| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 6 | 12,974 | T→C | intergenic (‑67/‑99) | unknown ← / → unknown | Transcriptional regulator AsnC/Aspartate‑‑ammonia ligase (EC 6.3.1.1) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 6 | 12,974 | 0 | T | C | 100.0% | 88.8 / NA | 32 | intergenic (‑67/‑99) | unknown/unknown | Transcriptional regulator AsnC/Aspartate‑‑ammonia ligase (EC 6.3.1.1) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (19/13); total (19/13) | |||||||||||
TTCAATTACACCGGATTGACGCATTTTTTCCACCCGCACATGAATCGTGCCGGGACTCACGCCGAAGTTTTTCGCCATTTCCGCATAAGGCGTGCGGGCATCCCGCGTTAACACGCGCAATATTTGCTGATCTAAATTATCAATATTGTGCATAGTATACTCCTTGTTTAAAAATATTTTAATAAAATAAAGAATAAATTATATTTCATCTAAATAATATCAGTTTTATATTTGTTTTTGTCGAATTATATTGCATTAAGTTTGATGAATATGCAAAATCAGCGCCGTTACTTTAAATGAAAAAATAGGGGTATAACGATGAAAAAGACATTTATTTTACAGCAACAAGAAATCAGCTTTGTGAAAAACACATTCACACAAAATCTTATTGAACAACTTGGCATTATTGAAGTTCAGGGACCTATCTTAAGCCAAGTGGGTAATGGTATGCAAGATAACTT > 6/12755‑13215 | ttCAATTACACCGGATTGACGCATTTTTTCCACCCGCACATGAATCGTGCCGGGACTCACGCCGAAGTTTTTCGCCATTTCCGCATAAGGCGTGCGGGCATCCCGCGTTAACACGCGCAATATTTGCTGATCTAAATTATCAATATTGTGCATAGTATACTCCTTGTTTAAAAATATTTTAATAAAATAAAGAATAAATTATATTTCATCTAAATAATACCAGTTTTATATTTGTTTTTGTCGAATTatat < 1:343568/251‑1 (MQ=255) cAATTACACCGGATTGACGCATTTTTTCCACCCGCACATGAATCGTGCCGGGACTCACGCCGAAGTTTTTCGCCATTTCCGCATAAGGCGTGCGGGCATCCCGCGTTAACACGCGCAATATTTGCTGATCTAAATTATCAATATTGTGCATAGTATACTCCTTGTTTAAAAATATTTTAATAAAATAAAGAATAAATTATATTTCATCTAAATAATACCAGTTTTatat > 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |