| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 538,861 | A→G | E21G (GAA→GGA) | unknown → | NAD(P)H oxidoreductase YrkL @ Putative NADPH‑quinone reductase (modulator of drug activity B) @ Flavodoxin 2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 538,861 | 0 | A | G | 100.0% | 193.0 / NA | 70 | E21G (GAA→GGA) | unknown | NAD(P)H oxidoreductase YrkL @ Putative NADPH‑quinone reductase (modulator of drug activity B) @ Flavodoxin 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (31/39); total (31/39) | |||||||||||
GGATCATGCCATGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCAAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGGTGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGAACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCTTGGTCTATCCCCTTTGGTGGATGGGCTTCCCTGCTGTTTTGAAAGGTTATTTGGATCGCGTTCTTAG > 1/538617‑539104 | ggATCATGCTATGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGATGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTAt > 1:193095/1‑251 (MQ=255) tgctaTGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGATGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTaaa < 1:337210/247‑1 (MQ=255) gTCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGATGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGaa > 1:55444/1‑251 (MQ=255) ttGCCGAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGATGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTc < 1:781496/251‑1 (MQ=255) gCATTGGTAGAGGCGCTTTCGATGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGtat < 1:616620/250‑1 (MQ=255) gCATTGGTAGAGGCGCTTTCGATGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGtat > 1:698408/1‑250 (MQ=255) ttGGTAGAGGCGCTTTCGATGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACAt > 1:44993/1‑251 (MQ=255) cTTTCGATGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAAt > 1:765869/1‑250 (MQ=255) aTACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTaa < 1:534766/179‑1 (MQ=255) aTACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGc < 1:822516/183‑1 (MQ=255) aTACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTg > 1:471334/1‑212 (MQ=255) ctacGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACAtt < 1:286227/228‑1 (MQ=255) aaTCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAAt < 1:161093/250‑1 (MQ=255) aTCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGc > 1:202846/1‑169 (MQ=255) aTCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTa > 1:175762/1‑251 (MQ=255) aTCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTa > 1:639752/1‑251 (MQ=255) aTCCAGGGGCGTGATTTAGCAGGGAATGATATTGATGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAACGAAATGAAGCAATTAATAATTTCTGAACAACCTAATCAACAAAGTTAAAACAGCGCCATCGTGGGACGTATTGCACAAGAATCTCATCAAGCAGAGGCGGATACCACTGTTCGGGATTAGTATACAtt > 1:460110/1‑217 (MQ=255) aGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTg > 1:17026/1‑251 (MQ=255) gggCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGt < 1:524233/248‑1 (MQ=255) gggCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGc < 1:343781/250‑1 (MQ=255) gggCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGc < 1:730339/250‑1 (MQ=255) gggCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGc < 1:141586/250‑1 (MQ=255) ggCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGtat < 1:361797/205‑1 (MQ=255) gCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGta > 1:80261/1‑203 (MQ=255) tGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGcc < 1:299402/251‑1 (MQ=255) gATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGt < 1:638800/187‑1 (MQ=255) aTTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTa < 1:611198/238‑1 (MQ=255) aTTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGc < 1:778156/243‑1 (MQ=255) aTTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGc > 1:877410/1‑248 (MQ=255) tAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAg < 1:82263/251‑1 (MQ=255) gCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAgg > 1:488587/1‑250 (MQ=255) cAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGc < 1:592693/250‑1 (MQ=255) cAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCa > 1:625206/1‑251 (MQ=255) gAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGAt < 1:384541/183‑1 (MQ=255) aTGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAg > 1:879821/1‑219 (MQ=255) tgttTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGaaattaaatt < 1:118183/251‑1 (MQ=255) gTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAg > 1:201083/1‑219 (MQ=255) gTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCAtt < 1:92608/224‑1 (MQ=255) gCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATttaa > 1:70939/1‑251 (MQ=255) aaaaTTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGAtt < 1:349833/251‑1 (MQ=255) aaaaTTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGAtt < 1:595871/251‑1 (MQ=255) tttAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCt < 1:682784/251‑1 (MQ=255) tttAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCt < 1:96836/251‑1 (MQ=255) tttAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCt < 1:333738/251‑1 (MQ=255) ttAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCtt < 1:653295/251‑1 (MQ=255) ttAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCtt < 1:228131/251‑1 (MQ=255) aaaTGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCTTGGTCTATcc < 1:280184/250‑1 (MQ=255) aaaTGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCTTGGTCTATcc < 1:325393/250‑1 (MQ=255) aaaTGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCTTGGTCTATcc < 1:400690/250‑1 (MQ=255) cATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCTTGGTCTATCCCCTTtggtg < 1:68745/251‑1 (MQ=255) aTTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAg > 1:343418/1‑69 (MQ=255) aaTTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCt > 1:770801/1‑227 (MQ=255) aaTTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCTTGGTCTATCCCCTTTGGTGGATgg > 1:572749/1‑251 (MQ=255) tttCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCTTGGTCTATCCCCTTtgg < 1:416199/239‑1 (MQ=255) tttCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCTTGGTCTATCCCCTTTGGTGGATGGGCtt > 1:11475/1‑250 (MQ=255) gCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCTTGGTCTATCCCCTTTGGTGGATGGGCTTCCctg > 1:663233/1‑250 (MQ=255) caTCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCTTGGTc > 1:743584/1‑219 (MQ=255) caTCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCTTGGTCTATCCCCTTTGGTGGATGGGCTTCCctg > 1:542702/1‑247 (MQ=255) aTCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCTTGGTCTATCCCCTTTGGTGGATGGGCTTCCCTGCTGtt > 1:387125/1‑251 (MQ=255) tCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCTTGGTCTATCCCCTTTGGTGGATGGGCTTCCCTGCTGttt > 1:527094/1‑251 (MQ=255) aTCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCTTGGTCTATCCCCTTTGGTGGATGGGCTTCCCTGCTGTTTTGaaa < 1:720167/251‑1 (MQ=255) tCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCTTGGTCTATCCCCTTTGGTGGATGGGc < 1:67758/232‑1 (MQ=255) aGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCTTGGTCTATCCCCTTTGGTGGATGGGCTTCCCTGCTGTTTTGAAAGGTTAttt > 1:67144/1‑251 (MQ=255) gTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCTTGGTCTATCCCCTTTGGTGGATgg < 1:38988/222‑1 (MQ=255) gTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCTTGGTCTATCCCCTTTGGTGGATGGGCTTCCCTGCTGTTTTGAAAGGTTATTTg > 1:254281/1‑251 (MQ=255) cgcCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCTTGGTCTATCCCCTTTGGTGGATGGGCTTCCCTGCTGTTTTGAAAGGTTATTTGGATCGCGtt < 1:419191/250‑1 (MQ=255) cgcCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCTTGGTCTATCCCCTTTGGTGGATGGGCTTCCCTGCTGTTTTGAAAGGTTATTTGGATCGCGTTc < 1:89863/251‑1 (MQ=255) ccATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCTTGGTCTATCCCCTTTGGTGGATGGGCTTCCCTGCTGTTTTGAAAGGTTATTTGGATCGCGTTCtt > 1:30253/1‑251 (MQ=255) aTCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCTTGGTCTATcccc < 1:826778/196‑1 (MQ=255) tCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCTTGGTCTATCCCCTTTGGTGGATGGGCTTCCCTGCTGTTTTGAAAGGTTATTTGGATCGCGTTCTTAg > 1:79815/1‑250 (MQ=255) | GGATCATGCCATGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCAAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGGTGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGAACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTCGGGATTTGTATACATTAAATTTCAATCCCGTTTTGTCTTGGAGTGAATTAAGTGCAGGGCCTGAAGGCATTGTGCCGGCAGAAATTAAATTTGAGCAAAATTTAATTAAAGAAGCGGATTTGATTACCTTGGTCTATCCCCTTTGGTGGATGGGCTTCCCTGCTGTTTTGAAAGGTTATTTGGATCGCGTTCTTAG > 1/538617‑539104 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |