| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 519,975 | C→T | R518Q (CGG→CAG) | unknown ← | Efflux ABC transporter for glutathione/L‑cysteine, essential for assembly of bd‑type respiratory oxidases => CydC subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 519,975 | 0 | C | T | 100.0% | 206.9 / NA | 77 | R518Q (CGG→CAG) | unknown | Efflux ABC transporter for glutathione/L‑cysteine, essential for assembly of bd‑type respiratory oxidases => CydC subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (37/40); total (37/40) | |||||||||||
TCAGAATTTTCGTGTGCCGAGATCAAGCCGGGAAGGTTTCCACCTTTCCAGCCTTCCCAATTAAATGCGTTGTGTCAATTGCTTGAAAAAGCCATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCCGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGCCTTGTTCCTGATTCACGAGTTTTTCCAAGCCCACTTGTTGTAGCACGGCAAGCATTTTTTCATCGCTCAACGGAGCATGATTGGCA > 1/519734‑520217 | tCAGAATTTTCGTGTGCCGAGATCAAGCCGGGAAGGTTTCCACCTTTCCAGCCTTCCCAATTAAATGCGTTGTGTCAATTGCTTGAAAAAGCCATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAAt < 1:287517/249‑1 (MQ=255) aaTTTTCGTGTGCCGAGATCAAGCCGGGAAGGTTTCCACCTTTCCAGCCTTCCCAATTAAATGCGTTGTGTCAATTGCTTGAAAAAGCCATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGc < 1:63894/250‑1 (MQ=255) aTTTTCGTGTGCCGAGATCAAGCCGGGAAGGTTTCCACCTTTCCAGCCTTCCCAATTAAATGCGTTGTGTCAATTGCTTGAAAAAGCCATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGt > 1:538683/1‑251 (MQ=255) gtgCCGAGATCAAGCCGGGAAGGTTTCCACCTTTCCAGCCTTCCCAATTAAATGCGTTGTGTCAATTGCTTGAAAAAGCCATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGt < 1:7234/243‑1 (MQ=255) ccGGGAAGGTTTCCACCTTTCCAGCCTTCCCAATTAAATGCGTTGTGTCAATTGCTTGAAAAAGCCATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAAcc < 1:433003/249‑1 (MQ=255) ccGGGAAGGTTTCCACCTTTCCAGCCTTCCCAATTAAATGCGTTGTGTCAATTGCTTGAAAAAGCCATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAAcc < 1:245158/249‑1 (MQ=255) aGGTTTCCACCTTTCCAGCCTTCCCAATTAAATGCGTTGTGTCAATTGCTTGAAAAAGCCATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCCTAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTg > 1:432628/1‑251 (MQ=255) ggTTTCCACCTTTCCAGCCTTCCCAATTAAATGCGTTGTGTCAATTGCTTGAAAAAGCCATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTgg > 1:740365/1‑251 (MQ=255) gTTTCCACCTTTCCAGCCTTCCCAATTAAATGCGTTGTGTCAATTGCTTGAAAAAGCCATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTgg > 1:106383/1‑250 (MQ=255) tttCCACCTTTCCAGCCTTCCCAATTAAATGCGTTGTGTCAATTGCTTGAAAAAGCCATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCt < 1:560141/251‑1 (MQ=255) tttCCACCTTTCCAGCCTTCCCAATTAAATGCGTTGTGTCAATTGCTTGAAAAAGCCATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCt < 1:326763/251‑1 (MQ=255) cACCTTTCCAGCCTTCCCAATTAAATGCGTTGTGTCAATTGCTTGAAAAAGCCATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATc < 1:747234/251‑1 (MQ=255) ccTTTCCAGCCTTCCCAATTAAATGCGTTGTGTCAATTGCTTGAAAAAGCCATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTa > 1:634963/1‑251 (MQ=255) tCCCAATTAAATGCGTTGTGTCAATTGCTTGAAAAAGCCATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCg > 1:658129/1‑251 (MQ=255) cAATTAAATGCGTTGTGTCAATTGCTTGAAAAAGCCATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAg < 1:755310/240‑1 (MQ=255) gCGTTGTGTCAATTGCTTGAAAAAGCCATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTa > 1:139362/1‑251 (MQ=255) tgtgTCAATTGCTTGAAAAAGCCATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGTGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAg < 1:484926/251‑1 (MQ=255) tgtgTCAATTGCTTGAAAAAGCCATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAg < 1:111216/251‑1 (MQ=255) tGCTTGAAAAAGCCATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGc < 1:495365/251‑1 (MQ=255) cTTGAAAAAGCCATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGcc < 1:144053/250‑1 (MQ=255) gCCATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAg > 1:283634/1‑231 (MQ=255) gCCATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTACCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCaaa > 1:409952/1‑250 (MQ=255) ccATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAAc < 1:53396/250‑1 (MQ=255) gATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACgg < 1:315829/238‑1 (MQ=255) aTTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCAccgc < 1:630934/250‑1 (MQ=255) aaTCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGAt < 1:46798/251‑1 (MQ=255) aTCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACC‑TCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAg > 1:839660/1‑209 (MQ=255) gATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCAc < 1:188346/150‑1 (MQ=255) gATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGga > 1:355903/1‑251 (MQ=255) cACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGgacgac < 1:411699/249‑1 (MQ=255) aCCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGAccg > 1:750876/1‑250 (MQ=255) ttGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTc < 1:806310/225‑1 (MQ=255) gTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCAc > 1:299648/1‑138 (MQ=255) cAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCg > 1:570676/1‑124 (MQ=255) ttaattGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAAc < 1:199933/251‑1 (MQ=255) aattGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGc < 1:351813/186‑1 (MQ=255) gattgTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATaaa > 1:765268/1‑251 (MQ=255) ttgTTATCAATCATGACCAACTGATAAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATc < 1:496397/251‑1 (MQ=255) gTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATc > 1:548425/1‑249 (MQ=255) ttATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCaa > 1:878886/1‑251 (MQ=255) tcaatcaTGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGCTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGcc < 1:252654/251‑1 (MQ=255) aatcaTGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATc > 1:104834/1‑243 (MQ=255) atcaTGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCg > 1:109573/1‑231 (MQ=255) atcaTGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGCCTTg > 1:81708/1‑251 (MQ=255) atcaTGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGCCTTg > 1:51995/1‑251 (MQ=255) gACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATc > 1:174280/1‑237 (MQ=255) cAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGCCTTGTTCCTGAt < 1:257950/251‑1 (MQ=255) gATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAAcc > 1:564727/1‑112 (MQ=255) gATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTa > 1:527556/1‑129 (MQ=255) gATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCAcc < 1:889095/161‑1 (MQ=255) gATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAAc > 1:188213/1‑177 (MQ=255) gATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGCCTTGTTCCTGATTCACg > 1:234365/1‑251 (MQ=255) gATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGCCTTGTTCCTGATTCACg > 1:818665/1‑251 (MQ=255) gATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCACAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAg < 1:391533/157‑1 (MQ=255) ttGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCAccgc > 1:447903/1‑185 (MQ=255) gTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGCCTTGTTCCTGATTCACGAGTTTTTc > 1:43663/1‑250 (MQ=255) cGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGCCTTGTTCCTGATTCACGAGTTTTTCCAAGCCCa > 1:507936/1‑249 (MQ=255) cGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGCCTTGTTCCTGATTCACGAGTTTTTCCAAGCCCa > 1:152015/1‑249 (MQ=255) gTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGCCTTGTTCCTGATTCACGAGTTTTTCCAAGCCCACtt < 1:12685/250‑1 (MQ=255) ttAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGCCTTGTTCCTGATTCACGAGTTTTTCCAAGCCCACttg < 1:597605/250‑1 (MQ=255) aaGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGCCTTGTTCCTGATTCACGAGTTTTTCCAAGCCCACttgttg < 1:605724/251‑1 (MQ=255) aGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGCCTTGTTc < 1:840663/217‑1 (MQ=255) tGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGCCTTGTTCCTGATTCACGAGTTTTTCCAAGCCCACTTGTTGTAGCa < 1:72880/250‑1 (MQ=255) tCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAACCCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCCCCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGCCTTGTTCCTGATTCACGAGTTTTTCCAAGCCCACTTGTTGTAGCa < 1:115009/246‑1 (MQ=255) ccATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCgg < 1:93484/106‑1 (MQ=255) aattaatGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGTATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCt > 1:689948/1‑83 (MQ=255) aattaatGTTTTCCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAAt < 1:249500/115‑1 (MQ=255) aatGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGCCTTGTTCCTGATTCACGAGTTTTTCCAAGCCCACTTGTTGTAGCACGGCAAGCATTTTTTc < 1:884153/251‑1 (MQ=255) ttCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAg < 1:893039/82‑1 (MQ=255) ttCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATcc < 1:302664/179‑1 (MQ=255) ttCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGc > 1:456847/1‑183 (MQ=255) ttCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGCCTTGTTCCTGATTCACGAGTTTTTCCAAGCCCACttg > 1:808668/1‑220 (MQ=255) gtgCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGCCTTGTTCCTGATTCACGAGTTTTTCCAAGCCCACTTGTTGTAGCACGGCAAGCATTTTTTCATCGCTCAACGGAGCATGa > 1:21455/1‑251 (MQ=255) gtgCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGCCTTGTTCCTGATTCACGAGTTTTTCCAAGCCCACTTGTTGTAGCACGGCAAGCATTTTTTCATCGCTCAACGGAGCATGa > 1:85137/1‑251 (MQ=255) gtgCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGCCTTGTTCCTGATTCACGAGTTTTTCCAAGCCCACTTGTTGTAGCACGGCAAGCATTTTTTCATCGCTCAACGGAGCATGa > 1:46/1‑251 (MQ=255) tgCCAAAATTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCGCGATCCAACCCTTCCGTGGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCCCCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGCCTTGTTCCTGATTCACGAGTTTTTCCAAGCCCACTTGTTGTAGCACGGCAAGCATTTTTTCATCGCTCAACGGAGCATGAt < 1:669603/251‑1 (MQ=255) aaaTTGCCTGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAACCCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGCCTTGTTCCTGATTCACGAGTTTTTCCAAGCCCACTTGTTGTAGCACGGCAAGCATTTTTTCATCGCTCAACGGAGCATGATTGGCa < 1:343260/251‑1 (MQ=255) | TCAGAATTTTCGTGTGCCGAGATCAAGCCGGGAAGGTTTCCACCTTTCCAGCCTTCCCAATTAAATGCGTTGTGTCAATTGCTTGAAAAAGCCATTTTCTTTACTGATTAAATCCAGATAAGCACCTTGTTCAATTAATTGATTGTTATCAATCATGACCAACTGATCAAATTGTTCAATAGCGGTTAAGCGGTGCGTCACCATAATTAATGTTTTTCCACGGCTGTGTGCCAAAATTGCCCGCAGAATGTGGCGTTCCGTTTCACGATCCAAACCTTCCGTTGGCTCATCTAACAGTAAAATCGGTGCGTCATTTAATAGCACCCGAGCCAAGCCCAAACGGCGTTGTTCACCGCCGGATAACGGACGACCGCCGTCACCGAACCATAAATCCAAGCCTTGTTCCTGATTCACGAGTTTTTCCAAGCCCACTTGTTGTAGCACGGCAAGCATTTTTTCATCGCTCAACGGAGCATGATTGGCA > 1/519734‑520217 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |