| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 529,965 | A→C | R34R (CGA→CGC) | unknown → | Long‑chain‑fatty‑acid‑‑CoA ligase (EC 6.2.1.3) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 529,965 | 0 | A | C | 100.0% | 180.4 / NA | 66 | R34R (CGA→CGC) | unknown | Long‑chain‑fatty‑acid‑‑CoA ligase (EC 6.2.1.3) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (31/35); total (31/35) | |||||||||||
CCCTGACGACATTTATGACTACGCACCGTTTTACCCTTACGGCTGGGGATTTTCGTCCCGCTTCTTTTGGGCTGAACCGCGCGTGCGCTATAATTTATATTAATTAACCCGATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGAGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAATGATGCCGAATTTGCTGCAATATCCCATTGCGTTGTTCGGGGTGTTGCGTGCTGGGTTGGTGGTGGTCAATGTGAACCCGCTTTATACGCCGCG > 1/529719‑530195 | cccTGACGACATTTATGACTACGCACCGTTTTACCCTTACGGCTGGGGATTTTCGTCCCGCTTCTTTTGGGCTGAACCGCGCGTGCGCTATAATTTATATTAATTAACCCGATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAAc < 1:356139/251‑1 (MQ=255) acATTTATGACTACGCACCGTTTTACCCTTACGGCTGGGGATTTTCGTCCCGCTTCTTTTGGGCTGAACCGCGCGTGCGCTATAATTTATATTAATTAACCCGATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGAt < 1:755904/251‑1 (MQ=255) aTTTATGACTACGCACCGTTTTACCCTTACGGCTGGGGATTTTCGTCCCGCTTCTTTTGGGCTGAACCGCGCGTGCGCTATAATTTATATTAATTAACCCGATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCg > 1:544169/1‑251 (MQ=255) tGACTACGCACCGTTTTACCCTTACGGCTGGGGATTTTCGTCCCGCTTCTTTTGGGCTGAACCGCGCGTGCGCTATAATTTATATTAATTAACCCGATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCg > 1:551311/1‑251 (MQ=255) cACCGTTTTACCCTTACGGCTGGGGATTTTCGTCCCGCTTCTTTTGGGCTGAACCGCGCGTGCGCTATAATTTATATTAATTAACCCGATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTatat < 1:779077/250‑1 (MQ=255) gTTTTACCCTTACGGCTGGGGATTTTCGTCCCGCTTCTTTTGGGCTGAACCGCGCGTGCGCTATAATTTATATTAATTAACCCGATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAata > 1:374514/1‑251 (MQ=255) gTTTTACCCTTACGGCTGGGGATTTTCGTCCCGCTTCTTTTGGGCTGAACCGCGCGTGCGCTATAATTTATATTAATTAACCCGATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAata > 1:293141/1‑251 (MQ=255) ttttACCCTTACGGCTGGGGATTTTCGTCCCGCTTCTTTTGGGCTGAACCGCGCGTGCGCTATAATTTATATTAATTAACCCGATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAatat < 1:254370/251‑1 (MQ=255) ccTTACGGCTGGGGATTTTCGTCCCGCTTCTTTTGGGCTGAACCGCGCGTGCGCTATAATTTATATTAATTAACCCGATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCaa < 1:814534/251‑1 (MQ=255) gggATTTTCGTCCCGCTTCTTTTGGGCTGAACCGCGCGTGCGCTATAATTTATATTAATTAACCCGATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACg < 1:45654/250‑1 (MQ=255) gggATTTTCGTCCCGCTTCTTTTGGGCTGAACCGCGCGTGCGCTATAATTTATATTAATTAACCCGATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACg < 1:526814/250‑1 (MQ=255) gggATTTTCGTCCCGCTTCTTTTGGGCTGAACCGCGCGTGCGCTATAATTTATATTAATTAACCCGATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACg < 1:208328/250‑1 (MQ=255) ggATTTTCGTCCCGCTTCTTTTGGGCTGAACCGCGCGTGCGCTATAATTTATATTAATTAACCCGATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAata < 1:368423/232‑1 (MQ=255) gAACCGCGCGTGCGCTATAATTTATATTAATTAACCCGATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTa > 1:580628/1‑202 (MQ=255) gAACCGCGCGTGCGCTATAATTTATATTAATTAACCCGATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTg > 1:607847/1‑250 (MQ=255) cTATAATTTATATTAATTAACCCGATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAata > 1:762461/1‑191 (MQ=255) cTATAATTTATATTAATTAACCCGATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACg < 1:614631/208‑1 (MQ=255) aaTTTATATTAATTAACCCGATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCa > 1:614456/1‑251 (MQ=255) aaTTTATATTAATTAACCCGATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCAGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGc > 1:545082/1‑173 (MQ=255) atatTAATTAACCCGATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATg > 1:207556/1‑251 (MQ=255) atatTAATTAACCCGATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATg > 1:816207/1‑251 (MQ=255) taattaaCCCGATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGAt < 1:807398/159‑1 (MQ=255) gATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGc > 1:589375/1‑173 (MQ=255) tAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGc > 1:381062/1‑164 (MQ=255) tAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGAt > 1:816320/1‑251 (MQ=255) tCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAata < 1:307255/149‑1 (MQ=255) tCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGc > 1:139038/1‑154 (MQ=255) tCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAg > 1:13511/1‑232 (MQ=255) tCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAg > 1:802035/1‑232 (MQ=255) tCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCAt > 1:443640/1‑251 (MQ=255) tCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCAt > 1:409795/1‑251 (MQ=255) cccTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCAtt > 1:98915/1‑251 (MQ=255) cccTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCAtt > 1:23047/1‑251 (MQ=255) aaGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAatg < 1:728321/251‑1 (MQ=255) aaGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAatg < 1:64981/251‑1 (MQ=255) aaGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAatg < 1:591901/251‑1 (MQ=255) aaGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAAT‑CGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAatga > 1:824185/1‑251 (MQ=255) gAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAatga < 1:689462/249‑1 (MQ=255) gAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAatga < 1:499795/249‑1 (MQ=255) gAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAatg < 1:696409/248‑1 (MQ=255) ggAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAatga < 1:758193/239‑1 (MQ=255) tGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAATGATGCCGAATTTGCTGCAATATcc < 1:309892/251‑1 (MQ=255) tttAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAATGATGCCGAATTTGCTGCAATATCCCAt < 1:200211/251‑1 (MQ=255) gAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAAc > 1:279686/1‑76 (MQ=255) aaGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAATGATGCCGAATTTGCTGCAATATCCCATTGCGTTGTTCGGGgt < 1:530831/250‑1 (MQ=255) ccAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAATGATGCCGAATTTGCTGCAATATCCCATTGCGTTGTTCGGGGTGTTGCGTGCTGGGt > 1:633859/1‑251 (MQ=255) ccAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTACATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAATGATGCCGAATTTGCTGCAATATCCCATTGCGTTGTTCGGGGTGTTGCGTGCTGGGt < 1:448483/251‑1 (MQ=255) ttAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAatg < 1:166067/192‑1 (MQ=255) acacCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAATGATGCCGAATTTGCTGCAATATCCCATTGCGTTGTTCGGGGTGTTGCGTGCTGGGTtggtgg < 1:483744/249‑1 (MQ=255) acacCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCCATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAATGATGCCGAATTTGCTGCAATATCCCATTGCGTTGTTCGGGGTGTTGCGTGCTGGGTtggtgg < 1:35342/249‑1 (MQ=255) ccTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAATGATGCCGAATTTGCTGCAATATCCCATTGCGTTGTTCGGGGTGTTGCGTGCTGGGTTGGTGGTGGTc < 1:96922/251‑1 (MQ=255) ccTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTACTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAATGATGCCGAATTTGCTGCAATATCCCATTGCGTTGTTCGGGGTGTTGCGTGCTGGGTTggtggtggt > 1:229784/1‑250 (MQ=255) aaTACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAATGATGCCGAATTTGCTGCAATATCCCATTGCGTTGTTCGGGGTGTTGCGTGCTGGGTTGGTGGTGGTCAAtgt < 1:627613/250‑1 (MQ=255) cgattcgattTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAATGATGCCGAATTTGCTGCAATATCCCATTGCGTTGTTCGGGGTGTTGCGTGCTGGGTTGGTGGTGGTCAATGTGAAcc < 1:231005/251‑1 (MQ=255) attTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAata > 1:211431/1‑61 (MQ=255) attTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAg > 1:583341/1‑144 (MQ=255) ttAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGt > 1:282063/1‑96 (MQ=255) ttAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAatg < 1:870008/165‑1 (MQ=255) ttAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAATGATGCCGAATTTGCTGCAATATCCCATTGCGTTGTTCGGGGTGTTGCGTGCTGGGTTGGTGGTGGTCAATGTGAACCCGCTTTATAc < 1:838774/251‑1 (MQ=255) atatGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAATGATGCCGAATTTGCTGCAATATCCCATTGCGTTGTTCGGGGTGTTGCGTGCTGGGTTGGTGGTGGTCAATGTGAACCCGCTTTATAcgc < 1:839580/249‑1 (MQ=255) atatGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAATGATGCCGAATTTGCTGCAATATCCCATTGCGTTGTTCGGGGTGTTGCGTGCTGGGTTGGTGGTGGTCAATGTGAACCCGCTTTATAcgc < 1:666212/249‑1 (MQ=255) tGTTTGAAAAAGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGCTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAATGATGCCGAATTTGCTGCAATATCCCATTGCGTTGTTCGGGGTGTTGCGTGATGGGTTGGTGGTGGGCAATGTGAACCCGCTTTATACGCcgcg > 1:257194/1‑250 (MQ=255) aaaaaGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAatga < 1:287420/153‑1 (MQ=255) aaaaaGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAATGATGCCGAATTTGCTGCAATATCCCATTGCGTTGTTCGGGGTGTTGCGTGCTGGGTTGGTGGTGGTCAATGTGAAcc > 1:210965/1‑228 (MQ=255) aaaaaGCGGTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAATGATGCCGAATTTGCTGCAATATCCCATTGCGTTGTTCGGGGTGTTGCGTGCTGGGTTGGTGGTGGTCAATGTGAACCCGCTTTATAc < 1:626824/238‑1 (MQ=255) gTGCGCGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAATGATGCCGAATTTGCTGCAATATCCCATTg > 1:885463/1‑172 (MQ=255) | CCCTGACGACATTTATGACTACGCACCGTTTTACCCTTACGGCTGGGGATTTTCGTCCCGCTTCTTTTGGGCTGAACCGCGCGTGCGCTATAATTTATATTAATTAACCCGATTAACAATAACCAAACTTCCCTAAGGAACGGCAATGGAAAAACTTTGGTTTAAAAATTATCCGGAAGGTGCGGAGCGCCAATTAGACACCTCGGAATACGATTCGATTTTAGATATGTTTGAAAAAGCGGTGCGAGAACATCCCGATCGTGCCGCTTATATTAATATGGGCAAGGTGTTGACGTTTCGCAAATTGGAAGAACGTAGCCGTGCTTTCGCTGCCTATTTGCAAAATGAATTGAAATTGGAGCGCGGCGATCGCGTGGCATTAATGATGCCGAATTTGCTGCAATATCCCATTGCGTTGTTCGGGGTGTTGCGTGCTGGGTTGGTGGTGGTCAATGTGAACCCGCTTTATACGCCGCG > 1/529719‑530195 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |