| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 5 | 34,675 | G→A | intergenic (+149/‑72) | unknown → / → unknown | Ketol‑acid reductoisomerase (NADP(+)) (EC 1.1.1.86)/SSU ribosomal protein S12p (S23e) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 5 | 34,675 | 0 | G | A | 100.0% | 245.6 / NA | 90 | intergenic (+149/‑72) | unknown/unknown | Ketol‑acid reductoisomerase (NADP(+)) (EC 1.1.1.86)/SSU ribosomal protein S12p (S23e) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (40/50); total (40/50) | |||||||||||
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |