| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 484,481 | G→A | D393N (GAT→AAT) | unknown → | ATP‑dependent DNA helicase UvrD/PcrA (EC 3.6.4.12) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 484,481 | 0 | G | A | 100.0% | 228.4 / NA | 85 | D393N (GAT→AAT) | unknown | ATP‑dependent DNA helicase UvrD/PcrA (EC 3.6.4.12) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (36/49); total (36/49) | |||||||||||
CGGAAGGCAATCAGGGCGAACCGGTGGGCATTTACGCCGCCTTCAATGAATTGGATGAAGCATTGTTTGTGGCTTCACAAATCAAGACTTGGATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAGATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCGGGCGCGCCGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGAC > 1/484242‑484726 | cGGAAGGCAATCAGGGCGAACCGGTGGGCATTTACGCCGCCTTCAATGAATTGGATGAAGCATTGTTTGTGGCTTCACAAATCAAGACTTGGATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCt < 1:511571/251‑1 (MQ=255) gCAATCAGGGCGAACCGGTGGGCATTTACGCCGCCTTCAATGAATTGGATGAAGCATTGTTTGTGGCTTCACAAATCAAGACTTGGATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTAttt < 1:711063/250‑1 (MQ=255) aaTCAGGGCGAACCGGTGGGCATTTACGCCGCCTTCAATGAATTGGATGAAGCATTGTTTGTGGCTTCACAAATCAAGACTTGGATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTa < 1:708121/245‑1 (MQ=255) gggCGAACCGGTGGGCATTTACGCCGCCTTCAATGAATTGGATGAAGCATTGTTTGTGGCTTCACAAATCAAGACTTGGATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTaa > 1:241062/1‑251 (MQ=255) ggCGAACCGGTGGGCATTTACGCCGCCTTCAATGAATTGGATGAAGCATTGTTTGTGGCTTCACAAATCAAGACTTGGATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGtt < 1:712844/248‑1 (MQ=255) cGGTGGGCATTTACGCCGCCTTCAATGAATTGGATGAAGCATTGTTTGTGGCTTCACAAATCAAGACTTGGATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAAt < 1:513339/251‑1 (MQ=255) gggCATTTACGCCGCCTTCAATGAATTGGATGAAGCATTGTTTGTGGCTTCACAAATCAAGACTTGGATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGa > 1:597138/1‑250 (MQ=255) gCATTTACGCCGCCTTCAATGAATTGGATGAAGCATTGTTTGTGGCTTCACAAATCAAGACTTGGATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAg > 1:549503/1‑251 (MQ=255) tttACGCCGCCTTCAATGAATTGGATGAAGCATTGTTTGTGGCTTCACAAATCAAGACTTGGATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAGTCGCCAATCGACAGGAc < 1:644291/251‑1 (MQ=255) gccTTCAATGAATTGGATGAAGCATTGTTTGTGGCTTCACAAATCAAGACTTGGATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGAtgctg > 1:668271/1‑250 (MQ=255) tCAATGAATTGGATGAAGCATTGTTTGTGGCTTCACAAATCAAGACTTGGATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCttt > 1:198826/1‑251 (MQ=255) cAATGAATTGGATGAAGCATTGTTTGTGGCTTCACAAATCAAGACTTGGATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCg > 1:837405/1‑224 (MQ=255) cAATGAATTGGATGAAGCATTGTTTGTGGCTTCACAAATCAAGACTTGGATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTg > 1:727104/1‑251 (MQ=255) ggATGAAGCATTGTTTGTGGCTTCACAAATCAAGACTTGGATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCa > 1:768139/1‑251 (MQ=255) aaGCATTGTTTGTGGCTTCACAAATCAAGACTTGGATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAg > 1:10751/1‑239 (MQ=255) aaGCATTGTTTGTGGCTTCACAAATCAAGACTTGGATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTaa < 1:242589/250‑1 (MQ=255) gCATTGTTTGTGGCTTCACAAATCAAGACTTGGATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGcc < 1:389858/210‑1 (MQ=255) ttgtttgtGGCTTCACAAATCAAGACTTGGATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGcc < 1:37/251‑1 (MQ=255) gtttgtGGCTTCACAAATCAAGACTTGGATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTAttt > 1:405600/1‑192 (MQ=255) gtttgtGGCTTCACAAATCAAGACTTGGATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACCGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCa > 1:900013/1‑250 (MQ=255) gtttgtGGCTTCACAAATCAAGACTTGGATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATAc < 1:573886/246‑1 (MQ=255) gACTTGGATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCAt < 1:663507/240‑1 (MQ=255) ggATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGAtgctg < 1:496128/198‑1 (MQ=255) ggATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTaa > 1:645502/1‑217 (MQ=255) ggATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCAtt > 1:851388/1‑236 (MQ=255) gAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATa > 1:738598/1‑250 (MQ=255) aaGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATAc < 1:769166/250‑1 (MQ=255) gcggTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATAc > 1:367297/1‑244 (MQ=255) tAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATc < 1:164550/251‑1 (MQ=255) aaaTTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCt < 1:588518/251‑1 (MQ=255) aaaTTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCt < 1:109390/251‑1 (MQ=255) aTTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAg > 1:576638/1‑187 (MQ=255) aaCGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCg < 1:362602/251‑1 (MQ=255) gtgCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACAt > 1:731887/1‑251 (MQ=255) aTTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGAc > 1:30019/1‑151 (MQ=255) aTTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGa < 1:898104/158‑1 (MQ=255) aTTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGGGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCg > 1:444163/1‑205 (MQ=255) aTTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTAccc > 1:700419/1‑238 (MQ=255) aTTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAAt > 1:653689/1‑251 (MQ=255) tataCCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCAcc < 1:135415/251‑1 (MQ=255) ataCCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCAcc < 1:777017/250‑1 (MQ=255) ccGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAg > 1:486296/1‑163 (MQ=255) ccGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATc < 1:752567/244‑1 (MQ=255) cGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATAc < 1:218504/212‑1 (MQ=255) tagtaACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTaa < 1:787998/171‑1 (MQ=255) tagtaACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTgcgc < 1:175585/217‑1 (MQ=255) tagtaACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATgg > 1:368417/1‑250 (MQ=255) tagtaACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGc < 1:755181/251‑1 (MQ=255) tagtaACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGc < 1:628667/251‑1 (MQ=255) tagtaACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGc < 1:202941/251‑1 (MQ=255) agtaACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAAc < 1:526884/232‑1 (MQ=255) gtaACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTAttt > 1:294051/1‑118 (MQ=255) aGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGc < 1:62471/240‑1 (MQ=255) aGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAAt > 1:567790/1‑251 (MQ=255) gTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACgg < 1:540605/112‑1 (MQ=255) gTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAAt > 1:643156/1‑250 (MQ=255) aGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGgcg < 1:469069/250‑1 (MQ=255) tGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCtt > 1:29099/1‑251 (MQ=255) gATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCg < 1:318419/207‑1 (MQ=255) aagaagCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGaa < 1:623435/251‑1 (MQ=255) aagaagCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGCTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCCCCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGaa < 1:902020/251‑1 (MQ=255) gcgcTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTCCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGTCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCTCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATgg < 1:445693/219‑1 (MQ=255) ttcgCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGcctgg > 1:338972/1‑247 (MQ=255) cgCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGgcg > 1:573583/1‑250 (MQ=255) cgCAAATTCCGTACCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTAccc < 1:452377/183‑1 (MQ=255) aTTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTaa < 1:40428/122‑1 (MQ=255) aTCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCa < 1:710622/251‑1 (MQ=255) gCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTg > 1:63751/1‑251 (MQ=255) cATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCt < 1:344286/162‑1 (MQ=255) cATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAAt < 1:891395/202‑1 (MQ=255) tttATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCa < 1:629973/156‑1 (MQ=255) tttATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCt > 1:554721/1‑160 (MQ=255) ttATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTa > 1:383298/1‑250 (MQ=255) aTGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGa > 1:657559/1‑166 (MQ=255) aTGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGc < 1:342275/251‑1 (MQ=255) aTGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATgg < 1:617846/250‑1 (MQ=255) tcttTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAAc > 1:252692/1‑153 (MQ=255) tcttTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCTAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGttaatt < 1:475482/251‑1 (MQ=255) tcttTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGttaatt > 1:740229/1‑251 (MQ=255) tcttTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGttaatt < 1:1026/251‑1 (MQ=255) tcttTGAACGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGttaatt > 1:181327/1‑251 (MQ=255) aaCGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTc < 1:440010/250‑1 (MQ=255) aaCGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTc < 1:36794/250‑1 (MQ=255) aaCGGCAGGAAATTAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTc < 1:563893/250‑1 (MQ=255) ttAAAAATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCTGGCGCGCTGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGac < 1:183582/251‑1 (MQ=255) | CGGAAGGCAATCAGGGCGAACCGGTGGGCATTTACGCCGCCTTCAATGAATTGGATGAAGCATTGTTTGTGGCTTCACAAATCAAGACTTGGATTGAAGACGGCGGTAAATTAAACGATTGTGCCATTTTATACCGTAGTAACAGCCAGTCACGAGTGATTGAAGAAGCGCTGATTCGTTCGCAAATTCCGTATCGCATTTATGGTGGGATGCGCTTCTTTGAACGGCAGGAAATTAAAGATGCCTTGGCTTATTTACGGTTAATCGCCAATCGACAGGACGATGCTGCCTTTGAGCGGGTCATTAATACGCCACCGCGCGGCATTGGCGATCGCACGTTGGATACCTTGCGCAATCTTACCCGTGAACATCAAATCACCTTATGGCAAGCCACCAATCTGGCGCTTCAGGAAAACAAACTCGCCGGGCGCGCCGCTACGGCATTGTTACGCTTTATGGAGTTAATTAATTCTTTGCAGCGGGAC > 1/484242‑484726 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |