| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 4 | 3,454 | G→A | G139G (GGG→GGA) | unknown → | Inner membrane protein RclC associated with response to reactive chlorine species |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 4 | 3,454 | 0 | G | A | 100.0% | 273.8 / NA | 97 | G139G (GGG→GGA) | unknown | Inner membrane protein RclC associated with response to reactive chlorine species |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (49/48); total (49/48) | |||||||||||
TTTCTTGTACAAAAACGGATCGAATTTAGTACAAAATGACAAAGGCGAGCTGGTGAAAGAATATACCCTTTATAAAAATCCGGAGGGTAAAATGGTGGTGAAAAATATTGAATGGCATAAAGCGAACGGCACTTACACCGCCTCTTATATTATCGGTGCAATGATTGTAACCATTGGTTTATTAACCTTAGCCGGTATCTGGTCGCCGACATTGGGCTTATTTGGCGGGTTGCTCACGTTCGGGATGTCCATCGTTACCTTGTCGTTCCTTATTTTCACACCGGAAACCTGGGTGCCTAATTTGGGTGGTGATTTACCAACGCCGAATTATGGTTTCCCTTATTTATCTGCGGCAGGGCGGCTGGTTATTAAAGATATTATCATGATGGCAGGAGGATTGGTTGCTGCCGCCGAATGCGCTAATCGATGGCTAAAGGCGAAACAATCCGTCTAATTGT‑AAATCTGGCTGAAGCTTATCACCTTGTGAT > 4/3211‑3698 | tttCTTGTACAAAAACGGATCGAATTTAGTACAAAATGACAAAGGCGAGCTGGTGAAAGAATATACCCTTTATAAAAATCCGGAGGGTAAAATGGTGGTGAAAAATATTGAATGGCATAAAGCGAACGGCACTTACACCGCCTCTTATATTATCGGTGCAATGATTGTAACCATTGGTTTATTAACCTTAGCCGGCATCCGGTCGCCGACATTGGGCTTATTTGGCGGGTTGCTCACGTTCGGAATGTcc < 1:393108/250‑1 (MQ=255) 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> 1:383170/1‑251 (MQ=255) gATTGTAACCATTGGTTTATTAACCTTAGCCGGCATCCGGTCGCCGACATTGGGCTTATTTGGCGGGTTGCTCACGTTCGGAATGTCCATCGTCACTTTGTCGTTCCTTATTTTCACACCGGAGACCTGGGTGCCTAATTTGGGCGGTGATTTACCAACGCCGAATTATGGTTTCCCTTATTTATCTGCGGCAGGGCGGCTGGTTATTAAAGATATCATCATGATGGCAGGAGGATTGGTTGccgccgccg > 1:259411/1‑251 (MQ=255) aTTGTAACCATTGGTTTATTAACCTTAGCCGGCATCCGGTCGCCGACATTGGGCTTATTTGGCGGGTTGCTCACGTTCGGAATGTCCATCGTCACTTTGTCGTTCCTTATTTTCACACCGGAGACCTGGGTGCCTAATTTGGGCGGTGATTTACCAACGCCGAATTATGGTTTCCCttattta > 1:699681/1‑183 (MQ=255) tAACCATTGGTTTATTAACCTTAGCCGGCATCCGGTCGCCGACATTGGGCTTATTTGGCGGGTTGCTCACGTTCGGAATGTCCATCGTCACTTTGTCGTTCCTTATTTTCACACCGGAGACCTGGGTGCCTAATTTGGGCGGTGATTTACCAACGCCGAATTATGGTTTCCCTTATTTATCTGCGGCAGGGCGGCTGGTTATTAAAGATATCATCATGATGGCAGGAGGATTGGTTGCCGCCGCCGAATgt > 1:135886/1‑250 (MQ=255) ccATTGGTTTATTAACCTTAGCCGGCATCCGGTCGCCGACATTGGGCTTATTTGGCGGGTTGCTCACGTTCGGAATGTCCATCGTCACTTTGTCGTTCCTTATTTTCACACCGGAGACCTGGGTGCCTAATTTGGGCGGTGATTTACCAACGCCGAATTATGGTTTCCCTTATTTATCTGCGGCAGGGCGGCTGGTTATTaa > 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TTTCTTGTACAAAAACGGATCGAATTTAGTACAAAATGACAAAGGCGAGCTGGTGAAAGAATATACCCTTTATAAAAATCCGGAGGGTAAAATGGTGGTGAAAAATATTGAATGGCATAAAGCGAACGGCACTTACACCGCCTCTTATATTATCGGTGCAATGATTGTAACCATTGGTTTATTAACCTTAGCCGGTATCTGGTCGCCGACATTGGGCTTATTTGGCGGGTTGCTCACGTTCGGGATGTCCATCGTTACCTTGTCGTTCCTTATTTTCACACCGGAAACCTGGGTGCCTAATTTGGGTGGTGATTTACCAACGCCGAATTATGGTTTCCCTTATTTATCTGCGGCAGGGCGGCTGGTTATTAAAGATATTATCATGATGGCAGGAGGATTGGTTGCTGCCGCCGAATGCGCTAATCGATGGCTAAAGGCGAAACAATCCGTCTAATTGT‑AAATCTGGCTGAAGCTTATCACCTTGTGAT > 4/3211‑3698 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |