| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 576,947 | G→A | S714F (TCC→TTC) | unknown ← | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 576,947 | 0 | G | A | 100.0% | 196.6 / NA | 70 | S714F (TCC→TTC) | unknown | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (30/40); total (30/40) | |||||||||||
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(MQ=255) gtgtgtCGGCCGTAGTGATAAGAACGATAACGGAAAATTCCGTCGTTAAAATCACCTTCCAAAACGTCATAACTGCGAATCGGTGCTTTTATATACAATTTGTTTGACCAAGTGATGTTGTAATCGGGGATTGCCATATCCAAGCCGAAGCGGGCAATCCAGTCTTCTGTAGAACTATTGACTTTGTTCAGCATTTCTCTGCGGGTAAGTAATTTACCATCGAGATAAACTAATTCATTGGGATCAAGAt < 1:538092/250‑1 (MQ=255) gtgtCGGCCGTAGTGATAAGAACGATAACGGAAAATTCCGTCGTTAAAATCACCTTCCAAAACGTCATAACTGCGAATCGGTGCTTTTATATACAATTTGTTTGACCAAGTGATGTTGTAATCGGGGATTGCCATATCCAAGCCGAAGCGGGCAATCCAGTCTTCTGTAGAACTATTGACTTTGTTCAGCATTTCTCTGCGGGTAAGTAATTTACCATCGAGATAAAc < 1:846522/228‑1 (MQ=255) tAGTGATAAGAACGATAACGGAAAATTCCGTCGTTAAAATCACCTTCCAAAACGTCATAACTGCGAATCGGTGCTTTTATATACAATTTGTTTGACCAAGTGATGTTGTAATCGGGGATTGCCATATCCAAGCCGAAGCGGGCAATCCAGTCTTCTGTAGAACTATTGACTTTGTTCAGCATTTCTCTGCGGGTAAGTAATTTACCATCGAGATAAACTAATTCATTGGGATCAAGATCTCGACCTATATc < 1:863766/251‑1 (MQ=255) tAGTGATAAGAACGATAACGGAAAATTCCGTCGTTAAAATCACCTTCCAAAACGTCATAACTGCGAATCGGTGCTTTTATATACAATTTGTTTGACCAAGTGATGTTGTAATCGGGGATTGCCATATCCAAGCCGAAGCGGGCAATCCAGTCTTCTGTAGAACTATTGACTTTGTTCAGCATTTCTCTGCGGGTAAGTAATTTACCATCGAGATAAACTAATTCATTGGGATCAAGATCTCGACCTATATc < 1:883614/251‑1 (MQ=255) gATAAGAACGATAACGGAAAATTCCGTCGTTAAAATCACCTTCCAAAACGTCATAACTGCGAATCGGTGCTTTTATATACAATTTGTTTGACCAAGTGATGTTGTAATCGGGGAt > 1:676615/1‑115 (MQ=255) gATAAGAACGATAACGGAAAATTCCGTCGTTAAAATCACCTTCCAAAACGTCATAACTGCGAATCGGTGCTTTTATATACAATTTGTTTGACCAAGTGATGTTGTAATCGGGGATTGCCATATCCAAGCCGAAGCGGGCAATCCAGTCTTCTGTAGAACTATTGACTTTGTTCAGCATTTCTCTGCGGgtaagtaa > 1:182834/1‑196 (MQ=255) gAACGATAACGGAAAATTCCGTCGTTAAAATCACCTTCCAAAACGTCATAACTGCGAATCGGTGCTTTTATATACAATTTGTTTGACCAAGTGATGTTGTAATCGGGGATTGCCATATCCAAGCCGAAGCGGGCAATCCAGTCTTCTGTAGAACTATTGACTTTGTTCAGCATTTCTCTGCGGGTAAGTAATTTACCATCGAGATAAACTAATTCATTGGGATCAAGATCTCGACCTATATc < 1:142347/242‑1 (MQ=255) | TGAAGTAATTATTATGAACTAGAATTTGTAGCCGACTTCCAGCCAAAACTCGCGGCCGGGCGTGTAAATACCGTATTCATCGTTACTTGAAATTGGTTTTACGGTTTTTGATTTACGGGTTTTATTTAATACATTTAGTATGTCAACTTGCAAATAAATACTGTGATTACCGGTAATGGTCGGTTGCCAACGAATACTACTGTCCCATTGGGTGTGTCGGCCGTAGTGATAAGAACGATAACGGGAAATTCCGTCGTTAAAATCACCTTCCAAAACGTCATAACTGCGAATCGGTGCTTTTATATACAATTTGTTTGACCAAGTGATGTTGTAATCGGGGATTGCCATATCCAAGCCGAAGCGAGCAATCCAGTCTTCTGTAGAACTATTGACTTTGTTCAGCATTTCTCTGCGGGTAAGTAATTTACCATCGAGATAAACTAATTCATTGGGATCAAGATCTCGACCTATATC > 1/576703‑577176 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |