| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 556,485 | G→A | S668L (TCA→TTA) | unknown ← | Putative efflux (PET) family inner membrane protein YccS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 556,485 | 0 | G | A | 100.0% | 251.3 / NA | 92 | S668L (TCA→TTA) | unknown | Putative efflux (PET) family inner membrane protein YccS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (48/44); total (48/44) | |||||||||||
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(MQ=255) aGATTGACTTGCACCTGTTTTAAACGTAATTCAATGTTCTCGTGCAGCTTTTCAAAAATATCCGGTGGCAGTTTTTCCAGGTGTTCCAAAATATAAATAATCTTTTTCGCCGCCGGATAAAATTCCGCTAAAAATGCCGTGCTTTGCTGTATTTTTTTCATTTTACTGCAATACGCGCCGAGCGCCGAAATATAACTGAGCAGAGAATAATTGATTTTTAGCAGCTCGAATcc > 1:454527/1‑233 (MQ=255) gACTTGCACCTGTTTTAAACGTAATTCAATGTTCTCGTGCAGCTTTTCAAAAATATCCGGTGGCAGTTTTTCCAGGTGTTCCAAAATATAAATAATCTTTTTCGCCGCCGGATAAAATTCCGCTAAAAATGCCGTGCTTTGCTGTATTTTTTTCATTTTACTGCGATACGCGCCGAGCGCCGAAATATAACTGAGCAGAGAATAATTGATTTTTAGCAGCTCGAATCCTGTTTGCAAATACGCCTGATAtt > 1:701327/1‑251 (MQ=255) aCTTGCACCTGTTTTAAACGTAATTCAATGTTCTCGTGCAGCTTTTCAAAAATATCCGGTGGCAGTTTTTCCAGGTGTTCCAAAATATAAATAATCTTTTTCGCCGCCGGATAAAATTCCGCTAAAAATGCCGTGCTTTGCTGTATTTTTTTCATTTTACTGCGATACGCGCCGAGCGCCGAAATATAACTGAGc > 1:489245/1‑195 (MQ=255) ccTGTTTTAAACGTAATTCAATGTTCTCGTGCAGCTTTTCAAAAATATCCGGTGGCAGTTTTTCCAGGTGTTCCAAAATATAAATAATCTTTTTCGCCGCCGGATAAAATTCCGCTAAAAATGCCGTGCTTTGCTGTATTTTTTTCATTTTAc < 1:290840/153‑1 (MQ=255) 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AAACGTCAAATTCCCCGTTGGTTGGTGCAACACCCTAAAGTGCGCGCCTTACACCAAGCCCCGAAAGAATGGGGCGGTGATGCGGCAATCTTGATTTTAATCGACGTTTAGACGGTTTTCTGAAATGCACCGTAAAGGGACGGCAGAATTTGGCTGATCATGCTTAACTGCTGAATCGGAATGTTAAATTGTACCTGTTCCGGTTGGGCGTTAGTATTTAGATTGACTTGCACCTGTTTTAAACGTGATTCAATGTTCTCGTGCAGCTTTTCAAAAATATCCGGTGGCAGTTTTTCCAGGTGTTCCAAAATATAAATAATCTTTTTCGCCGCCGGATAAAATTCCGCTAAAAATGCCGTGCTTTGCTGTATTTTTTTCATTTTACTGCGATACGCGCCGAGCGCCGAAATATAACTGAGCAGAGAATAATTGATTTTTAGCAGCTCGAATCCTGTTTGCAAATACGCCTGATATTTCTTCGGTTCATGAT > 1/556239‑556728 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |