| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 484,667 | G→T | G455W (GGG→TGG) | unknown → | ATP‑dependent DNA helicase UvrD/PcrA (EC 3.6.4.12) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 484,667 | 0 | G | T | 100.0% | 192.0 / NA | 67 | G455W (GGG→TGG) | unknown | ATP‑dependent DNA helicase UvrD/PcrA (EC 3.6.4.12) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (28/39); total (28/39) | |||||||||||
CGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAGATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCGGGCGCGCCGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTACGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGGTGTCTGCCGCCCGTGAATTTATCAAACCTGAAGACGTGGAAGATATGACGGATCTGACG > 1/484422‑484909 | cgCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGgcg > 1:573583/1‑250 (MQ=255) aTCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCa < 1:710622/251‑1 (MQ=255) gCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTg > 1:63751/1‑251 (MQ=255) ttATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTa > 1:383298/1‑250 (MQ=255) aTGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGc < 1:342275/251‑1 (MQ=255) aTGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATgg < 1:617846/250‑1 (MQ=255) tcttTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCTAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGttaatt < 1:475482/251‑1 (MQ=255) tcttTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGttaatt < 1:1026/251‑1 (MQ=255) tcttTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGttaatt > 1:740229/1‑251 (MQ=255) tcttTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGttaatt > 1:181327/1‑251 (MQ=255) aaCGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTc < 1:440010/250‑1 (MQ=255) aaCGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTc < 1:563893/250‑1 (MQ=255) aaCGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTc < 1:36794/250‑1 (MQ=255) ttAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGac < 1:183582/251‑1 (MQ=255) gCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCtt > 1:27885/1‑212 (MQ=255) gCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTc < 1:594951/230‑1 (MQ=255) ggCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATgg < 1:817124/212‑1 (MQ=255) gCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGc < 1:323250/250‑1 (MQ=255) aTTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGttaatt > 1:546034/1‑216 (MQ=255) aTTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCgttg > 1:37712/1‑251 (MQ=255) gTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCgttgtt < 1:500166/246‑1 (MQ=255) gTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTAACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATgg > 1:10284/1‑200 (MQ=255) tCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGga < 1:437205/219‑1 (MQ=255) cGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCgctgct > 1:840591/1‑165 (MQ=255) cGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGc > 1:710104/1‑205 (MQ=255) cGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTtgt > 1:98879/1‑251 (MQ=255) gACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTtgtg < 1:349504/246‑1 (MQ=255) aTGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAg < 1:231379/248‑1 (MQ=255) gcCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGc > 1:223491/1‑165 (MQ=255) gcCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCgg > 1:373549/1‑251 (MQ=255) cTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGc < 1:13307/163‑1 (MQ=255) cTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGt < 1:567281/251‑1 (MQ=255) aGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGt < 1:364086/246‑1 (MQ=255) cGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTAt < 1:418074/249‑1 (MQ=255) ggTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATgg < 1:820927/161‑1 (MQ=255) ggTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTGATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCaaa > 1:435083/1‑251 (MQ=255) cATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAACCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGACGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGt > 1:840868/1‑251 (MQ=255) aTACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGc < 1:256989/146‑1 (MQ=255) tACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAAc < 1:427438/251‑1 (MQ=255) cGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAg > 1:79071/1‑251 (MQ=255) aTTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGt < 1:10060/139‑1 (MQ=255) c‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAg < 1:807027/240‑1 (MQ=255) gTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTa > 1:630018/1‑251 (MQ=255) ttGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTAt > 1:183427/1‑251 (MQ=255) ttGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTAt < 1:353191/251‑1 (MQ=255) ggATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTg > 1:460408/1‑251 (MQ=255) aCCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAgg < 1:722176/238‑1 (MQ=255) gcgcAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGAAAACCTgg > 1:427804/1‑251 (MQ=255) aTCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGtta < 1:394952/110‑1 (MQ=255) aTCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATc < 1:758745/192‑1 (MQ=255) aaCATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGGTGTCTgc < 1:40844/250‑1 (MQ=255) cATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCa > 1:192281/1‑164 (MQ=255) cATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTg > 1:835388/1‑223 (MQ=255) aTCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGGTGTCTgccgcc < 1:753859/251‑1 (MQ=255) tCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAggg > 1:878331/1‑198 (MQ=255) ccTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGc > 1:867139/1‑120 (MQ=255) ccTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGGTGTCTGCCGCCCGTGAAttt > 1:594602/1‑251 (MQ=255) ccaccaATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGgtg > 1:129479/1‑221 (MQ=255) accaATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGGTGTCTGCCGCCCGTGAATTTATCAAACCTGAAGa < 1:847941/251‑1 (MQ=255) tCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGGTGTCTGCCGCCCGTGAATTTATCAAACCTGAAGa > 1:205527/1‑246 (MQ=255) cgcTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGaag < 1:42326/192‑2 (MQ=255) gAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGGTGTCTGCCGCCCGTGAATTTATCAAACCTGAAGACGCGGAAGATATGAc < 1:543343/248‑1 (MQ=255) gAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGGTGTCTGCCGCCCGTGAATTTATCAAACCTGAAGACGCGGAAGATATGAc < 1:806905/248‑1 (MQ=255) gAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGGTGTCTGCCGCCCGTGAATTTATCAAACCTGAAGACGCGGAAGATATGACgg < 1:482220/250‑1 (MQ=255) aaaaCAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGGTGTCTGCCGCCCGTGAATTTATCAAACCTGAAGACGCGGAAGATATGACGGa < 1:709317/250‑1 (MQ=255) aaacaaacTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGGTGTCTGCCGCCCGTGAATTTATCAAACCTGAAGACGCGGAAGATATGACGGATc < 1:770728/251‑1 (MQ=255) aacTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTGCGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGGTGTCTGCCGCCCGTGAATTTATCAAACCTGAAGACGCGGAAGATATGACGGATCTGACg < 1:556795/251‑1 (MQ=255) | CGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAGATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCAC‑GTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCGGGCGCGCCGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGACACGGAAGAAATGCCGTTGTTTGCGCAAACGGATTTTGTGATTAAGCATTCCGGGTTGTATCAAATGTACAAACAGGAAAAGGGCGAAAAAGGGGAGGTACGTATTGAAAACCTGGAAGAATTGGTGTCTGCCGCCCGTGAATTTATCAAACCTGAAGACGTGGAAGATATGACGGATCTGACG > 1/484422‑484909 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |