| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 4 | 5,110 | C→A | S20I (AGT→ATT) | unknown ← | ADP compounds hydrolase NudE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 4 | 5,110 | 0 | C | A | 100.0% | 242.2 / NA | 88 | S20I (AGT→ATT) | unknown | ADP compounds hydrolase NudE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (48/40); total (48/40) | |||||||||||
AAGCCGATTTCTTCCTGCAATTCCCGATTGGCACTCTGTTCCGGCGTTTCGCCCGCGTCCATTCTGCCTTTCACAAACCCCAGTTCATAACGTTCCGTCCCCACGGCATATTCACGCACCAACAATAAATCCTCGCCGTCAATAGCCACCACCATCACCGCCGCATACTTTCCGGGACGAAAACGTTCATAAGTGCGGTGCTCCCCGTTGGCGAATTTCAAATCTACCGACTGAATTTCAAAACTTGTTGATTTTGCTACGGTTTTTATATTTAGAATTTGTGGTTTTTGTAACGTTGTCATCGCCTTCCCTTGTTTTACAAACAGCTGAAATAGCGATACCATACCCCACTATTTTCACAAAGAAAAGGGACCGCAACGGAATGAATCAACAAAAATTTAACTGGCAGGCAATTGATACCGTAATTCTGGATTTGGACGGAACGCTGATTGATCTTTATTTCGATCACCGCTTCTGGAAAAATAT > 4/4867‑5352 | aaGCCGATTTCTTCCTGCAATTCCCGATTGGCACTTTGTTCCGGCGTTTCCCCCGCGTCCATTCTGCCTTTCACAAACCCCAGCTCATAACGTTCCGTCCCCACGGCATATTCACGCACCAACAATAAATCCTCGCCGTCAATAGCCACCACCATCACCGCCGCATACTTTCCGGGACGAAAACGTTCATAAGTGCGGTGCTCCCCGTTGGCGAATTTCAAATCTACCGACTGAATTTCAAAAATTGTTGa > 1:166196/1‑251 (MQ=255) tttCTTCCTGCAATTCCCGATTGGCACTTTGTTCCGGCGTTTCCCCCGCGTCCATTCTGCCTTTCACAAACCCCAGCTCATAACGTTCCGTCCCCACGGCATATTCACGCACCAACAATAAATCCTCGCCGTCAATAGCCACCACCATCACCGCCGCATACTTTCCGGGACGAAAACGTTCATAAGTGCGGTGCTCCCCGTTGGCGAATTTCAAATCTACCGACTGAATTTCAAAAATTGTTGATTTTGCt < 1:653503/251‑1 (MQ=255) aTTCCCGATTGGCACTTTGTTCCGGCGTTTCCCCCGCGTCCATTCTGCCTTTCACAAACCCCAGCTCATAACGTTCCGTCCCCCCGGCATATTCACGCACCAACAATAAATCCTCGCCGTCAATAGCCACCACCATCACCGCCGCATACTTTCCGGGACGAAAACGTTCATAAGTGCGGTGCTCCCCGTTGGCGAATTTCAAATCTACCGACTGAATTTCAAAAATTGTTGATTTTGCTACGGTTTTtata < 1:406359/251‑1 (MQ=255) aTTCCCGATTGGCACTTTGTTCCGGCGTTTCCCCCGCGTCCATTCTGCCTTTCACAAACCCCAGCTCATAACGTTCCGTCCCCACGGCATATTCACGCACCAACAATAAATCCTCGCCGTCAATAGCCCCCACCATCACCGCCGCATACTTTCCGGGACGAAAACGTTCATAAGTGCGGTGCTCCCCGTTGGCGAATTTCAAATCTACCGACTGAATTTCAAAAATTGTTGATTTTGCTACGGTTTTtata < 1:814334/251‑1 (MQ=255) aTTCCCGATTGGCACTTTGTTCCGGCGTTTCCCCCGCGTCCATTCTGCCTTTCACAAACCCCAGCTCATAACGTTCCGTCCCCACGGCATATTCACGCACCAACAATAAATCCTCGCCGTCAATAGCCACCACCATCACCGCCGCATACTTTCCGGGACGAAAACGTTCATAAGTGCGGTGCTCCCCGTTGGCGAATTTCAAATCTACCGACTGAATTTCAAAAATTGTTGATTTTGCTACGGTTTTtata < 1:273368/251‑1 (MQ=255) aTTCCCGATTGGCACTTTGTTCCGGCGTTTCCCCCGCGTCCATTCTGCCTTTCACAAACCCCAGCTCATAACGTTCCGTCCCCACGGCATATTCACGCACCAACAATAAATCCTCGCCGTCAATAGCCACCACCATCACCGCCGCATACTTTCCGGGACGAAAACGTTCATAAGTGCGGTGCTCCCCGTTGGCGAATTTCAAATCTACCGACTGAATTTCAAAAATTGTTGATTTTGCTACGGTTTTtata < 1:185432/251‑1 (MQ=255) ttCCCGATTGGCACTTTGTTCCGGCGTTTCCCCCGCGTCCATTCTGCCTTTCACAAACCCCAGCTCATAACGTTCCGTCCCCACGGCATATTCACGCACCAACAATAAATCCTCGCCGTCAATAGCCACCACCATCACCGCCGCATACTTTCCGGGACGAAAACGTTCATAAGTGCGGTGCTCCCCGTTGGCGAATTTCAAATCTACCGACTGAATTTCAAAAATTGTTGATTTTGCTACGGTTTTTatat > 1:894509/1‑251 (MQ=255) tGGCACTTTGTTCCGGCGTTTCCCCCGCGTCCATTCTGCCTTTCACAAACCCCAGCTCATAACGTTCCGTCCCCACGGCATATTCACGCCCCAACAATAAATCCTCGCCGTCAATAGCCACCACCATCACCGCCGCATACTTTCCGGGACGAAAACGTTCATAAGTGCGGTGCTCCCCGTTGGCGAATTTCAAATCTACCGACTGAATTTCAAAAATTGTTGATTTTGCTACGGTTTTTATATTTAGAAtt < 1:443239/251‑1 (MQ=255) actttGTTCCGGCGTTTCCCCCGCGTCCATTCTGCCTTTCACAAACCCCAGCTCATAACGTTCCGTCCCCACGGCATATTCACGCACCAACAATAAATCCTCGCCGTCAATAGCCACCACCATCACCGCCGCATACTTTCCGGGACGAAAACGTTCATAAGTGCGGTGCTCCCCGTTGGCGAATTTCAAATCTACCGACTGAATTTCAAAAATTGTTGATTTTGCTACGGTTTTTATATTTAGAATTtgtg > 1:422644/5‑251 (MQ=255) gCGTTTCCCCCGCGTCCATTCTGCCTTTCACAAACCCCAGCTCATAACGTTCCGTCCCCACGGCATATTCACGCACCAACAATAAATCCTCGCCGTCAATAGCCACCACCATCACCGCCGCATACTTTCCGGGACGAAAACGTTCATAAGTGCGGTGCTCCCCGTTGGCGAATTTCAAATCTACCGACTGAATTTCAAAAATTGTTGATTTTGCTACGGTTTTTATATTTAGAATTTGTGGTTTTTGTaa < 1:566265/250‑1 (MQ=255) 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AAGCCGATTTCTTCCTGCAATTCCCGATTGGCACTCTGTTCCGGCGTTTCGCCCGCGTCCATTCTGCCTTTCACAAACCCCAGTTCATAACGTTCCGTCCCCACGGCATATTCACGCACCAACAATAAATCCTCGCCGTCAATAGCCACCACCATCACCGCCGCATACTTTCCGGGACGAAAACGTTCATAAGTGCGGTGCTCCCCGTTGGCGAATTTCAAATCTACCGACTGAATTTCAAAACTTGTTGATTTTGCTACGGTTTTTATATTTAGAATTTGTGGTTTTTGTAACGTTGTCATCGCCTTCCCTTGTTTTACAAACAGCTGAAATAGCGATACCATACCCCACTATTTTCACAAAGAAAAGGGACCGCAACGGAATGAATCAACAAAAATTTAACTGGCAGGCAATTGATACCGTAATTCTGGATTTGGACGGAACGCTGATTGATCTTTATTTCGATCACCGCTTCTGGAAAAATAT > 4/4867‑5352 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |