| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 581,414 | G→A | S125N (AGC→AAC) | unknown → | SSU ribosomal protein S1p |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 581,414 | 0 | G | A | 96.5% | 145.0 / NA | 59 | S125N (AGC→AAC) | unknown | SSU ribosomal protein S1p |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (29/27); minor base C (0/2); total (29/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.91e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AAATCCGAATCAGCTATTCCTGCCGAAGAATTTTTTAATGCACAAGGTGAATTGGAAGTTCAAGTGGGTGATGTTGTTGATGTCGTGCTTAAAGCGGTGGATGACGGTTTCGGTGAAACTGTAGCTTCCCGTGCTGATGCAAAACGCAACGAAGCTTGGATTGTATTGGAAAAAGCATACGACGAACAAGCGACTGTTCTTGGTTTGGTTAACGGTAAAGTTAAAGGTGGCTTCACAGTTGAGTTAAGCGGTGTTCGCGCATTCTTACCGGGTTCATTGGTTGATACCCGTCCTGTTCGTGATGCAGATCACTTACTTGGCAAAGAATTAGAATTCAAAGTAATCAAACTTGATCAAAAACGTAACAACGTTGTTGTTTCCCGCCGTGCCGTTATCGAATCCGAAAGCAGCCAAGATCGCGAAG‑AAGTATTGGCGAACTTGTCTGAAGGTGCAGAAGTTAAAGGTACCGTTAAAAACTTAAC > 1/581167‑581648 | aaaTCCGAATCAGCTATTCCTGCCGAAGAATTTTTTAATGCACAAGGTGAATTGGAAGTTCAAGTGGGTGATGTTGTTGATGTCGTGCTTAAAGTGGTGGATGACGGTTTCGGTGAAACTGTAGCTTCCCGTGCTGATGCAAAACGCAACGAAGCTTGGATTGTATTGGAAAAAGCATACGACGAACAAGCGACTGTTCTTGGTTTGGTTAACGGTAAAGTTAAAGGTGGCTTCACAGTTGAGTTAAACgg < 1:296163/251‑1 (MQ=255) aaTGCACAAGGTGAATTGGAAGTTCAAGTGGGTGATGTTGTTGATGTCGTGCTTAAAGTGGTGGATGACGGTTTCGGTGAAACTGTAGCTTCCCGTGCTGATGCAAAACGCAACGAAGCTTGGATTGTATTGGAAAAAGCATACGACGATCAAGCGACTGTTCTTGGTTTGGTTAACGGTAAAGTTAAAGGTGGCTTCACAGTTGAGTTAAACGGTGTTCGCGCATTCTTACCGGGTTCATTGGTTGATAc < 1:347937/251‑1 (MQ=255) caAGGTGAATTGGAAGTTCAAGTGGGTGATGTTGTTGATGTCGTGCTTAAAGTGGTGGATGACGGTTTCGGTGAAACTGTAGCTTCCCGTGCTGATGCAAAACGCAACGAAGCTTGGATTGTATTGGAAAAAGCATACGACGAACAAGCGACTGTTCTTGGTTTGGTTAACGGTAAAGTTAAAGGTGGCTTCACAGTTGAGTTAAACGGTGTTCGCGCATTCTTACCGGGTTCATTGGTTGATACCCGTcc < 1:814076/251‑1 (MQ=255) ggTGAATTGGAAGTTCAAGTGGGTGATGTTGTTGATGTCGTGCTTAAAGTGGTGGATGACGGTTTCGGTGAAACTGTAGCTTCCCGTGCTGATGCAAAACGCAACGAAGCTTGGATTGTATTGGAAAAAGCATACGACGAACAAGCGACTGTTCTTGGTTTGGTTAACGGTAAAGTTAAAGGTGGCTTCACAGTTGAGTTAAACgg < 1:300373/206‑1 (MQ=255) 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> 1:321002/1‑245 (MQ=255) gCTTGGATTGTATTGGAAAAAGCATACGACGAACAAGCGACTGTTCTTGGTTTGGTTAACGGTAAAGTTAAAGGTGGCTTCACAGTTGAGTTAAACGGTGTTCGCGCATTCTTACCGGGTTCATTGGTTGATACCCGTCCTGTTCGTGATGCAGATCACTTACTTGGCAAAGAATTAGAATTCAAAGTAATCAAACTTGATCAAAAACGTAACAACGTTGTTGTTTCCCgccgtgccg < 1:647459/238‑1 (MQ=255) gTATTGGAAAAAGCATACGACGAACAAGCGACTGTTCTTGGTTTGGTTAACGGTAAAGTTAAAGGTGGCTTCACAGTTGAGTTAAACGGTGTTCGCGCATTCTTACCGGGTTCATTGGTTGATACCCGTCCTGTTCGTGATGCAGATCacttac > 1:60504/1‑154 (MQ=255) gTATTGGAAAAAGCATACGACGAACAAGCGACTGTTCTTGGTTTGGTTAACGGTAAAGTTAAAGGTGGCTTCACAGTTGAGTTAAACGGTGTTCGCGCATTCTTACCGGGTTCATTGGTTGATACCCGTCCTGTTCGTGATGCAGATCACTTACTTGGCAAAGAATTAGAATTCAAAGTAATCAAACTTGATCAAAAACGTAACAACgt > 1:695730/1‑209 (MQ=255) gTATTGGAAAAAGCATACGACGAACAAGCGACTGTTCTTGGTTTGGTTAACGGTAAAGTTAAAGGTGGCTTCACAGTTGAGTTAAACGGTGTTCGCGCATTCTTACCGGGTTCATTGGTTGATACCCGTCCTGTTCGTGATGCAGATCACTTACTTGGCAAAGAATTAGAATTCAAAGTAATCAAACTTGATCAAAAACGTAACAACGTTGTTGTTTCCCgccgtgccg < 1:333164/229‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |