| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 6 | 4,645 | C→A | F59L (TTC→TTA) | unknown → | Large‑conductance mechanosensitive channel |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 6 | 4,645 | 0 | C | A | 100.0% | 232.9 / NA | 87 | F59L (TTC→TTA) | unknown | Large‑conductance mechanosensitive channel |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (48/39); total (48/39) | |||||||||||
CCTTTTTAATCGGTAGTGTGCGTATCACATTTTATTTTTAACAAGTCTTAGGAGAGCATTATGAGTTTCATTAAAGAATTTCGTGAATTTGCCATGCGTGGCAATGTTGTTGATATGGCAGTCGGTGTAATCATCGGTGGCGCTTTCGGTAAAATTGTCAGTTCATTGGTGGCTGATGTTTTTATGCCGGTATTAGGTA‑TTTTAACCGGTGGCATGGACTTTAAAGATTTGAAATTCGTCTTGGAACCGGCAAACGGTGATATTCCTGCCGTGACGTTAAACTATGGCGTATTTATTCAAAACGTATTTGATTTTGTTATTATTGCGTTTGCCATTTTCATGATGATTAAGGCGCTAAACAAACTGAAAAAACCGGAAGTGGTGGAAGAAGCGCCGGCAGAGCCTTCAACGGAAGAAAAATTATTAACTGAGATTCGTGATCTCCTCAAAAAATGATTTTTAGCCAAGAAAAATCTTCTCAAT > 6/4409‑4891 | ccTTTTTAATCGGTAGTGTGCGTATCACATTTTATTTTTAACAAGTCTTAGGAGAGCATTATGAGTTTCATTAAAGAATTTCGTGAATTTGCCATGCGTGGCAATGTTGTTGATATGGCAGTCGGTGTAATCATCGGTGGCGCTTTCGGTAAAATTGTCAGTTCATTGGTGGCTGATGTTTTTATGCCGGTATTAGGTA‑TTTTAACCGGTGGCATGGACTTTAAAGATTTGAAATTAGTCTTGGAAc < 1:743080/247‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |