| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 558,391 | C→T | E33K (GAA→AAA) | unknown ← | Putative efflux (PET) family inner membrane protein YccS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 558,391 | 0 | C | T | 100.0% | 175.2 / NA | 65 | E33K (GAA→AAA) | unknown | Putative efflux (PET) family inner membrane protein YccS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (32/33); total (32/33) | |||||||||||
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gCACCAAAGGCATGCTTTGTTTGGAAATATTAAAATACCAAATTGCCAGCACCGCGAGATTTACGGCGATAAAAATCGGAATGGACGCAATAACTTTGGCGTTAAACCAGCGATTCATGTTTAACCTTATTTATAAAACTGCTTGTATTGTTGTTCGGTGAATTGTTGGCGGATTAAGGCGGCAGTGTCTTTCGGCAACACGCGTTGTCCCACCGGATATAATGCGATGGCGGCGATTTTGAAATGCGCCa > 1:225620/1‑251 (MQ=255) cACCAAAGGCATGCTTTGTTTGGAAATATTAAAATACCAAATTGCCAGCACCGCGAGATTTACGGCGATAAAAATCGGAATGGACGCAATAACTTTGGCGTTAAACCAGCGATTCATGTTTAACCTTATTTATaaa > 1:668006/1‑136 (MQ=255) cACCAAAGGCATGCTTTGTTTGGAAATATTAAAATACCAAATTGCCAGCACCGCGAGATTTACGGCGATAAAAATCGGAATGGACGCAATAACTTTGGCGTTAAACCAGCGATTCATGTTTAACCTTATTTATAAAAc > 1:371331/1‑138 (MQ=255) gCTTTGTTTGGAAATATTAAAATACCAAATTGCCAGCACCGCGAGATTTACGGCGATAAAAATCGGAATGGACGCAATAACTTTGGCGTTAAAc < 1:825199/94‑1 (MQ=255) | CGAAAGCGATGGTGCTGTAACGCTGCCCCAAAGCGCCGATCATGGTGAAGGCAAAGGTCATGAGCGTCATTAACAGCATAAATTGCAGGTTATGCCCAATGCTCAGTTGCACGCTTAGGGTTGAAACGGAGAAAGCGAGCAGGGTGTAAAATACGTTTTTAATACGGCCGGTTAACCGGTTATCCAAATCCACTAATCCGCCGGCAATAATGCCCAGCACCAAAGGCATGCTTTGTTCGGAAATATTAAAATACCAAATTGCCAGCACCGCGAGATTTACGGCGATAAAAATCGGAATGGACGCAATAACTTTGGCGTTAAACCAGCGATTCATGTTTAACCTTATTTATAAAACTGCTTGTATTGTTGTTCGGTGAATTGTTGGCGGATTAAGGCGGCAGTGTCTTTCGGCAACACGCGTTGTCCCACCGGATATAATGCGATGGCGGCGATTTTGAAATGCGCCA > 1/558154‑558620 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |