACGATGATGCTTTCACg > 1:554331/1‑251 (MQ=255) ggTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTc > 1:610623/1‑127 (MQ=255) ggTCAAGTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGATGAGTTTCGCTTTGTTCACTTGATACGGAATTTCGTTCACGATGATGCTTTCACgg > 1:611295/1‑251 (MQ=255) gTGCGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGATGAGTTTCGCTTTGTTCACTTGATACGGAATTTCGTTCACGATGATGCTTTCACGGCCtttt > 1:358680/1‑251 (MQ=255) cGACAATATTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGATGAGTTTCGCTTTGTTCACTTGATACGGAATTTCGTTCACGATGATGCTTTc > 1:118656/1‑238 (MQ=255) atatTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGATGAGTTTCGCTTTGTTCACTTGATACGGAATTTCGTTCACGATGATGCTTTCACGGCCTTTTTCATCGGt > 1:457262/1‑251 (MQ=255) atatTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGATGAGTTTCGCTTTGTTCACTTGATACGGAATTTCGTTCACGATGATGCTTTCACGGCCTTTTTCATCGGt > 1:48819/1‑251 (MQ=255) tatTAATCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGATGAGTTTCGCTTTGTTCACTTGATACGGAATTTCGTTCACGATGATGCTTTCACGGCCTTTTTCATCGGtt > 1:607889/1‑251 (MQ=255) aTCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATCTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGATGAGTTTCGCTTTGTTCACTTGATACGGAATTTCGTTc < 1:423160/213‑1 (MQ=255) tCCCGAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGATGAGTTTCGCTTTGTTCACTTGATACGGAATTTCGTTCACGATGATGCTTTCACGGCCTTTTTCATCGGTTTCGAtt > 1:17437/1‑251 (MQ=255) | ATTCACGTTTGGCGTTTTCCGGATTTGGTGCTTTGCGGATTAATTCGATAATCGGATCGACGTTTGCCAAGGCAATCGCCAAGCCTTCTAAGATGTGCGTACGTTCACGGGCTTTGCGTAATTCAAAAATCGTACGACGGGTCACCACTTCGCGGCGGTGTAATACGAACGCCTCAATGAGCTGTTTTAAATTCAATAGTTTGGGCTGACCGTGGTCAAGTGCGACAATATTAATCCCTAAAGTGACTTGCATTTGTGTCAACGCATACAGGTTATTTAACACCACTTCGCCGACCGCATCACGTTTGATTTCGATGACGATGCGCATACCGTCTTTGTCGGATTCATCGCGCAACCCGCTGATCCCCTCAATTTTTTTGTCTTTGACGAAATCGGCAATTTTTTCGATGAGTTTCGCTTTGTTCACTTGATACGGAATTTCGTTCACGATGATGCTTTCACGGCCTTTTTCATCGGTTTCGATT > 1/587557‑588041 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |