| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 524,065 | A→G | F95F (TTT→TTC) | unknown ← | Thioredoxin reductase (EC 1.8.1.9) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 524,065 | 0 | A | G | 100.0% | 220.8 / NA | 79 | F95F (TTT→TTC) | unknown | Thioredoxin reductase (EC 1.8.1.9) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (33/46); total (33/46) | |||||||||||
ATCAAATGCACTTCGCTGGCAATATTGGCTAAATACAAAGCTTCTTCGACCGCCGTATTGCCACCGCCGATCACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTAAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCTTGTTGTAAACCGGTTACTAATAACGGTTTCAAATTAGCGCGTGCCGCATAAATCGCAGCAGTATAGCCGGCAGG > 1/523826‑524304 | aTCAAATGCACTTCGCTGGCAATATTGGCTAAATACAAAGCTTCTTCGACCGCCGTATTGCCACCGCCGATCACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCgggg > 1:654436/1‑250 (MQ=255) ccccTTCGCGGGAAATATTGGCTAAATAAAAAGCTTCTCCGCCCGCCGTATTGCCACCGCCGATCACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGa < 1:749313/248‑1 (MQ=255) atatTGGCTAAATACAAAGCTTCTTCGACCGCCGTATTGCCACCGCCGATCACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAat > 1:879085/1‑251 (MQ=255) ttttgcaaaaaTAAAAAGTTTCTTCGACCGCCGTATTGCCACCGCCGATCACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAata < 1:868370/243‑1 (MQ=255) ttggcaaaaaaaaaaGCTTCTTCGCCCGCCGTATTGCCACCGCCGATCACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATg < 1:354196/239‑1 (MQ=255) ttggaaaaaaaaaaggcttctcggACCGCCGTATTGCCACCGCCGATCACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATg < 1:40147/228‑1 (MQ=255) tgggcaaaaTACAAGGTTTTTTCGACGGCCGTATTGCCACCGCCGATCACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATg < 1:787139/245‑1 (MQ=255) tgggcaaaaTACAAAGTTTCTCCGCCCGCCGTATTGCCACCGCCGATCACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATg < 1:653534/245‑1 (MQ=255) gCTAAAAAAAAAGCTTCTTCGACCGCCGTATTGCCACCGCCGATCACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGAt < 1:71776/250‑1 (MQ=255) aaaTACAAAGCTTCTTCGACCGCCGTATTGCCACCGCCGATCACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGaa > 1:716766/1‑251 (MQ=255) aTACAAAGCTTCTTCGACCGCCGTATTGCCACCGCCGATCACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGa > 1:286865/1‑251 (MQ=255) aaaaaaccttcttCGACCGCCGTATTGCCACCGCCGATCACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGAc < 1:60054/244‑1 (MQ=255) aaGCTTCTTCGACCGCCGTATTGCCACCGCCGATCACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAAtt > 1:154547/1‑251 (MQ=255) cttttttcGCCCGCCGTATTGCCACCGCCGATCACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTc < 1:270836/246‑1 (MQ=255) ttcttcGACCGCCGTATTGCCACCGCCGATCACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCg < 1:11186/251‑1 (MQ=255) ccgTATTGCCACCGCCGATCACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATg < 1:298907/223‑1 (MQ=255) tATTGCCACCGCCGATCACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTc < 1:683414/250‑1 (MQ=255) aTCACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCAt < 1:20178/251‑1 (MQ=255) tCACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAacac > 1:227582/1‑195 (MQ=255) tCACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCAtt > 1:415140/1‑251 (MQ=255) caccgCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAGAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCAtt > 1:217508/5‑250 (MQ=255) cACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAacac < 1:824590/194‑1 (MQ=255) cACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAata > 1:896733/1‑202 (MQ=255) cACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTc < 1:645295/251‑1 (MQ=255) cTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGAc > 1:663322/1‑211 (MQ=255) gCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTg > 1:67019/1‑251 (MQ=255) ggCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAatat > 1:570114/1‑193 (MQ=255) ggCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAatat < 1:119375/193‑1 (MQ=255) ggCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGAt > 1:224258/1‑196 (MQ=255) ggCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAg < 1:416775/201‑1 (MQ=255) ggCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATc < 1:173803/249‑1 (MQ=255) gCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATc < 1:862627/248‑1 (MQ=255) cGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGAc < 1:694833/250‑1 (MQ=255) aaaaGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTa > 1:649483/1‑251 (MQ=255) aaGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGggagg < 1:634157/157‑1 (MQ=255) aaTCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTc < 1:290904/251‑1 (MQ=255) gTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATc > 1:639315/1‑226 (MQ=255) gTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGa > 1:99629/1‑251 (MQ=255) gTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGa > 1:307531/1‑251 (MQ=255) caGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATc > 1:147214/1‑222 (MQ=255) aCGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAAt < 1:270077/251‑1 (MQ=255) ccACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAAttt > 1:478025/1‑250 (MQ=255) ccTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTc > 1:15069/1‑170 (MQ=255) ttGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACgg > 1:238787/1‑129 (MQ=255) ttGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCAt < 1:586557/182‑1 (MQ=255) tAGCTTTCATCGGTCGTTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGtagt < 1:487207/251‑1 (MQ=255) tcttcGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTg < 1:826104/251‑1 (MQ=255) ttcGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGAc < 1:121845/251‑1 (MQ=255) aaTCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCttgttg < 1:591597/251‑1 (MQ=255) aaTCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCttgttg < 1:658864/251‑1 (MQ=255) aTCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATc < 1:397431/100‑1 (MQ=255) ccAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGtagtt > 1:247674/1‑230 (MQ=255) cAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAGTTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCTTGTTGTAAAc < 1:818883/251‑1 (MQ=255) cAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCTTGTTGTAAAc < 1:626783/251‑1 (MQ=255) aTAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCTTGTTGTAAACCgg < 1:587423/251‑1 (MQ=255) cggAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCTTGTTGTAAACCGGTTACtaa < 1:588053/250‑1 (MQ=255) gCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCTTGTTGTAAACCGGTTACTAATAACg < 1:577817/250‑1 (MQ=255) gCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCTTGTTGTAAACCGGTTACTAATAACg < 1:586535/250‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCTTGTTGTAAACCGGTTACTAATAACgg < 1:727159/250‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCTTGTTGTAAACCGGTTACTAATAACgg < 1:687717/250‑1 (MQ=255) cACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCTTGTTGTAAACCGGTTACTAATAACGGt < 1:692210/251‑1 (MQ=255) tGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCTTGTTGTAAACCGGTTACTAATAACGGTTTCaaa < 1:717578/251‑1 (MQ=255) gCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCTTGTTGTAAACCGGTTACTAATAACGGTTTCAAAtt > 1:301580/1‑251 (MQ=255) tAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCTTGTTGTAAACCGGTTACTAATAACGGTTTCAAATTAgcg < 1:62671/251‑1 (MQ=255) aaTTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCTTGTTGTAAACCGGTTACTAATAACGGTTTCAAATTAgcg > 1:760931/1‑250 (MQ=255) cATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCTTGTTGTAAACCGGTTACTAATAACGGTTTCAAATTAGCGCGTGCCGCa > 1:201325/1‑251 (MQ=255) tCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCTTGTTGTAAAc < 1:689256/211‑1 (MQ=255) caGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCAt > 1:93802/1‑113 (MQ=255) gCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCTtgttgt > 1:403494/1‑202 (MQ=255) gCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCTTGTTGTAAAc > 1:731203/1‑206 (MQ=255) cTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCTTGTTGTAAACCGGTTACTAATAACGGTTTCAAATTAGCGCGTGCCGCATAAAt < 1:80025/248‑1 (MQ=255) aGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCTTGTTGTAAACCGGTTACTAATAACGGTTTCAAATTAGCGCGTGCCGCATAAATCgcagca > 1:584305/1‑251 (MQ=255) tCACCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAAt > 1:742936/1‑152 (MQ=255) aCCGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCTTGTTGTAAACCGGTTACTAATAACgg > 1:739611/1‑204 (MQ=255) ccGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTTCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGtagttagt < 1:526442/168‑1 (MQ=255) ccGTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCTTGTTGTAAACCGGTTACTAATAACGGTTTCAAATTAGCGCGTGCCGCATAAATCGCAGCAGTATAGCCGGCAgg > 1:584435/1‑251 (MQ=255) gTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCAt > 1:551288/1‑90 (MQ=255) gTATAATTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGtt < 1:91871/118‑1 (MQ=255) aTTTGAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCTTGTTGTAAACCGGTTACTAATAACg < 1:594198/195‑1 (MQ=255) | ATCAAATGCACTTCGCTGGCAATATTGGCTAAATACAAAGCTTCTTCGACCGCCGTATTGCCACCGCCGATCACTGCAACAGGCTTATTGCGATAAAAGAATCCGTCACAGGTGGCACAGGCAGAAACGCCACGACCTTTGTAGCTTTCTTCGGTCGGTAATCCCAAATAGCGGGCGGAGGCACCGGTGGCGATAATTAACGCATCACAGCTAAAGGTTTGAGCATCACCGTATAATTTAAATGGGCGGGAGGAAAGATCAACACGGTTAATATGATCGAAGACAATTTCCGTCTCGAATTTTTCTGCGTGTTGTAGCATTCTTTGCATCAGTTCCGGACCGGTAGTTTCACCGAAATCGCCCGGCCAGTTTTCAATTTCATTGGTGGTAGTTAGTTGACCGCCTTGTTGTAAACCGGTTACTAATAACGGTTTCAAATTAGCGCGTGCCGCATAAATCGCAGCAGTATAGCCGGCAGG > 1/523826‑524304 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |