| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 484,675 | C→T | A457A (GCC→GCT) | unknown → | ATP‑dependent DNA helicase UvrD/PcrA (EC 3.6.4.12) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 484,675 | 0 | C | T | 100.0% | 176.6 / NA | 65 | A457A (GCC→GCT) | unknown | ATP‑dependent DNA helicase UvrD/PcrA (EC 3.6.4.12) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (26/39); total (26/39) | |||||||||||
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tCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAggg > 1:878331/1‑198 (MQ=255) ccTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGc > 1:867139/1‑120 (MQ=255) ccTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGGTGTCTGCCGCCCGTGAAttt > 1:594602/1‑251 (MQ=255) ccaccaATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGgtg > 1:129479/1‑221 (MQ=255) accaATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGGTGTCTGCCGCCCGTGAATTTATCAAACCTGAAGa < 1:847941/251‑1 (MQ=255) tCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGGTGTCTGCCGCCCGTGAATTTATCAAACCTGAAGa > 1:205527/1‑246 (MQ=255) cgcTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGaag < 1:42326/192‑2 (MQ=255) gAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGGTGTCTGCCGCCCGTGAATTTATCAAACCTGAAGACGCGGAAGATATGAc < 1:806905/248‑1 (MQ=255) gAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGGTGTCTGCCGCCCGTGAATTTATCAAACCTGAAGACGCGGAAGATATGAc < 1:543343/248‑1 (MQ=255) gAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGGTGTCTGCCGCCCGTGAATTTATCAAACCTGAAGACGCGGAAGATATGACgg < 1:482220/250‑1 (MQ=255) aaaaCAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGGTGTCTGCCGCCCGTGAATTTATCAAACCTGAAGACGCGGAAGATATGACGGa < 1:709317/250‑1 (MQ=255) aaacaaacTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGGTGTCTGCCGCCCGTGAATTTATCAAACCTGAAGACGCGGAAGATATGACGGATc < 1:770728/251‑1 (MQ=255) aacTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGGTGTCTGCCGCCCGTGAATTTATCAAACCTGAAGACGCGGAAGATATGACGGATCTGACg < 1:556795/251‑1 (MQ=255) | ATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAGATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCGGGCGCGCCGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTACGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGGTGTCTGCCGCCCGTGAATTTATCAAACCTGAAGACGTGGAAGATATGACGGATCTGACG > 1/484434‑484909 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |