| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 518,126 | T→C | R164R (CGT→CGC) | unknown → | Serine/threonine protein kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 518,126 | 0 | T | C | 100.0% | 192.5 / NA | 74 | R164R (CGT→CGC) | unknown | Serine/threonine protein kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (31/43); total (31/43) | |||||||||||
TAAAGATTATCTGGTGCTGGAAGATGGTGGCAAAAGCGTAGCAAATTGGGTTGACGATAATATCCCAACGCAAACCAAACAACAGATTCTGCTGGATTGTGCTAAAGCCTTGGCGCAGTTACATCAACAGGGATTGGTGCATGGGCGCCCGGCGATTCGGGATATTTTATGGCATGACGGCAGGGTGTTA‑TTTATTGACTTTGAAGTGGACGCAACAAAACGGAACTTACCTCGTCAGAAAGTGCGTGATTTGATTTTGTTTATTTATAATTTATGTCGTGAGGAAAATATTTCCGATGAAACTGTCCGCACGGTTATGCGCGGTTATGAACAGGATTGTGAACCTCAAGAGTGGCAGGATATGATGTCTTCCGTATGCCATTATCGTTTTTTGTATTATTTATTATTGCCGTTTAAATATATTGCTAAAAAAGATTTAATCGGGGTGTATCGTTTATTTAGAAATGTGGAAAAAGTGAAAAGAGG > 1/517880‑518365 | tAAAGATTATCTGGTGCTGGAAGATGGTGGCAAAAGCGTAGCAAATTGGGTTGACGATAATATCCCAACGCAAACCAAACAACAGATTCTGCTGGATTGTGCTAAAGCCTTGGCGCAGTTACATCAACAGGGATTGGTGCATGGGCGCCCGGCGATTCGGGATATTTTATGGCATGACGGCAGGGTGTTA‑TTTATTGACTTTGAAGTGGACGCAACAAAACGGAACTTACCTCGTCAGAAAGTGCGcgat < 1:222667/250‑1 (MQ=255) 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TAAAGATTATCTGGTGCTGGAAGATGGTGGCAAAAGCGTAGCAAATTGGGTTGACGATAATATCCCAACGCAAACCAAACAACAGATTCTGCTGGATTGTGCTAAAGCCTTGGCGCAGTTACATCAACAGGGATTGGTGCATGGGCGCCCGGCGATTCGGGATATTTTATGGCATGACGGCAGGGTGTTA‑TTTATTGACTTTGAAGTGGACGCAACAAAACGGAACTTACCTCGTCAGAAAGTGCGTGATTTGATTTTGTTTATTTATAATTTATGTCGTGAGGAAAATATTTCCGATGAAACTGTCCGCACGGTTATGCGCGGTTATGAACAGGATTGTGAACCTCAAGAGTGGCAGGATATGATGTCTTCCGTATGCCATTATCGTTTTTTGTATTATTTATTATTGCCGTTTAAATATATTGCTAAAAAAGATTTAATCGGGGTGTATCGTTTATTTAGAAATGTGGAAAAAGTGAAAAGAGG > 1/517880‑518365 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |