| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 485,939 | T→A | G167G (GGA→GGT) | unknown ← | DNA ligase (ATP) (EC 6.5.1.1) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 485,939 | 0 | T | A | 100.0% | 168.7 / NA | 62 | G167G (GGA→GGT) | unknown | DNA ligase (ATP) (EC 6.5.1.1) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (23/39); total (23/39) | |||||||||||
ATACGTAATGACGGCGCCGATCGGGGGCGGGTTAATGCGATCATCCAACTTGAAACCCGAACCGATTTTGAATTGCCCTCGATGGTTTTCGCAAGTGAGCGATCCCATCACACTTTCAAACTGCCCTTTGCCTTTGTGGTGGGCGACAACGGTGCATTCTTCGTCAAGTGCGGTCTTTAATTTGAGTATTTGCGAACTGCGTTTTCTTTCGTAGGGCGCATTAGGATTGCGAATGACAATGCCTTCTCCTTTGAGCTGTTCCACCTGCTGCAAAAATTGCTGAATATGTTGTGGGCTCTCAATAGGAATCTGTTCAATAATTTCAATATAGTCGCTTGGGTTTTGCGCCAAATAGGTTTTTAATTGTGCCAAGCGGGCAAATAAGTCTCCTTCAGCGTCAGGCACATCAAAGACATACAGCTTTAATTTATTCCAGCCTTTGTCCTGATAAGCGCGAACAATAGAAGAAATGTCGGCAAATTGATCACGTT > 1/485693‑486183 | ataCGTAATGACGGCGCCGATCGGGGGCGGGTTAATGCGATCATCCAACTTGAAACCCGAACCGATTTTGAATTGCCCTCGATGGTTTTCGCAAGTGAGCGATCCCATCACACTTTCAAACTGCCCTTTGCCTTTGTGGTGGGCGACAACGGTGCATTCTTCGTCAAGTGCGGTCTTTAATTTGAGTATTTGCGAACTGCGTTTTCTTTCGTAGGGCGCATTAGGATTGCGAATGACAATGCCTTCACCtt < 1:344493/251‑1 (MQ=255) cGTAATGACGGCGCCGATCGGGGGCGGGTTAATGCGATCATCCAACTTGAAACCCGAACCGATTTTGAATTGCCCTCGATGGTTTTCGCAAGTGAGCGATCCCATCACACTTTCAAACTGCCCTTTGCCTTTGTGGTGGGCGACAACGGTGCATTCTTCGTCAAGTGCGGTCTTTAATTTGAGTATTTGCGAACTGCGTTTTCTTTCGTAGGGCGCATTAGGATTGCGAATGACAATGCCTTCACCTTTGa > 1:875722/1‑251 (MQ=255) cGTAATGACGGCGCCGATCGGGGGCGGGTTAATGCGATCATCCAACTTGAAACCCGAACCGATTTTGAATTGCCCTCGATGGTTTTCGCAAGTGAGCGATCCCATCACACTTTCAAACTGCCCTTTGCCTTTGTGGTGGGCGACAACGGTGCATTCTTCGTCAAGTGCGGTCTTTAATTTGAGTATTTGCGAACTGCGTTTTCTTTCGTAGGGCGCATTAGGATTGCGAATGACAATGCCTTCACCTTTGa > 1:800666/1‑251 (MQ=255) aTGACGGCGCCGATCGGGGGCGGGTTAATGCGATCATCCAACTTGAAACCCGAACCGATTTTGAATTGCCCTCGATGGTTTTCGCAAGTGAGCGATCCCATCACACTTTCAAACTGCCCTTTGCCTTTGTGGTGGGCGACAACGGTGCATTCTTCGTCAAGTGCGGTCTTTAATTTGAGTATTTGCGAACTGCGTTTTCTTTCGTAGGGCGCATTAGGATTGCGAATGACAATGCCTTCACCTTTGAGCTg < 1:869814/251‑1 (MQ=255) ccGATCGGGGGCGGGTTAATGCGATCATCCAACTTGAAACCCGAACCGATTTTGAATTGCCCTCGATGGTTTTCGCAAGTGAGCGATCCCATCACACTTTCAAACTGCCCTTTGCCTTTGTGGTGGGCGACAACGGTGCATTCTTCGTCAAGTGCGGTCTTTAATTTGAGTATTTGCGAACTGCGTTTTCTTTCGTAGGGCGCATTAGGATTGCGAATGACAATGCCTTCACCTTTGAGCTGTTCCACct < 1:617872/250‑1 (MQ=255) gATCGGGGGCGGGTTAATGCGATCATCCAACTTGAAACCCGAACCGATTTTGAATTGCCCTCGATGGTTTTCGCAAGTGAGCGATCCCATCACACTTTCAAACTGCCCTTTGCCTTTGTGGTGGGCGACAACGGTGCATTCTTCGTCAAGTGCGGTCTTTAATTTGAGTATTTGCGAACTGCGTTTTCTTTCGTAGGGCGCATTAGGATTGCGAATGACAATGCCTTCACCTTTGAGCTGTTCCAcc < 1:135635/247‑1 (MQ=255) aTCGGGGGCGGGTTAATGCGATCATCCAACTTGAAACCCGAACCGATTTTGAATTGCCCTCGATGGTTTTCGCAAGTGAGCGATCCCATCACACTTTCAAACTGCCCTTTGCCTTTGTGGTGGGCGACAACGGTGCATTCTTCGTCAAGTGCGGTCTTTAATTTGAGTATTTGCGAACTGCGTTTTCTTTCGTAGGGCGCATTAGGATTGCGAATGACAATGCCTTCACCTTTGAGCTGTTCCACctg > 1:281083/1‑248 (MQ=255) gTTAATGCGATCATCCAACTTGAAACCCGAACCGATTTTGAATTGCCCTCGATGGTTTTCGCAAGTGAGCGATCCCATCACACTTTCAAACTGCCCTTTGCCTTTGTGGTGGGCGACAACGGTGCATTCTTCGTCAAGTGCGGTCTTTAATTTGAGTATTTGCGAACTGCGTTTTCTTTCGTAGGGCGCATTAGGATTGCGAATGACAATGCCTTCACCTTTGAGCTGTTCCACCTGCTGCAAAAATTGc < 1:572336/250‑1 (MQ=255) catcCAACTTGAAACCCGAACCGATTTTGAATTGCCCTCGATGGTTTTCGCAAGTGAGCGATCCCATCACACTTTCAAACTGCCCTTTGCCTTTGTGGTGGGCGACAACGGTGCATTCTTCGTCAAGTGCGGTCTTTAATTTGAGTATTTGCGAACTGCGTTTTCTTTCGTAGGGCGCATTAGGATTGCGAATGACAATGCCTTCACCTTTGAGc > 1:636160/1‑215 (MQ=255) cAACTTGAAACCCGAACCGATTTTGAATTGCCCTCGATGGTTTTCGCAAGTGAGCGATCCCATCACACTTTCAAACTGCCCTTTGCCTTTGTGGTGGGCGACAACGGTGCATTCTTCGTCAAGTGCGGTCTTTAATTTGAGTATTTGCGAACTGCGTTTTCTTTCGTAGGGCGCATTAGGATTGCGAATGACAATGCCTTCACCTTTGAGCTGTTCCACCTGCTGCAAAAATTGCTGAATATGTTGTGGGc < 1:409151/251‑1 (MQ=255) 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aTCCCATCACACTTTCAAACTGCCCTTTGCCTTTGTGGTGGGCGACAACGGTGCATTCTTCGTCAAGTGCGGTCTTTAATTTGAGTATTTGCGAACTGCGTTTTCTTTCGTAGGGCGCATTAGGATTGCGAATGACAATGCCTTCACCTTTGAGCTGTTCCACCTGCTGCAAAAATTGCTGAATATGTTGTGGGCTCTCAATAGGAATCTGTTCAATAATTTCAATATAGTCGCTTGGGTTTTGCGCCaaa > 1:494394/1‑251 (MQ=255) tCCCATCACACTTTCAAACTGCCCTTTGCCTTTGTGGTGGGCGACAACGGTGCATTCTTCGTCAAGTGCGGTCTTTAATTTGAGTATTTGCGAACTGCGTTTTCTTTCGTAGGGCGCATTAGGATTGCGAATGACAATGCCTTCACCTTTGAGCTGTTCCACCTGCTGCAAAAATTGCTGAATATGTTGTGGGCTCTCAATAGGAATCTGTTCAATAATTTCAATATAGTCGCTTGGGTTTTGCGCCAAAt > 1:115632/1‑251 (MQ=255) cTTTCAAACTGCCCTTTGCCTTTGTGGTGGGCGACAACGGTGCATTCTTCGTCAAGTGCGGTCTTTAATTTGAGTATTTGCGAACTGCGTTTTCTTTCGTAGGGCGCATTAGGATTGCGAATGACAATGCCTTCACCTTTGAGCTGTTCCACCTGCTGCAAAAATTGCTGAATATGTTGTGGGCTCTCAATAGGAATCTGTTCaataa < 1:376494/208‑1 (MQ=255) 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1:711741/167‑1 (MQ=255) ttgcctttgTGGTGGGCGACAACGGTGCATTCTTCGTCAAGTGCGGTCTTTAATTTGAGTATTTGCGAACTGCGTTTTCTTTCGTAGGGCGCATTAGGATTGCGAATGACAATGCCTTCACCTTTGAGCTGTTCCACCTGCTGCAAAAATTGCTGAATATGTTGTGGGCTCTCAATAGGAATCTGTTCAATAATTTCAATATAGTCGCTTGGGTTTTGCGCCAAATAGGTTTTTAATTGTGCCAAGCggg > 1:716668/1‑250 (MQ=255) gcctttgTGGTGGGCGACAACGGTGCATTCTTCGTCAAGTGCGGTCTTTAATTTGAGTATTTGCGAACTGCGTTTTCTTTCGTAGGGCGCATTAGGATTGCGAATGACAATGCCTTCACCTTTGAGCTGTTCCACCTGCTGCAAAAATTGCTGAATATGTTGTGGGCTCTCAATAGGAATCTGTTCaataa > 1:452343/1‑191 (MQ=255) cctttgTGGTGGGCGACAACGGTGCATTCTTCGTCAAGTGCGGTCTTTAATTTGAGTATTTGCGAACTGCGTTTTCTTTCGTAGGGCGCATTAGGATTGCGAATGACAATGCCTTCACCTTTGAGCTGTTCCACCTGCTGCAAAAATTGCTGAATAtgtt < 1:264274/160‑1 (MQ=255) cAACGGTGCATTCTTCGTCAAGTGCGGTCTTTAATTTGAGTATTTGCGAACTGCGTTTTCTTTCGTAGGGCGCATTAGGATTGCGAATGACAATGCCTTCACCTTTGAGCTGTTCCACCTGCTGCAAAAATTGCTGAATATGTTGTGGGCTCTCAATAGGAATCTGTTCAATAATTTCAATATAGTCGCTTGGGTTTTGCGCCAAATAGGTTTTTAATTGTGCCAAGCGGGCAAATAAGTCTCCTTCAGCg < 1:470155/251‑1 (MQ=255) 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ATACGTAATGACGGCGCCGATCGGGGGCGGGTTAATGCGATCATCCAACTTGAAACCCGAACCGATTTTGAATTGCCCTCGATGGTTTTCGCAAGTGAGCGATCCCATCACACTTTCAAACTGCCCTTTGCCTTTGTGGTGGGCGACAACGGTGCATTCTTCGTCAAGTGCGGTCTTTAATTTGAGTATTTGCGAACTGCGTTTTCTTTCGTAGGGCGCATTAGGATTGCGAATGACAATGCCTTCTCCTTTGAGCTGTTCCACCTGCTGCAAAAATTGCTGAATATGTTGTGGGCTCTCAATAGGAATCTGTTCAATAATTTCAATATAGTCGCTTGGGTTTTGCGCCAAATAGGTTTTTAATTGTGCCAAGCGGGCAAATAAGTCTCCTTCAGCGTCAGGCACATCAAAGACATACAGCTTTAATTTATTCCAGCCTTTGTCCTGATAAGCGCGAACAATAGAAGAAATGTCGGCAAATTGATCACGTT > 1/485693‑486183 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |