| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 538,663 | A→G | K107E (AAA→GAA) | unknown → | Putative activity regulator of membrane protease YbbK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 538,663 | 0 | A | G | 100.0% | 145.8 / NA | 55 | K107E (AAA→GAA) | unknown | Putative activity regulator of membrane protease YbbK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (28/27); total (28/27) | |||||||||||
GTGTTTTTCTTCTATGGTGGGGATTAGCCGCCATCGTTGTTGCCGGTATCATGAAATTTATTCCCGCCTTACCGCTTTCGGCATTGGCGGTAATTTATGCGGTTATCGCCATTATTCTTAGTATTATTTGGTGGCGCTATCAACACGGTAAGGATCAAATTGATCAATCGAAATCTGTCCTCAATCAACGGGATCATGCCATGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCAAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGGTGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGAACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTC > 1/538427‑538908 | gtgtTTTTCTTCTATGGTGGGGATTAGCCGCCATCGTTGTTGCCGGTATCATGAAATTTATTCCCGCCTTACCACTTTCGGCATTGGCGGTAATTTATGCGGTTATCGCCATTATTCTTAGTATTATTTGGTGGCGCTATCAACACGGTAAGGATCAAATTGATCAATCGAAATCTGTCCTCAATCAACGGGATCATGCTATGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGt > 1:526834/1‑251 (MQ=255)gtgtTTTTCTTCTATGGTGGGGATTAGCCGCCATCGTTGTTGCCGGTATCATGAAATTTATTCCCGCCTTACCACTTTCGGCATTGGCGGTAAATTCTTCGGTTATCGCCCTTATTCTTAGTATTTTTTGGGGGCGCTATCAACACGGTTAGGATCAAATTGATCAATCGAAATCTGTCCTTAATCAACGGGATTATGCTATGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTTACTATTGCCGAAAACGGCATTggg > 1:597405/1‑250 (MQ=255) ctATGGTGGGGATTAGCCGCCATCGTTGTTGCCGGTATCATGAAATTTATTCCCGCCTTACCACTTTCGGCATTGGCGGTTATTTATGCGGTTATCGCCATTATTCTTTGTATTATTTGGTGGCGCTATCAACACGGTAAGGATCAAATTGATCAATCGAAATCTGTCCTCAATCAACGGGATCATGCTATGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCGAAAACCGCATTGGTAGAGGCGCttt > 1:173140/1‑251 (MQ=255) tggGGATTAGCCGCCATCGTTGTTGCCGGTATCATGAAATTTATTCCCGCCTTACCACTTTCGGCATTGGCGGTAATTTATGCGGTTATCGCCATTATTCTTAGTATTATTTGGTGGCGCTATCAACACGGTAAGGATCAAATTGATCAATCGAAATCTGTCCTCAATCAACGGGATCATGCTATGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCgatg < 1:17564/250‑4 (MQ=255) 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aaTTTATTCACGCCTTACCACTTTCGGCATTGGCGGTAATTTATGCGGTTATCGCCCTTATTCTTAGTATTATTTGGTGGCGCTATCAACACGGTAAGGATCAAATTGATCAATCGAAATCTGTCCTCAATCAACGGGATCATGCTATGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGTAGAGgcg > 1:235606/1‑204 (MQ=255) aTTTATTCCCGCCTTACCACTTTCGGCATTGGCGGTAATTTATGCGGTTATCGCCATTATTCTTAGTATTTTTTGGTGGCGCTATCAAAACGGTAAGGATCAAATTGATCAATCGAAATCTGTCCTCAATCAACGGGATCATGCTATGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGTa > 1:179321/1‑197 (MQ=255) aTTCCCGCCTTACCACTTTCGGCATTGGCGGTAATTTATGCGGGTATCGCCATTATTCTTAGTATTATTTGGTGGCGCTATCAACACGGTAAGGATCAAATTGATCAATCGAAATCTGTCCTCAATCAACGGGATCATGCTATGATAGGGGTGCAGGGAAAAGGCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGt > 1:855593/1‑192 (MQ=255) ttCCCGCCTTACCACTTTCGGCATTGGCGGTAATTTATGCGGTTATCGCCATTATTCTTAGTATTATTTGGTGGCGCTATCAACACGGTAAGGATCAAATTGATCAATCGAAATCTGTCCTCAATCAACGGGATCATGCTATGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGATGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGat < 1:879997/251‑1 (MQ=255) 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cGGTAAGGATCAAATTGATCAATCGAAATCTGTCCTCAATCAACGGGATCATGCTATGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGATGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTg > 1:513926/1‑250 (MQ=255) cGGTAAGGATCAAATTGATCAATCGAAATCTGTCCTCAATCAACGGGATCATGCTATGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGATGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTg > 1:677104/1‑250 (MQ=255) gTAAGGATCAAATTGATCAATCGAAATCTGTCCTCAATCAACGGGATCATGCTATGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGATGATACTACGTGGAGAATCCAgggg > 1:135185/1‑143 (MQ=255) gTAAGGATCAAATTGATCAATCGAAATCTGTCCTCAATCAACGGGATCATGCTATGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGATGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAg < 1:83754/156‑1 (MQ=255) 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aTCAAATTGATCAATCGAAATCTGTCCTCAATCAACGGGATCATGCTATGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGATGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCt < 1:237055/250‑1 (MQ=255) aaaTTGATCAATCGAAATCTGTCCTCAATCAACGGGATCATGCTATGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGATGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATc < 1:151474/251‑1 (MQ=255) aTCGAAATCTGTCCTCAATCAACGGGATCATGCTATGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGATGATACTACGTGgag > 1:10576/1‑114 (MQ=255) tcaatcaaCGGGATCATGCTATGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGATGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATG‑‑ATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTg > 1:803750/1‑251 (MQ=255) 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tgctaTGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGATGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTaaa < 1:337210/247‑1 (MQ=255) gctaTGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGATGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACAt < 1:560734/145‑1 (MQ=255) aTGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGTa > 1:44266/1‑52 (MQ=255) aTGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGATGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCg > 1:471786/1‑231 (MQ=255) tGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGATGATACTACGt < 1:150573/75‑1 (MQ=255) 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aGTCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGATGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATcaac < 1:729774/190‑1 (MQ=255) gTCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGATGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTggga < 1:464399/215‑3 (MQ=255) gTCTTAACTATTGCCGAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGATGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGaa > 1:55444/1‑251 (MQ=255) ttGCCGAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGATGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGGACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTc < 1:781496/251‑1 (MQ=255) | GTGTTTTTCTTCTATGGTGGGGATTAGCCGCCATCGTTGTTGCCGGTATCATGAAATTTATTCCCGCCTTACCGCTTTCGGCATTGGCGGTAATTTATGCGGTTATCGCCATTATTCTTAGTATTATTTGGTGGCGCTATCAACACGGTAAGGATCAAATTGATCAATCGAAATCTGTCCTCAATCAACGGGATCATGCCATGATAGGGGTGCAGGGAAAAGTCTTAACTATTGCCAAAAACGGCATTGGTAGAGGCGCTTTCGGTGATACTACGTGGAGAATCCAGGGGCGTGATTTAGCAGTGAATGATATTGTTGAAGTTGTTTCTGTTGATAGCATCACATTGAAAGTTAAGAAAATTTAAGGAAAGAAATGAAGCATTTAATTATTTCTGCACATCCTAATCAACAAAGTTTTAACCGCGCCATCGTGGAACGTATTGTAAAAGCCTCTCATGAATTAGAGGCGGAAACCACTGTTC > 1/538427‑538908 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |