| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 6 | 11,703 | A→G | V240A (GTC→GCC) | unknown ← | Uridine phosphorylase (EC 2.4.2.3) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 6 | 11,703 | 0 | A | G | 100.0% | 232.2 / NA | 81 | V240A (GTC→GCC) | unknown | Uridine phosphorylase (EC 2.4.2.3) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (38/43); total (38/43) | |||||||||||
CATTCCGCTGGCGACTTTGGTGAAAGCGGTGGTGAACGCTTGGCCTTCCAATGAAGCGGTGGAATAAAAAAACGCCGGGAAAGACAACCGCACTTTAAGGGCTAAAAGCCAAAGTGCGGTCTAGAATCAAAACGTTTTTAGCATAAAAAATGCAGCCATTTTCGGCTGCATTTTTGCTTTCTTTTGACCTGCTATGATTGACGTTAAACCAATAATCCCGCTGCTTTCACCACTGCATGAATGACTTTTTCTTCGGTGGATTTAATGGTTTCTTCGTTCGGAATTTCCTGTTGGGTACGATTAACAATGGCACCGGCTATCATGCCTGCCCGCAGACCCAAGGCGGAACACATGGTGAACAAGGTGGCGGATTCCATTTCATAATTCATCACGTGCAATTCCTGCCATTGTTTGAGTGAGCCTTGGAAGTGGCGATAGATTTTGCCGGTAAAGGTGTCGTAACGTTCTTGCCCCGGATAGAAGG > 6/11460‑11943 | cATTCCGCTGGCGACTTTGGTGAAAGCGGTGGTGAACGCTTGGCCTTCCAATGAAGCGGTGGAATAAAAAAACGCCGGGAAAGACAACCGCACTTTAAGGGCTAAAAGCCAAAGTGCGGTCTAGAATCAAAACGTTTTTAGCATAAAAAATGCAGCCATTTTCGGCTGCATTTTTGCTTTCTTTTGACCTGCTATGATTGACGTTAAACCAATAATCCCGCTGCTTTCACCACTGCATGAATGGCTTTttc < 1:117722/251‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) cGTTAAACCAATAATCCCGCTGCTTTCACCACTGCATGAATGGCTTTTTCTTCGGTGGATTTAATGGTTTCTTCGTTCGGAATTTCCTGTTGGGTACGATTAACAATGGCACCGGCTATCATGCCTGCCCGCAGACCCAAGGCGGAACACATGGTGAACAAGGTGGCGGATTCCATTTCATAATTCATCACGTGCAATTCCTGCCATTGTTTGAGTGAGCCTTGGAAGTGGCGATAGATTTTGCCGGTaaa > 1:55462/1‑251 (MQ=255) ttAAACCAATAATCCCGCTGCTTTCACCACTGCATGAATGGCTTTTTCTTCGGTGGATTTAATGGTTTCTTCGTTCGGAATTTCCTGTTGGGTACGATTAACAATGGCACCGGCTATCATGCCTGCCCGCAGACCCAAGGCGGAACACATGGTGAACAAGGTGGCGGATTCCATTTCATAATTCATCACGTGCAATTCCTGCCATTGTTTGAGTGAGCCTTGGAAGTGGCGATAGATTTTGCCGGTAAAgg < 1:186611/251‑1 (MQ=255) aaaCCAATAATCCCGCTGCTTTCACCACTGCATGAATGGCTTTTTCTTCGGTGGATTTAATGGTTTCTTCGTTCGGAATTTCCTGTTGGGTACGATTAACAATGGCACCGGCTATCATGCCTGCCCGCAGACCCAAGGCGGAACACATGGTGAACAAGGTGGCGGATTCCATTTCATAATTCATCACGTGCAATTCCTGCCATTGTTTGAGTGAGCCTTGGaa > 1:408151/1‑223 (MQ=255) 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CATTCCGCTGGCGACTTTGGTGAAAGCGGTGGTGAACGCTTGGCCTTCCAATGAAGCGGTGGAATAAAAAAACGCCGGGAAAGACAACCGCACTTTAAGGGCTAAAAGCCAAAGTGCGGTCTAGAATCAAAACGTTTTTAGCATAAAAAATGCAGCCATTTTCGGCTGCATTTTTGCTTTCTTTTGACCTGCTATGATTGACGTTAAACCAATAATCCCGCTGCTTTCACCACTGCATGAATGACTTTTTCTTCGGTGGATTTAATGGTTTCTTCGTTCGGAATTTCCTGTTGGGTACGATTAACAATGGCACCGGCTATCATGCCTGCCCGCAGACCCAAGGCGGAACACATGGTGAACAAGGTGGCGGATTCCATTTCATAATTCATCACGTGCAATTCCTGCCATTGTTTGAGTGAGCCTTGGAAGTGGCGATAGATTTTGCCGGTAAAGGTGTCGTAACGTTCTTGCCCCGGATAGAAGG > 6/11460‑11943 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |