| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 579,542 | A→C | T55P (ACC→CCC) | unknown → | Membrane protein LAPB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 579,542 | 0 | A | C | 100.0% | 157.4 / NA | 58 | T55P (ACC→CCC) | unknown | Membrane protein LAPB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (30/28); total (30/28) | |||||||||||
TTTTTACGGCGCATGGGCGCATTTAAAATAACAAGGCTTTTTGCTATAATCTGGCGCTTAATTTATTGAATCGATTTTTATGGGGTTTATGGTGGCAACGTTCCATTTTCCGACATTTCATGAAATGTTTCCCGTTGAAAAACGTAAATTAAAATTATTGCGGGAAGGGTTGCGCTATGGGGCGCGTCGTTTGTTTTTTGTCGGGCAATGTTCGGCGTTGGTCAAGTTTATTCACGACAATACCTTGTGGCAGCCGATTTTTACGCAGCATCCTTATCGGGTGAATACGTTATTGAGCCAATATTGCGATAAAGGTTTTAACGTAACTCAGCGCTTACAGGCGATTGAAACCAATTTTGCCGTGGCGGAAAAACAATTCGGTAAGGCGTTATGCGAAACGTTAATCGCGCAACAGCCGGTATTGCTATCACAGTTAACCGATGAGTTAGCGTTAAATTTAACGCTGAATCATAT > 1/579301‑579774 | tttttACGGCGCATGGGCGCATTTAAAATAACAAGGCTTTTTGCTATAATCTGGCGCTTAATTTATTGAATCGATTTTTATGGGGTTTATGGTGGCAACGTTCCATTTTCCGACATTTCATGAAATGTTTCCCGTTGAAAAACGTAAATTAAAATTATTGCGGGAAGGGTTGCGCTATGGGGCGCGTCGTTTGTTTTTTGTCGGGCAATGTTCGGCGTTGGTCAAGTTTATTCACGACAATCCCTTGTgg < 1:793231/250‑1 (MQ=255)tttttACGGCGCATGGGCGCATTTAAAATAACAAGGCTTTTTGCTATAATCTGGCGCTTAATTTATTGAATCGATTTTTATGGGGTTTATGGTGGCAACGTTCCATTTTCCGACATTTCATGAAATGTTTCCCGTTGAAAAACGTAAATTAAAATTATTGCGGGAAGGGTTGCGCTATGGGGCGCGTCGTTTGTTTTTTGTCGGGCAATGTTCGGCGTTGGTCAAGTTTATTCACGACAATCCCTTGTgg > 1:68193/1‑250 (MQ=255) tttACGGCGCATGGGCGCATTTAAAATAACAAGGCTTTTTGCTATAATCTGGCGCTTAATTTATTGAATCGATTTTTATGGGGTTTATGGTGGCAACGTTCCATTTTCCGACATTTCATGAAATGTTTCCCGTTGAAAAACGTAAATTAAAATTATTGCGGGAAGGGTTGCGCTATGGGGCGCGTCGTTTGTTTTTTGTCGGGCAATGTTCGGCGTTGGTCAAGTTTATTCACGACAATCCCTtgt < 1:617111/246‑1 (MQ=255) gcgcATGGGCGCATTTAAAATAACAAGGCTTTTTGCTATAATCTGGCGCTTAATTTATTGAATCGATTTTTATGGGGTTTATGGTGGCAACGTTCCATTTTCCGACATTTCATGAAATGTTTCCCGTTGAAAAACGTAAATTAAAATTATTGCGGGAAGGGTTGCGCTATGGGGCGCGTCGTTTGTTTTTTGTCGGGCAATGTTCGGCGTTGGTCAAGTTTATTCACGACAATCCCTTGTGGCAGCCGAtt > 1:391628/1‑251 (MQ=255) 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aCAATCCCTTGTGGCAGCCGATTTTTACGCAGCATCCTTATCGGGTGAATACGTTATTGAGCCAATATTGCGATAAAGGTTTTAACGTAACTCAGCGCTTACAGGCGATTGAAACCAATTTTGCCGTGGCGGAAAAACAATTCGGTAAGGCGTTATGCGAAACGTTAATCGCGCAACAGCCGGTATTGCTATCACAGTTAACCGATGAGTTAGCGTTAAATTTAACGCTGAAt > 1:272656/1‑233 (MQ=255) | TTTTTACGGCGCATGGGCGCATTTAAAATAACAAGGCTTTTTGCTATAATCTGGCGCTTAATTTATTGAATCGATTTTTATGGGGTTTATGGTGGCAACGTTCCATTTTCCGACATTTCATGAAATGTTTCCCGTTGAAAAACGTAAATTAAAATTATTGCGGGAAGGGTTGCGCTATGGGGCGCGTCGTTTGTTTTTTGTCGGGCAATGTTCGGCGTTGGTCAAGTTTATTCACGACAATACCTTGTGGCAGCCGATTTTTACGCAGCATCCTTATCGGGTGAATACGTTATTGAGCCAATATTGCGATAAAGGTTTTAACGTAACTCAGCGCTTACAGGCGATTGAAACCAATTTTGCCGTGGCGGAAAAACAATTCGGTAAGGCGTTATGCGAAACGTTAATCGCGCAACAGCCGGTATTGCTATCACAGTTAACCGATGAGTTAGCGTTAAATTTAACGCTGAATCATAT > 1/579301‑579774 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |