| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 507,676 | C→T | G198G (GGC→GGT) | unknown → | O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase RfbN |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 507,676 | 0 | C | T | 100.0% | 154.4 / NA | 58 | G198G (GGC→GGT) | unknown | O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase RfbN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (36/22); total (36/22) | |||||||||||
ATGGTAAACAGTTGCCACACGCTAATTCCACGCCTGTTGCCGCTCACGCACGCTATTTTAATTACCCGGCGCAATCGAAATTAAAATCAAAAGCAGATATTCCCTCTTTAGGCATTAAAACGGCTTTTATGTCGAACTCTTTTGCGGCGTATCGTCGCTCGGTGTTTGAAGAACTTGGGGGCTTTCCTGATAATACAATTTTAGCGGAAGATATGTACTTAACCGCCAAAATGGTGTTAGCAGGCTATAAAGTTGCCTATTGTGCGGAAGCAACGGTATTTCATAGCCACAACTATACCTTAAGCCAGGAATTACAACGCTATTTTGACACAGGCGTGTTTCAGCAAGAACAAGGGTGGATTCAGCAAACCTTTGGAAAAATGGCTTCAGAAGGAAAGAAGTTTGTGCTTTCTGAACTCAAATTTCTTGTAAAAAATGCACCGCACTTGTTACCCAAAGCCTTGCTATCAACCTTTGCCAAATG > 1/507432‑507915 | aTGGTAAACAGTTGCCACACGCTAATTCCACGCCTGTTGCCGCTCACGCACGCTATTTTAATTACCCGGCGCAATCGAAATTAAAATCAAAAGCAGATATTCCCTCTTTAGGCATTAAAACGGCTTTTATGTCGAACTCTTTTGCGGCGTATCGTCGCTCGGTGTTTGAAGAACTTGGGGGCTTTCCTGATAATACAATTTTAGCGGAAGATATGTACTTAACCGCCAAAATGGTGTTAGCAGGTTATaaa > 1:31240/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |