| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 544,311 | C→T | A108A (GCG→GCA) | unknown ← | Micrococcal nuclease (thermonuclease) homologs |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 544,311 | 0 | C | T | 100.0% | 211.1 / NA | 77 | A108A (GCG→GCA) | unknown | Micrococcal nuclease (thermonuclease) homologs |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (41/36); total (41/36) | |||||||||||
CAGCATCGGAATGGAGATAAGGAAAATATTGACGAAATATCACGGGATCAAAATTCATGTGGTTTACCTTCTTTGTTGACGCCATAAGTGCGGTTCGATGGGATGACGATCCTGCCATAAGCCGATACGCCGTTTTTTTGCCCGTTGTTCCGCTTCGCGATAAACGGGATCCTGAACATATTGTTTATAGGCCCACGCCATGCCCTGTTGGACCATGATTAAATTAACGTTTTGCCCTTGCGCATCATACGCGATGGCTAACTTGCGATGATAGCGATCCTCGCCGGAAATCTCCAGTTTGATCTCACGTTGATGAATCAATGACGCGAGCATTTGACGGGATTTCTTGCCGAATGGCTGATTGTGTTCGGGCGCATCAATTTCCGCCAAACGCACTTTGATTTGTTTATGATTGCCTGTTAAGCAGGTAAAACTGTCACCATCACTGATGCCGACAACGCGACAGGCTAACGTGTGGGCGTGAACG > 1/544071‑544557 | caGCATCGGAATGGAGATAAGGAAAATATTGACGAAATATCACGGGATCAAAATTCATGTGGTTTACCTTCTTTGTTGACGCCATAAGTGCGGTTCGATGGGATGACGATCCTGCCATAAGCCGATACGCCGTTTTTTTGCCCGTTGTTCCGCTTCGCGATAAACGGGATCCTGAACATATTGTTTATAGGCCCACGCCATGCCCTGTTGGACCATGATTAAATTAACGTTTTGCCCTTGTGCATCATAcg > 1:171635/1‑251 (MQ=255) 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tGTTGGACCATGATTAAATTAACGTTTTGCCCTTGTGCATCATACGCGATGGCTAACTTGCGATGATAGCGATCCTCGCCGGAAATCTCCAGTTTGATCTCACGTTGATGAATCAATGACGCGAGCATTTGACGGGATTTCTTGCCGAATGGCTGATTGTGTTCGGGCGCATCAATTTCCGCCAAACGCACTTTGATTTGTTTATGATTGCCTGTTAAGCAGGTAAAACTGTCACCATCACTGATGCCGAc < 1:187757/251‑1 (MQ=255) gTTGGACCATGATTAAATTAACGTTTTGCCCTTGTGCATCATACGCGATGGCTAACTTGCGATGATAGCGATCCTCGCCGGAAATCTCCAGTTTGATCTCACGTTGATGAATCAATGACGCGAGCATTTGACGGGATTTCTTGCCGAATGGCTGATTGTGTTCGGGCGCATCAATTTCCGCCAAACGCACTTTGATTTGTTTATGATTGCCTGTTAAGCAg < 1:282719/221‑1 (MQ=255) gTTGGACCATGATTAAATTAACGTTTTGCCCTTGTGCATCATACGCGATGGCTAACTTGCGATGATAGCGATCCTCGCCGGAAATCTCCAGTTTGATCTCACGTTGATGAATCAATGACGCGAGCATTTGACGGGATTTCTTGCCGAATGGCTGATTGTGTTCGGGCGCATCAATTTCCGCCAAACGCACTTTGATTTGTTTATGATTGCCTGTTAAGCAGGTAAAACTGTCACCATCAc > 1:166559/1‑240 (MQ=255) 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(MQ=255) cccTTGTGCATCATACGCGATGGCTAACTTGCGATGATAGCGATCCTCGCCGGAAATCTCCAGTTTGATCTCACGTTGATGAATCAATGACGCGAGCATTTGACGGGATTTCTTGCCGAATGGCTGATTGTGTTCGGGCGCATCAATTTCCGCCAAACGCACTTTGATTTGTTTATGATTGCCTGTTAAGCAGGTAAAACTGTCACCATCACTGATGCCGACAACGCGAc < 1:333578/230‑1 (MQ=255) ccTTGTGCATCATACGCGATGGCTAACTTGCGATGATAGCGATCCTCGCCGGAAATCTCCAGTTTGATCTCACGTTGATGAATCAATGACGCGAGCATTTGACGGGATTTCTTGCCGAATGGCTGATTGTGTTCGGGCGCATCAATTTCCGCCAAACGCACTTTGATTTGTTTATGATTGCCTGTTAAGCAGGTAAAACTGTCACCATCACTGATGCCGACAACGCGACAGGCTAACGTGTGGGCGTGAAc < 1:667608/251‑1 (MQ=255) ccTTGTGCATCATACGCGATGGCTAACTTGCGATGATAGCGATCCTCGCCGGAAATCTCCAGTTTGATCTCACGTTGATGAATCAATGACGCGAGCATTTGACGGGATTTCTTGCCGAATGGCTGATTGTGTTCGGGCGCATCAATTTCCGCCAAACGCACTTTGATTTGTTTATGATTGCCTGTTAAGCAGGTAAAACTGTCACCATCACTGATGCCGACAACGCGACAGGCTAACGTGTGGGCGTGAAc < 1:863101/251‑1 (MQ=255) cTTGTGCATCATACGCGATGGCTAACTTGCGATGATAGCGATCCTCGCCGGAAATCTCCAGTTTGATCTCACGTTGATGAATCAATGACGCGAGCATTTGACGGGATTTCTTGCCGAATGGCTGATTGTGTTCGGGCGCATCAATTTCCGCCAAACGCACTTTGATTTGTTTATGATTGCCTGTTAAGCAGGTAAAACTGTCACCATCACTGATGCCGACAACGCGACAGGCTAACGTGTGGGCGTGAACg > 1:113613/1‑251 (MQ=255) cTTGTGCATCATACGCGATGGCTAACTTGCGATGATAGCGATCCTCGCCGGAAATCTCCAGTTTGATCTCACGTTGATGAATCAATGACGCGAGCATTTGACGGGATTTCTCGCCGAATGGCTGATTGTGTTCGGGCGCATCAATTTCCGCCAAACGCACTTTGATTTGTTTATGATTGCCTGTTAAGCAGGTAAAACTGTCACCATCACTGATGCCGACAACGCGACAGGCTAACGTGTGGGCGTGAACg > 1:732746/1‑251 (MQ=255) | CAGCATCGGAATGGAGATAAGGAAAATATTGACGAAATATCACGGGATCAAAATTCATGTGGTTTACCTTCTTTGTTGACGCCATAAGTGCGGTTCGATGGGATGACGATCCTGCCATAAGCCGATACGCCGTTTTTTTGCCCGTTGTTCCGCTTCGCGATAAACGGGATCCTGAACATATTGTTTATAGGCCCACGCCATGCCCTGTTGGACCATGATTAAATTAACGTTTTGCCCTTGCGCATCATACGCGATGGCTAACTTGCGATGATAGCGATCCTCGCCGGAAATCTCCAGTTTGATCTCACGTTGATGAATCAATGACGCGAGCATTTGACGGGATTTCTTGCCGAATGGCTGATTGTGTTCGGGCGCATCAATTTCCGCCAAACGCACTTTGATTTGTTTATGATTGCCTGTTAAGCAGGTAAAACTGTCACCATCACTGATGCCGACAACGCGACAGGCTAACGTGTGGGCGTGAACG > 1/544071‑544557 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |