| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 4 | 11,691 | A→G | F339S (TTC→TCC) | unknown ← | Glycyl‑tRNA synthetase beta chain (EC 6.1.1.14) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 4 | 11,691 | 0 | A | G | 100.0% | 237.6 / NA | 85 | F339S (TTC→TCC) | unknown | Glycyl‑tRNA synthetase beta chain (EC 6.1.1.14) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (44/41); total (44/41) | |||||||||||
AGTGCATACCCATTACGCCTTGGGTGTCGGTGAATTCAAACACCATATTGGTCATCAAATCGCATTTTGACAGCAAGCCCGCACGTTTTGCTTTCGCTTCGTCGGCACCGATTTGTTTGGCGATTGCACCCGCAAGTTGTTCGATGCGGTCGGTTTTATCACGCAATGTGCCAAGTTGTTGTTGGAACAACACAGTTTCCAAGCGCGGTAAGCGATCCACTAATTTTTGTTTTAAGTCGGTTTTGAAGAAGAATTCCGCGTCGGTTAAACGAGGGCGAACCACTTTTTCGTTGCCTTCGATAATCGCACTTGGATCATCAGGGTTGATGTTCGATACGAAGATAAAGTGCGGTAATAATTTGCCGTCTTTGTCGCCTTCTGTTTTTTTGTATAGCGGGAAGTATTTTTGGTCGCCTTTCATGGTGTAAACCAAGGCTTCCGCAGGCACGGCAAGGAAACGTTCTTCAAATTTCGCCGCCAACACATTCGGGT > 4/11446‑11937 | aGTGCATACCCATTACGCCTTGGGTGTCGGTGAATTCAAACACCATATTGGTCATCAAATCGCATTTTGACAGCAAGCCCGCACGTTTTGCTTTCGCTTCGTCGGCACCGATTTGTTTGGCGATTGCACCCGCAAGTTGTTCGATGCGGTCGGTTTTATCACGCAATGTGCCAAGTTGTTGTTGGAACAACACAGTTTCCAAGCGCGGTAAGCGATCCACTAATTTTTGTTTTAAGTCGGTTTTggagaag > 1:727294/1‑251 (MQ=255) 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> 1:762749/1‑250 (MQ=255) gtgCCAAGTTGTTGTTGGAACAACACAGTTTCCAAGCGCGGTAAGCGATCCACTAATTTTTGTTTTAAGTCGGTTTTGGAGAAGAATTCCGCGTCGGTTAAACg > 1:230323/1‑104 (MQ=255) gtgCCAAGTTGTTGTTGGAACAACACAGTTTCCAAGCGCGGTAAGCGATCCACTAATTTTTGTTTTAAGTCGGTTTTGGAGAAGAATTCCGCGTCGGTTAAACGAGGGCGAACCACTTTTTCGTTGCCTTCGATAATCGCACTTGGATCATCAGGGTTGATGTTCGATACGAAGATAAAGTg < 1:7285/182‑1 (MQ=255) gtgCCAAGTTGTTGTTGGAACAACACAGTTTCCAAGCGCGGTAAGCGATCCACTAATTTTTGTTTTAAGTCGGTTTTGGAGAAGAATTCCGCGTCGGTTAAACGAGGGCGAACCACTTTTTCGTTGCCTTCGATAATCGCACTTGGATCATCAGGGTTGATGTTCGATACGAAGATAAAGTGCGGTAATAATTTGCCGTCTTTGTCGCCTTCTGTTTTTTTGTATAGCGGGAAGTATTTTTGGTCGCCttt > 1:868962/1‑251 (MQ=255) gCCAAGTTGTTGTTGGAACAACACAGTTTCCAAGCGCGGTAAGCGATCCACTAATTTTTGTTTTAAGTCGGTTTTGGAGAAGAATTCCGCGTCGGTTAAACGAGGGCGAACCACTTTTTCGTTGCCTTCGATAATCGCACTTGGATCATCAGGGTTGATGTTCGATACGAAGATAAAGTGCGGTAATAATTTGCCGTCTTTGTCGCCTTCTGTTTTTTTGTATAGCGGGAAGTATTTTTGGTCGCCTTTCa > 1:353455/1‑251 (MQ=255) 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AGTGCATACCCATTACGCCTTGGGTGTCGGTGAATTCAAACACCATATTGGTCATCAAATCGCATTTTGACAGCAAGCCCGCACGTTTTGCTTTCGCTTCGTCGGCACCGATTTGTTTGGCGATTGCACCCGCAAGTTGTTCGATGCGGTCGGTTTTATCACGCAATGTGCCAAGTTGTTGTTGGAACAACACAGTTTCCAAGCGCGGTAAGCGATCCACTAATTTTTGTTTTAAGTCGGTTTTGAAGAAGAATTCCGCGTCGGTTAAACGAGGGCGAACCACTTTTTCGTTGCCTTCGATAATCGCACTTGGATCATCAGGGTTGATGTTCGATACGAAGATAAAGTGCGGTAATAATTTGCCGTCTTTGTCGCCTTCTGTTTTTTTGTATAGCGGGAAGTATTTTTGGTCGCCTTTCATGGTGTAAACCAAGGCTTCCGCAGGCACGGCAAGGAAACGTTCTTCAAATTTCGCCGCCAACACATTCGGGT > 4/11446‑11937 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |