| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 501,871 | T→C | F124F (TTT→TTC) | unknown → | DNA for glycosyltransferase, lytic transglycosylase, dTDP‑4‑rhamnose reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 501,871 | 0 | T | C | 100.0% | 74.8 / NA | 27 | F124F (TTT→TTC) | unknown | DNA for glycosyltransferase, lytic transglycosylase, dTDP‑4‑rhamnose reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (15/12); total (15/12) | |||||||||||
TAATTATTCAGCAAACCCACCTAAATTAAAACAATCAATTAATATAAGCTCTCCTAAAATAATTTGGTTTATTCCTGATTTTGGGATAGGTTCTGGAGGGCACCTTAATATCTTTAGAATGATTTATAATTTAGAAAAATTAGATATTCATTCAGATATTACTGTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTTTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGTAAATAAATTTAATAATTGCTATAAGAAAGCATACTTTGTGCAAGATTACGAACCATATTTTACTGCCTTAGGAAGTGTTTATTCTTTT > 1/501646‑502066 | taattaTTCAGCAAACCCACCTAAATTAAAACAATCAATTAATATAAGCTCTCCTAAAATAATTTGGTTTATTCCTGATTTTGGGATAGGTTCTGGAGGGCACCTTAATATCTTTAGAATGATTTATAATTTAGAAAAATTAGATATTCATTCAGATATTACTGTATGTAGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTa > 1:428894/1‑251 (MQ=255) cACCTAAATTAAAACAATCAATTAATATAAGCTCTCCTAAAATAATTTGGTTTATTCCTGATTTTGGGATAGGTTCTGGAGGGCACCTTAATATCTTTAGAATGATTTATAATTTAGAAAAATTAGATATTCATTCAGATATTACTGTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGAct > 1:146932/1‑249 (MQ=255) 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1:201816/1‑197 (MQ=255) gTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGTAAATAAATTTAATAATTGCTATAAGAAAGCATACTTTGTGCAAGATTACGAACCATATTTTACTGCCTTAGGAAGTGTTTa > 1:34799/1‑251 (MQ=255) gTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGTAAATAAATTTAATAATTGCTATAAGAAAGCATACTTTGTGCAAGATTACGAACCATATTTTACTGCCTTAGGAAGTGTTTATTCtttt > 1:229391/1‑251 (MQ=255) tCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGat < 1:304707/123‑1 (MQ=255) gATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCatat < 1:20901/130‑1 (MQ=255) aaGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGAttt > 1:809914/1‑70 (MQ=255) aaGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGt < 1:123466/130‑1 (MQ=255) aaGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGTAAATAAATTTAATAATTGCTATAAGAAAGCATACTTTGTGCAAGATTACGAACCATATTTTAc < 1:477416/193‑1 (MQ=255) | TAATTATTCAGCAAACCCACCTAAATTAAAACAATCAATTAATATAAGCTCTCCTAAAATAATTTGGTTTATTCCTGATTTTGGGATAGGTTCTGGAGGGCACCTTAATATCTTTAGAATGATTTATAATTTAGAAAAATTAGATATTCATTCAGATATTACTGTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTTTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGTAAATAAATTTAATAATTGCTATAAGAAAGCATACTTTGTGCAAGATTACGAACCATATTTTACTGCCTTAGGAAGTGTTTATTCTTTT > 1/501646‑502066 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |