| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 6 | 10,383 | G→A | I3I (ATC→ATT) | unknown ← | Uncharacterized protein YfgD, not an arsenate reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 6 | 10,383 | 0 | G | A | 100.0% | 160.0 / NA | 59 | I3I (ATC→ATT) | unknown | Uncharacterized protein YfgD, not an arsenate reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (32/27); total (32/27) | |||||||||||
TCCTGTTGACCCAGTGTCGGGTTATCTAAACCGAGTTTTTTATACAGATCATCTTTGGTGCGCATCATTTGGCGGATGTCGCTAATGCCTAATTTATCGGCGATGGCTTGCAGCTCCGCAACGGAATAGGTTTTCTGCAAATAAAGCTCGATTTGTGGTTGAATTTGATGGCTTTCCAATAATGCCAGGGTTTCACAGCTTTTGGAGCAGGATGGGTTGTGATAGATAATGATGGACATAGAAATTCCTTATGTTAGTGTAATTTGCCTAGATTTTACCTTATAATCAGGCAAAATTTATAGAGGTAATTACATGATTGAAATGTTAAAAAATTGGTATCGGAGACGATTTAGCGACCCGCAAGCTATGGGGTTGTTCGCTATTTTATTCTTCGGTTTCGTCGCAATTTATTTTTTTAGTGATTTAATTGCGCCGCTGTTGGTAGCGATTGTGTTAGCGTACCTGTTGGAATGGC > 6/10153‑10627 | tCCTGTTGACCCAGTGTCGGGTTATCTAAACCGAGTTTTTTATACAGATCATCTTTGGTGCGCATCATTTGGCGGATGTCGCTAATGCCTAATTTATCGGCGATGGCTTGCAGCTCCGCAACGGAATAGGTTTTCTGCAAATAAAGCTCGATTTGTGGTTGAATTTGATGGCTTTCCAATAATGCCAGGGTTTCACAGCTTTTGGAGCAGGATGGGTTGTGATAGATAATAATGGACATAGAAATTCCTTa < 1:3162/251‑1 (MQ=255) cTGTTGACCCAGTGTCGGGTTATCTAAACCGAGTTTTTTATACAGATCATCTTTGGTGCGCATCATTTGGCGGATGTCGCTAATGCCTAATTTATCGGCGATGGCTTGCAGCTCCGCAACGGAATAGGTTTTCTGCAAATAAAGCTCGATTTGTGGTTGAATTTGATGGCTTTCCAATAATGCCAGGGTTTCACAGCTTTTGGAGCAGGATGGGTTGTGATAGATAATAATGGACATAGAAATTCCTTATg < 1:207795/251‑1 (MQ=255) gTTGACCCAGTGTCGGGTTATCTAAACCGAGTTTTTTATACAGATCATCTTTGGTGCGCATCATTTGGCGGATGTCGCTAATGCCTAATTTATCGGCGATGGCTTGCAGCTCCGCAACGGAATAGGTTTTCTGCAAATAAAGCTCGATTTGTGGTTGAATTTGATGGCTTTCCAATAATGCCAGGGTTTCACAGCTTTTGGAGCAGGATGGGTTGTGATAGATAATAATGGACATAGa > 1:679602/1‑238 (MQ=255) ttGACCCAGTGTCGGGTTATCTAAACCGAGTTTTTTATACAGATCATCTTTGGTGCGCATCATTTGGCGGATGTCGCTAATGCCTAATTTATCGGCGATGGCTTGCAGCTCCGCAACGGAATAGGTTTTCTGCAAATAAAGCTCGATTTGTGGTTGAATTTGATGGCTTTCCAATAATGCCAGGGTTTCACAGCTTTTGGAGCAGGATGGGTTGTGATAGATAATAATGGACATAGAAATTCCTTATGtt < 1:370985/250‑1 (MQ=255) ttGACCCAGTGTCGGGTTATCTAAACCGAGTTTTTTATACAGATCATCTTTGGTGCGCATCATTTGGCGGATGTCGCTAATGCCTAATTTATCGGCGATGGCTTGCAGCTCCGCAACGGAATAGGTTTTCTGCAAATAAAGCTCGATTTGTGGTTGAATTTGATGGCTTTCCAATAATGCCAGGGTTTCACAGCTTTTGGAGCAGGATGGGTTGTGATAGATAATAATGGACATAGAAATTCCTTATGtt < 1:546413/250‑1 (MQ=255) ttGACCCAGTGTCGGGTTATCTAAACCGAGTTTTTTATACAGATCATCTTTGGTGCGCATCATTTGGCGGATGTCGCTAATGCCTAATTTATCGGCGATGGCTTGCAGCTCCGCAACGGAATAGGTTTTCTGCAAATAAAGCTCGATTTGTGGTTGAATTTGATGGCTTTCCAATAATGCCAGGGTTTCACAGCTTTTGGAGCAGGATGGGTTGTGATAGATAATAATGGACATAGAAATTCCTTATGtt < 1:499692/250‑1 (MQ=255) aCCCAGTGTCGGGTTATCTAAACCGAGTTTTTTATACAGATCATCTTTGGTGCGCATCATTTGGCGGATGTCGCTAATGCCTAATTTATCGGCGATGGCTTGCAGCTCCGCAACGGAATAGGTTTTCTGCAAATAAAGCTCGATTTGTGGTTGAATTTGATGGCTTTCCAATAATGCCAGGGTTTCACAGCTTTTGGAGCAGGATGGGTTGTGATAGATAATAATGGACATAGAAATTCCTTATGTTAgtg < 1:55997/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |