| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 4 | 18,680 | C→T | E499K (GAA→AAA) | unknown ← | Anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain A (EC 1.8.5.3), molybdopterin‑binding domain |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 4 | 18,680 | 0 | C | T | 100.0% | 252.9 / NA | 93 | E499K (GAA→AAA) | unknown | Anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain A (EC 1.8.5.3), molybdopterin‑binding domain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (49/44); total (49/44) | |||||||||||
TGTGCGACCTTCGGTGAATTTGTCTTTTACCCCCATTTTGTCCGCCAAGTCGCTCAACATATCGTAAATCGTGCGACATTCAAAAGACGGTTTAACCACTTGGTCGGCAAAAATCACATACGCCATATTGGAGACGAAAGCGTCCAGTGCAAAATCCATTTGTTCCGAAGTGGTGCAATCCGGCAACAAAATATCGCTGTATTTCGCGGTGGAAGTCATGTGATTATCAATGGTGATGACCATTTCGCATTGGCTGTCGTCCTGCAAAATGTCATGAGTGCGGTTAATTTGCGCGTGCTGATTGATAAGGCAGTTACTTGAATAGTTCCAGATTACTTTAATCGGCGCGGACAGTTTATCTACGCCGCGAATGCCGTCGGTAAGTGCGGTCATTTCCGGTCCCCGAATAATGGCGTCAGTCCACATGAACATCGGAATACTGGCTTTCACCGGATTTTTTAACGTTGGCATTCGCACAAACGGAATGCTGTA > 4/18435‑18926 | tgtgCGACCTTCGGTGAATTTGTCTTTTACCCCCATTTTGTCCGCCAAGTCGCTCAACATATCGTAAATCGTGCGACATTCAAAAGACGGTTTAACCACTTGGTCGGCAAAAATCACATACGCCATATTGGAGACGAAAGCGTCCAGTGCAAAATCCATTTGTTCCGAAGTGGTGCAATCCGGCAACAAAATATCGCTGTATTTCGCGGTGGAAGTCATGTGATTATCAATGGTGATGACCATTTTGCAtt > 1:650952/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |