| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 4 | 3,406 | T→C | G123G (GGT→GGC) | unknown → | Inner membrane protein RclC associated with response to reactive chlorine species |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 4 | 3,406 | 0 | T | C | 100.0% | 233.8 / NA | 85 | G123G (GGT→GGC) | unknown | Inner membrane protein RclC associated with response to reactive chlorine species |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (48/37); total (48/37) | |||||||||||
CTGACGGCATTGCGCATTTTGTATCTAATAGTCCGTTTTTAGGTTTCTTGTACAAAAACGGATCGAATTTAGTACAAAATGACAAAGGCGAGCTGGTGAAAGAATATACCCTTTATAAAAATCCGGAGGGTAAAATGGTGGTGAAAAATATTGAATGGCATAAAGCGAACGGCACTTACACCGCCTCTTATATTATCGGTGCAATGATTGTAACCATTGGTTTATTAACCTTAGCCGGTATCTGGTCGCCGACATTGGGCTTATTTGGCGGGTTGCTCACGTTCGGGATGTCCATCGTTACCTTGTCGTTCCTTATTTTCACACCGGAAACCTGGGTGCCTAATTTGGGTGGTGATTTACCAACGCCGAATTATGGTTTCCCTTATTTATCTGCGGCAGGGCGGCTGGTTATTAAAGATATTATCATGATGGCAGGAGGATTGGTTGCTGCCGCCGAATGCGCTAATCGATG > 4/3168‑3639 | cTGACGGCATTGCGCATTTTGTATCTAATAGTCCGTTTTTAAGTTTCTTGTACAAAAACGGATCGAATTTAGTACAAAATGACAAAGGCGAGCTGGTGAAAGAATATACCCTTTATAAAAATCCGGAGGGTAAAATGGTGGTGAAAAATATTGAATGGCATAAAGCGAACGGCACTTACACCGCCTCTTATATTATCGGTGCAATGATTGTAACCATTGGTTTATTAACCTTAGCCGGCATCCGGTCGCCg < 1:223234/251‑1 (MQ=255) 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1:373036/1‑178 (MQ=255) gTGCAATGATTGTAACCATTGGTTTATTAACCTTAGCCGGCATCCGGTCGCCGACATTGGGCTTATTTGGCGGGTTGCTCACGTTCGGAATGTCCATCGTCACTTTGTCGTTCCTTATTTTCACACCGGAGACCTGGGTGCCTAATTTGGGCGGTGATTTACCAACGCCGAATTATGGTTTCCCTTATTTATCTGCGGCAGGGCGGCTGGTTATTAAAGATATCATCATGATGGCAGGAGGATTGGTtgc > 1:90133/1‑250 (MQ=255) gTGCAATGATTGTAACCATTGGTTTATTAACCTTAGCCGGCATCCGGTCGCCGACATTGGGCTTATTTGGCGGGTTGCTCACGTTCGGAATGTCCATCGTCACTTTGTCGTTCCTTATTTTCACACCGGAGACCTGGGTGCCTAATTTGGGCGGTGATTTACCAACGCCGAATTATGGTTTCCCTTATTTATCTGCGGCAGGGCGGCTGGTTATTAAAGATATCATCATGATGGCAGGAGGATTGGTtgc > 1:29983/1‑250 (MQ=255) gTGCAATGATTGTAACCATTGGTTTATTAACCTTAGCCGGCATCCGGTCGCCGACATTGGGCTTATTTGGCGGGTTGCTCACGTTCGGAATGTCCATCGTCAATTTGTCGTTCCTTATTTTCACACCGGAGACCTGGGTGCCTAATTTGGGCGGTGATTTACCAACGCCGAATTATGGTTTCCCTTATTTATCTGCGGCAGGGCGGCTGGttatcaa > 1:835790/1‑214 (MQ=255) cAATGATTGTAACCATTGGTTTATTAACCTTAGCCGGCATCCGGTCGCCGACATTGGGCTTATTTGGCGGGTTGCTCACGTTCGGAATGTCCATCGTCACTTTGTCGTTCCTTATTTTCACACCGGAGAcc > 1:51838/1‑131 (MQ=255) 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1:65531/1‑202 (MQ=255) ccATTGGTTTATTAACCTTAGCCGGCATCCGGTCGCCGACATTGGGCTTATTTGGCGGGTTGCTCACGTTCGGAATGACCATCGTCACTTTGTCGTTCCTTATTTTCACACCGGAGACCTGGGTGCCTAATTTGGGCGGTGATTTACCAACGCCGAATTATGGTTTCCCTTATTTATCTGCGGCAGGGCGGCTGGTTATTAAAGATATCATCATGATGGCAGGAGGATTGGTTGCCGCCGCCGAATgtgca > 1:424952/1‑247 (MQ=255) tttATTAACCTTAGCCGGCATCCGGTCGCCGACATTGGGCTTATTTGGCGGGTTGCTCACGTTCGGAATGTCCATCGTCACTTTGTCGTTCCTTATTTTCACACCGGAGACCTGGGTGCCTAATTTGGGCGGTGATTTACCAACGCCGAATTATGGTTTCCCTTATTTATCTGCGGCAGGGCGGCTGGTTATTAAAGATATCATCATGATGGCAGGAGGATTGGTTGCCGCCGCCGAATGTGCAAATCggt > 1:496076/1‑249 (MQ=255) ttattaACCTTAGCCGGCATCCGGTCGCCGACATTGGGCTTATTTGGCGGGTTGCTCACGTTCGGAATGTCCATCGTCACTTTGTCGTTCCTTATTTTCACACCGGAGACCTGGGTGCCTAATTTGGGCGGTGATTTACCAACGCCGAATTATgg < 1:406823/155‑1 (MQ=255) ttattaACCTTAGCCGGCATCCGGTCGCCGACATTGGGCTTATTTGGCGGGTTGCTCACGTTCGGAATGTCCATCGTCACTTTGTCGTTCCTTATTTTCACACCGGAGACCTGGGTGCCTAATTTGGGCGGTGATTTACCAACGCCGAATTATGGTTTCCCttattt > 1:310264/1‑167 (MQ=255) 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ttattaACCTTAGCCGGCATCCGGTCGCCGACATTGGGCTTATTTGGCGGGTTGCTCACGTTCGGAATGTCCATCGTCACTTTGTCGTTCCTTATTTTCACACCGGAGACCTGGGTGCCTAATTTGGGCGGTGATTTACCAACGCCGAATTATGGTTTCCCTTATTTATCTGCGGCAGGGCGGCTGGTTATTAAAGATATCATCATGATGGCAGGAGGATTGGTTGCCGCCGCCGAATGTGCAAATCggtg > 1:223523/1‑248 (MQ=255) cTTAGCCGGCATCCGGTCACCGACATTGGGCTTATTTGGCGGGTTGCTCACGTTCGGAATGTCCATCGTCACTTTGTCGTTCCTTATTTTCACACCGGAGACCTGGGTGCCTAATTTGGGCGGTGATTTACCAACGCCGAATTATGGTTTCCCTTATTTATCTGCGGCAGGGCGGCTGGTTATTAAAGATATCATCATGATGGCAGGAGGATTGGTTGCCGCCGCCGAATgtgcaaat < 1:75073/238‑8 (MQ=255) tAGCCGGCATCCGGTCGCCGACATTGGGCTTATTTGGCGGGTTGCTCACGTTCGGAATGTCCATCGTCACTTTGTCGTTCCTTATTTTCACACCGGAGACCTGGGTGCCTAATTTGGGCGGTGATTTACCAACGCCGAATTATGGTTTCCCTTATTTATCTGCGGCAGGGCGGCTGGTTATTAAAg < 1:152397/186‑1 (MQ=255) gCCGGCATCCGGTCGCCGACATTGGGCTTATTTGGCGGGTTGCTCACGTTCGGAATGTCCATCGTCACTTTGTCGTTCCTTATTTTCACACCGGAGACCTGGGTGCCTAATTTGGGCGGTGATTTACCAACGCCGAATTATGGTTTCCCTTATTTATCTGCGGCAGGGCGGCTGGTTATTAAAGATATCATCATGATGGc > 1:786710/1‑200 (MQ=255) | CTGACGGCATTGCGCATTTTGTATCTAATAGTCCGTTTTTAGGTTTCTTGTACAAAAACGGATCGAATTTAGTACAAAATGACAAAGGCGAGCTGGTGAAAGAATATACCCTTTATAAAAATCCGGAGGGTAAAATGGTGGTGAAAAATATTGAATGGCATAAAGCGAACGGCACTTACACCGCCTCTTATATTATCGGTGCAATGATTGTAACCATTGGTTTATTAACCTTAGCCGGTATCTGGTCGCCGACATTGGGCTTATTTGGCGGGTTGCTCACGTTCGGGATGTCCATCGTTACCTTGTCGTTCCTTATTTTCACACCGGAAACCTGGGTGCCTAATTTGGGTGGTGATTTACCAACGCCGAATTATGGTTTCCCTTATTTATCTGCGGCAGGGCGGCTGGTTATTAAAGATATTATCATGATGGCAGGAGGATTGGTTGCTGCCGCCGAATGCGCTAATCGATG > 4/3168‑3639 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |