| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 578,831 | C→T | G86D (GGT→GAT) | unknown ← | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 578,831 | 0 | C | T | 100.0% | 271.5 / NA | 101 | G86D (GGT→GAT) | unknown | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (44/57); total (44/57) | |||||||||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |