| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 482,652 | A→G | S291G (AGT→GGT) | unknown → | Low‑affinity gluconate/H+ symporter GntU |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 482,652 | 0 | A | G | 100.0% | 173.3 / NA | 64 | S291G (AGT→GGT) | unknown | Low‑affinity gluconate/H+ symporter GntU |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (34/30); total (34/30) | |||||||||||
AACACCGCCGCCATCAGCGAAACCTCCGTGCAAAATCCACCGGCGTTTGGGCGCGTTCTGTTTATTTTGGTTTTACCGATTTTCCTTATTTTGTTTGATACCGGGTTAAATACCCTCAGCGTGGCAAAAGTGATTGACGGTTCTTCCTTGTGGGTCGAAAGCCTGCGCCTCATCGGCAAAACCCCGATCGCGTTATTAATCACATTATTAATTGCCATTGCCTTATTGCGCGGAGAACGCAGTTATGAACAAATCGAAAGCCTTTGTAACAGTGCGCTGGGACCGATTTGCTCCATTATTTTAGTGACCGGTGCGGGCGGTATGTTCGGTGGCGTATTGCGCGCCAGCGGCATCGGCGATGAGTTATCCGCCATGTTGTCAAATACCGGTATGCCGATCATCATCACCGCCTTTATTATTTCTATGGCATTGCGTGTGGCACAAGGTTCGGCAACGGTAGCCCTGACTACTGC > 1/482412‑482884 | aaCACCGCCGCCATCAGCGAAACCTCCGTGCAAAATCCACCGGCGTTTGGGCGCGTTCTGTTTATTTTGGTTTTACCGATTTTCCTTATTTTGTTTGATACCGGGTTAAATACCCTCAGCGTGGCAAAAGTGATTGACGGTTCTTCCTTGTGGGTCGAAAGCCTGCGCCTCATCGGCAAAACCCCGATCGCGTTATTAATCACATTATTAATTGCCATTGCCTTATTGCGCGGAGAACGCGGTTATGAAc < 1:759073/250‑1 (MQ=255) 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gccTTATTGCGCGGAGAACGCGGTTATGAACAAATCGAAAGCCTTTGTAACAGTGCGCTGGGACCGATTTGCTCCATTATTTTAGTGACCGGTGCGGGCGGTATGTTCGGTGGCGTATTGCGCGCCAGCGGCATCGGCGATGAGTTATCCGCCATGTTGTCAAATACCGGTATGCCGATCATCATCGCCGCCTTTATTATTTCTATGGCAt < 1:190113/211‑1 (MQ=255) gccTTATTGCGCGGAGAACGCGGTTATGAACAAATCGAAAGCCTTTGTAACAGTGCGCTGGGACCGATTTGCTCCATTATTTTAGTGACCGGTGCGGGCGGTATGTTCGGTGGCGTATTGCGCGCCAGCGGCATCGGCGATGAGTTATCCGCCATGTTGTCAAATACCGGTATGCCGATCATCATCGCCGCCTTTATTATTTCTATGGCATTGCGTGTGGCACAAGGTTCGGCAACGGTAGCCCTGacta > 1:728649/1‑250 (MQ=255) gccTTATTGCGCGGAGAACGCGGTTATGAACAAATCGAAAGCCTTTGTAACAGTGCGCTGGGACCGATTTGCTCCATTATTTTAGTGACCGGTGCGGGCGGTATGTTCGGTGGCGTATTGCGCGCCAGCGGCATCGGCGATGAGTTATCCGCCATGTTGTCAAATACCGGAATGCCGATCATCATCGCCGCCTTTATTATTTCTATGGCATTGCGTGTGGCACAAGGTTCGGCAACGGTAGCCCTGacta > 1:653001/1‑250 (MQ=255) ccTTATTGCGCGGAGAACGCGGTTATGAACAAATCGAAAGCCTTTGTAACAGTGCGCTGGGACCGATTTGCTCCATTATTTTAGTGACCGGTGCGGGCGGTATGTTCGGTGGCGTATTGCGCGCCAGCGGCATCGGCGATGAGTTATCCGCCATGTTGTCAAATACCGGTATGCCGATCATCATCGCCGCCTTTATTATTTCTATGGCATTGCGTGTGGCACAAGGTTCGGCAACGGTAGCCCTGacta > 1:852040/1‑249 (MQ=255) gagaACGCGGTTATGAACAAATCGAAAGCCTTTGTAACAGTGCGCTGGGACCGATTTGCTCCATTATTTTAGTGACCGGTGCGGGCGGTATGTTCGGTGGCGTATTGCGCGCCAGCGGCATCGGCGATGAGTTATCCGCCATGTTGTCAAATACCGGTATGCCGATCATCATCGCCGCCTTTATTATTTCTATGGCATTGCGTGTGGCACAAGGTTCGGCAACGGTAGCCCTGACTACTGc > 1:790307/1‑241 (MQ=255) gaACGCGGTTATGAACAAATCGAAAGCCTTTGTAACAGTGCGCTGGGACCGATTTGCTCCATTATTTTAGTGACCGGTGCGGGCGGTATGTTCGGTGGCGTATTg < 1:446264/105‑1 (MQ=255) | AACACCGCCGCCATCAGCGAAACCTCCGTGCAAAATCCACCGGCGTTTGGGCGCGTTCTGTTTATTTTGGTTTTACCGATTTTCCTTATTTTGTTTGATACCGGGTTAAATACCCTCAGCGTGGCAAAAGTGATTGACGGTTCTTCCTTGTGGGTCGAAAGCCTGCGCCTCATCGGCAAAACCCCGATCGCGTTATTAATCACATTATTAATTGCCATTGCCTTATTGCGCGGAGAACGCAGTTATGAACAAATCGAAAGCCTTTGTAACAGTGCGCTGGGACCGATTTGCTCCATTATTTTAGTGACCGGTGCGGGCGGTATGTTCGGTGGCGTATTGCGCGCCAGCGGCATCGGCGATGAGTTATCCGCCATGTTGTCAAATACCGGTATGCCGATCATCATCACCGCCTTTATTATTTCTATGGCATTGCGTGTGGCACAAGGTTCGGCAACGGTAGCCCTGACTACTGC > 1/482412‑482884 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |