| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 554,029 | T→C | V104A (GTG→GCG) | unknown → | Transketolase, C‑terminal section (EC 2.2.1.1) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 554,029 | 0 | T | C | 100.0% | 252.3 / NA | 92 | V104A (GTG→GCG) | unknown | Transketolase, C‑terminal section (EC 2.2.1.1) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (48/44); total (48/44) | |||||||||||
AATGTATGCGGGAAAATCCGCTGGTGATTGAACTGGACGCGGATTTAATGAGCTGCATGACCATGGATAAAGTGCAGAAAAATCTGCCGAATCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGTGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGTGTCACGGCAGTGTATAACGGCGGCACGCATATGTCCTTTGAAGACATGGGCATTGTGCGCGGGCTGGCTCATGCCAAGGTGTTGGAAATCACCGACGGCGCCATGATGAAAAATCTCGTTCGGCAGTTGGTGGCGTTAAAAGGCTTTTATTGGGTGCGCACCATTCGTAAAAGTGCGGTCAAAATTTACGATGAAAATGAAACCTTCACTAT > 1/553783‑554272 | aaTGTATGCGGGAAAATCCGCTGGTGATTGAACTGGACGCGGATTTAATGAGCTGCATGACCATGGATAAAGTGCAGAAAAATCTGCCGAATCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGaa > 1:347667/1‑250 (MQ=255) aTCCGCTGGTGATTGAACTGGACGCGGATTTAATGAGCTGCATGACCATGGATAAAGTGCAGAAAAATCTGCCGAATCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGc > 1:338234/1‑250 (MQ=255) ccGCTGGTGATTGAACTGGACGCGGATTTAATGAGCTGCATGACCATGGATAAAGTGCAGAAAAATCTGCCGAATCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCt > 1:149009/1‑250 (MQ=255) ggTGATTGAACTGGACGCGGATTTAATGAGCTGCATGACCATGGATAAAGTGCAGAAAAATCTGCCGAATCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGAcg > 1:743482/1‑251 (MQ=255) gTGATTGAACTGGACGCGGATTTAATGAGCTGCATGACCATGGATAAAGTGCAGAAAAATCTGCCGAATCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGAcg < 1:142519/250‑1 (MQ=255) aCGCGGATTTAATGAGCTGCATGACCATGGATAAAGTGCAGAAAAATCTGCCGAATCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGTGTCACGGc < 1:511923/250‑1 (MQ=255) cgcgGATTTAATGAGCTGCATGACCATGGATAAAGTGCAGAAAAATCTGCCGAATCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGTGTCACGGCAg < 1:62018/251‑1 (MQ=255) cgcgGATTTAATGAGCTGCATGACCATGGATAAAGTGCAGAAAAATCTGCCGAATCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGTGTCACGGCAg < 1:514663/251‑1 (MQ=255) tAATGAGCTGCATGACCATGGATAAAGTGCAGAAAAATCTGCCGAATCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGTGTCACGGCAGTGTATAAc < 1:308951/251‑1 (MQ=255) tAATGAGCTGCATGACCATGGATAAAGTGCAGAAAAATCTGCCGAATCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGTGTCACGGCAGTGTATAAc < 1:484367/251‑1 (MQ=255) tAATGAGCTGCATGACCATGGATAAAGTGCAGAAAAATCTGCCGAATCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGTGTCACGGCAGTGTATAAc < 1:522410/251‑1 (MQ=255) tAATGAGCTGCATGACCATGGATAAAGTGCAGAAAAATCTGCCGAATCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGTGTCACGGCAGTGTATAAc < 1:134667/251‑1 (MQ=255) tAATGAGCTGCATGACCATGGATAAAGTGCAGAAAAATCTGCCGAATCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGTGTCACGGCAGTGTATAAc < 1:887113/251‑1 (MQ=255) cTGCATGACCATGGATAAAGTGCAGAAAAATCTGCCGAATCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGTGTCACGGCAGTGTATAAc < 1:381865/244‑1 (MQ=255) gCATGACCATGGATAAAGTGCAGAAAAATCTGCCGAATCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCACGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCTCCTTTGCCAGCCGCCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGAGTCACGGCAGTGTATAACGGCGGCACg > 1:708291/1‑251 (MQ=255) aCCATGGATAAAGTGCAGAAAAATCTGCCGAATCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGTGTCACGGCAGTGTATAACGGCGGCACGCatat > 1:517595/1‑251 (MQ=255) 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aCCATGGATAAAGTGCAGAAAAATCTGCCGAATCAGGCGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGTGTCACGGCAgtgt > 1:874403/1‑232 (MQ=255) ccATGGATAAAGTGCAGAAAAATCTGCCGAATCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGTGTCACGGCAGTGTATAACGGCGGCACGCATATg < 1:644099/251‑1 (MQ=255) cATGGATAAAGTGCAGAAAAATCTGCCGAATCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGTGTCACGGCAGTGTATAACGGCGGCACGCATATGt < 1:271218/251‑1 (MQ=255) aTGGATAAAGTGCAGAAAAATCTGCCGAATCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAg > 1:382282/1‑196 (MQ=255) tGGATAAAGTGCAGAAAAATCTGCCGAATCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGTGTCACGGCAGTGTATAACGGCGGCACGCATATGTcc < 1:744114/251‑1 (MQ=255) tGGATAAAGTGCAGAAAAATCTGCCGAATCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGTGTCACGGCAGTGTATAACGGCGGCACGCATATGTc > 1:768147/1‑250 (MQ=255) 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aaaaTCTGCCGAATCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGTGTCACGGCAGTGTATAACGGCGGCACGCATATGTCCTTTGAAGACATGGGc < 1:392792/251‑1 (MQ=255) aaTCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGTGTCACGGCAGTGtat > 1:592962/1‑204 (MQ=255) ggTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGTGTCACGGCAGTGTATAACGGCGGCACGCATATGTCCTTTGAAg > 1:881397/1‑227 (MQ=255) ggTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGTGTCACGGCAGTGTATAACGGCGGCACGCATATGTCCTTTGAAGAc < 1:520639/229‑1 (MQ=255) ggTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGTGTCACGGCAGTGTATAACGGCGGCACGCATATGTCCTTTGAAGACATGGGCATTGTGCGCGggc > 1:203814/1‑248 (MQ=255) ggTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGCGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGTGTCACGGCAGTGTATAACGGCGGCACGCATATGTTCTTTGAAGACATGGGCATTGTGCGCggg > 1:462895/1‑247 (MQ=255) gTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGCGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGTGTCACGGCAGTGTATAACGGCGGCACGCATATGTcc > 1:656702/1‑219 (MQ=255) 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AATGTATGCGGGAAAATCCGCTGGTGATTGAACTGGACGCGGATTTAATGAGCTGCATGACCATGGATAAAGTGCAGAAAAATCTGCCGAATCAGGTGATTAACTGTGGCATTATGGAAGCCAATGTGGTGGGCATGGCGGCAGGGTTAGCCATTGCCGGGCACATTCCGTTCTTCCACTCGTTTACCGCCTTTGCCAGCCGTCGCTGTTTGGATCAGCTGTTTATGTCGGTGGATTATCAACAGGTGAACGTGAAAGTTATCGCCTCCGACGCGGGTGTCACGGCAGTGTATAACGGCGGCACGCATATGTCCTTTGAAGACATGGGCATTGTGCGCGGGCTGGCTCATGCCAAGGTGTTGGAAATCACCGACGGCGCCATGATGAAAAATCTCGTTCGGCAGTTGGTGGCGTTAAAAGGCTTTTATTGGGTGCGCACCATTCGTAAAAGTGCGGTCAAAATTTACGATGAAAATGAAACCTTCACTAT > 1/553783‑554272 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |