| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 545,039 | A→G | intergenic (‑228/‑65) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Leu‑CAA/UPF0299 membrane protein YohJ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 545,039 | 0 | A | G | 100.0% | 85.2 / NA | 32 | intergenic (‑228/‑65) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑CAA/UPF0299 membrane protein YohJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (17/15); total (17/15) | |||||||||||
TTGATAAGCTTCGTAAAAACGAGCGGTATTATAAGGGATTATGTTTCAGTTGCAAGCAAAAACTTTGCAATTTTGTTTAACTGTTTAAAATTCAACACATTCAATAATTTTGATCTATGTGAAATTTTTCCCTTACTTTCTTTTCTACTAGTGTAGTGGCTTTCCGGAAAAAATTCCCCTTCTTGTAAAATAAGAGTAGAATTATTTTAAATATTAAAAAAAAATTGAGTTTTCACTATGTATCGGAAAGTTTTTGACTTAGCAAGATCGTTACTCCTGTTATATTTCATGCTGTATTTGGGCGGGCTTACCGCGCATTTTGTTCCCATTGGCATTCCCTCCAGTATTTGGGGATTATTGTTGCTCTTTACGTGCTTAATTACGCGCATTATCAAAATCGAATGGGTGATGTTTTTCTCTAATTTTCTGGTTCGTTATATGGCACTGTTGTTCGTGCCGGTCAG > 1/544816‑545279 | ttGATAAGCTTCGTAAGAACGAGCGGTATTATAAGGGATTATGTTTCAGTTGCAAGCAAAAACTTTGCAATTTTGTTTAACTGTTTAAAATTCAACACATTCAATAATTTTGATCTATGTGAAATTTTTCCCTTACTTTCTTTTCTACTAGTGTAGTGGCTTTCCGGAAAAAATTCCCCTTCTTGTAAAATAAGAGTAGAATTATTTTAAATATTAAAAAAAAGTTGAGTTTTCACTATg > 1:901771/1‑240 (MQ=255) gTATTATAAGGGATTATGTTTCAGTTGCAAGCAAAAACTTTGCAATTTTGTTTAACTGTTTAAAATTCAACACATTCAATAATTTTGATCTATGTGAAATTTTTCCCTTACTTTCTTTTCTACTAGTGTAGTGGCTTTCCGGAAAAAATTCCCCTTCTTGTAAAATAAGAGTAGAATTATTTTAAATATTAAAAAAAAGTTGAGTTTTCACTATGTATCGGAAAGTTTTTGACTTAGCAAGAt > 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TTGATAAGCTTCGTAAAAACGAGCGGTATTATAAGGGATTATGTTTCAGTTGCAAGCAAAAACTTTGCAATTTTGTTTAACTGTTTAAAATTCAACACATTCAATAATTTTGATCTATGTGAAATTTTTCCCTTACTTTCTTTTCTACTAGTGTAGTGGCTTTCCGGAAAAAATTCCCCTTCTTGTAAAATAAGAGTAGAATTATTTTAAATATTAAAAAAAAATTGAGTTTTCACTATGTATCGGAAAGTTTTTGACTTAGCAAGATCGTTACTCCTGTTATATTTCATGCTGTATTTGGGCGGGCTTACCGCGCATTTTGTTCCCATTGGCATTCCCTCCAGTATTTGGGGATTATTGTTGCTCTTTACGTGCTTAATTACGCGCATTATCAAAATCGAATGGGTGATGTTTTTCTCTAATTTTCTGGTTCGTTATATGGCACTGTTGTTCGTGCCGGTCAG > 1/544816‑545279 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |