| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 517,507 | C→T | H192Y (CAT→TAT) | unknown → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 517,507 | 0 | C | T | 100.0% | 229.8 / NA | 85 | H192Y (CAT→TAT) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (41/44); total (41/44) | |||||||||||
CGGCAAACCAAGCACAAAAAGCCTTAGTCGCCGAAGCCATGAAACTGTACAAAATGTTGGGTTCAAACAATGCGGATAAAGGCGTGGTTAACGTGAAAACCGGTAACGATGCTAAATTAAATTACCTTTGTATTGCAAAAATTCAACAGGTGGCACAAACTTCACGCGTATTTCGTAGTTCTGCTAACCACGCTAACAGCAATTCCCGCTTAACTGCTGATGTGCGTTTAAACGGTAATCGGTTCCATAAAATGGATTGCCGGTTGGCCGGCAACCGGGTTGCAAAATTAAGTTTAATTAAGAAATAACCGGCAGGATTGCACAAAAAGTGCGGTTAATTTTGACCGCACTTTTCTTTTATAGGGATTCTATTATGTCAGACTCAGTGACGTTTTCTTTTGCGCAATATGTTCAGCGGCTCTTAGCAGAACATAAAGGGGAGCGGGTCTATTA‑TTTTACCTACGGGAACAAAAATTATTGGCTGAAACAAC > 1/517262‑517752 | cgGCAAACCAAGCACAAAAAGCCTTAGTCGCCGAAGCCATGAAACTGTACAAAATGTTGGGTTCAAACAATGCGGATAAAGGCGTGGTTAACGTGAAAACCGGTAACGATGCTAAATTAAATTACCTTTGTATTGCAAAAATTCAACAGGTGGGACAAACTTCACGCGTATTTCGTAGTTCTGCTAACCACGCTAACAGCAATTCCCGCTTAACTGCTGATGTGCGTTTAAACGGTAAGCGGTTCTATaa < 1:78915/250‑1 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> 1:603820/1‑250 (MQ=255) | CGGCAAACCAAGCACAAAAAGCCTTAGTCGCCGAAGCCATGAAACTGTACAAAATGTTGGGTTCAAACAATGCGGATAAAGGCGTGGTTAACGTGAAAACCGGTAACGATGCTAAATTAAATTACCTTTGTATTGCAAAAATTCAACAGGTGGCACAAACTTCACGCGTATTTCGTAGTTCTGCTAACCACGCTAACAGCAATTCCCGCTTAACTGCTGATGTGCGTTTAAACGGTAATCGGTTCCATAAAATGGATTGCCGGTTGGCCGGCAACCGGGTTGCAAAATTAAGTTTAATTAAGAAATAACCGGCAGGATTGCACAAAAAGTGCGGTTAATTTTGACCGCACTTTTCTTTTATAGGGATTCTATTATGTCAGACTCAGTGACGTTTTCTTTTGCGCAATATGTTCAGCGGCTCTTAGCAGAACATAAAGGGGAGCGGGTCTATTA‑TTTTACCTACGGGAACAAAAATTATTGGCTGAAACAAC > 1/517262‑517752 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |