| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 4 | 2,952 | C→G | intergenic (‑283/‑86) | unknown ← / → unknown | Predicted membrane protein/Inner membrane protein RclC associated with response to reactive chlorine species |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 4 | 2,952 | 0 | C | G | 100.0% | 191.7 / NA | 67 | intergenic (‑283/‑86) | unknown/unknown | Predicted membrane protein/Inner membrane protein RclC associated with response to reactive chlorine species |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (43/24); total (43/24) | |||||||||||
CAAGATTCATTCAGTTTATTTTACTTAAATTGAATTTTATTTAAATTTATATCGTATTTTTTAATATATTTCTAATTACGAGTCTTTCATTGGCGTCTACTCGGTAGCAAAATAAATAGCCGCAGGACATCGTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATACTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAGTCTGTCAATATGAAGCTGACGGCATTGCGCATTTTGTATCTAATA > 4/2735‑3197 | cAAGATTCATTCAGTTTATTTTACTTAAATTGAATTTTATTTAAATTTATATCGTATTTTTTAATATATTTCTAATTACGAGTCTTTCATTGGCGTCTACTCGGTAGCAAAATAAATAGCCGCAGGACATCGTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAAc < 1:340697/251‑1 (MQ=255) ttcaGTTTATTTTACTTAAATTGAATTTTATTTAAATTTATATCGTATTTTTTAATATATTTCTAATTACGAGTCTTTCATTGGCGTCTACTCGGTAGCAAAATAAATAGCCGCAGGACATCGTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAgg < 1:417973/251‑1 (MQ=255) ttatttaAATTTATATCGTATTTTTTAATATATTTCTAATTACGAGTCTTTCATTGGCGTCTACTCGGTAGCAAAATAAATAGCCGCAGGACATCGTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAAt < 1:767161/251‑1 (MQ=255) atatCGTATTTTTTAATATATTTCTAATTACGAGTCTTTCATTGGCGTCTACTCGGTAGCAAAATAAATAGCCGCAGGACATCGTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTat < 1:760836/220‑1 (MQ=255) ttttAATATATTTCTAATTACGAGTCTTTCATTGGCGTCTACTCGGTAGCAAAATAAATAGCCGCAGGACATCGTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCAc < 1:496338/217‑1 (MQ=255) atatatTTCTAATTACGAGTCTTTCATTGGCGTCTACTCGGTAGCAAAATAAATAGCCGCAGGACATCGTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTa > 1:675651/1‑215 (MQ=255) atatatTTCTAATTACGAGTCTTTCATTGGCGTCTACTCGGTAGCAAAATAAATAGCCGCAGGACATCGTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGcatt > 1:405450/1‑251 (MQ=255) aaTTACGAGTCTTTCATTGGCGTCTACTCGGTAGCAAAATAAATAGCCGCAGGACATCGTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAGTTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTa > 1:312169/1‑251 (MQ=255) aTTACGAGTCTTTCATTGGCGTCTACTCGGTAGCAAAATAAATAGCCGCAGGACATCGTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTAc < 1:527585/251‑1 (MQ=255) gTCTTTCATTGGCGTCTACTCGGTAGCAAAATAAATAGCCGCAGGACATCGTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTaa > 1:753457/1‑251 (MQ=255) tCTTTCATTGGCGTCTACTCGGTAGCAAAATAAATAGCCGCAGGACATCGTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTaaa > 1:708067/1‑251 (MQ=255) tttCATTGGCGTCTACTCGGTAGCAAAATAAATAGCCGCAGGACATCGTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAAt > 1:511106/1‑251 (MQ=255) taaattggcgttgcatcggtgCAAAATAAATAGCCGCAGGACATCGTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAAttg < 1:654553/231‑1 (MQ=255) ggCGTCTACTCGGTAGCAAAATAAATAGCCGCAGGACATCGTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTc > 1:700147/1‑130 (MQ=255) cGTCTACTCGGTAGCAAAATAAATAGCCGCAGGACATCGTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCAc > 1:684835/1‑250 (MQ=255) cGTCTACTCGGTAGCAAAATAAATAGCCGCAGGACATCGTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCAc > 1:104083/1‑250 (MQ=255) cTACTTGGTAGCAAAATAAATAGCCGCAGGACATCGTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTg > 1:814190/1‑198 (MQ=255) aCTCGGTAGCAAAATAAATAGCCGCAGGACATCGTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATg > 1:393156/1‑250 (MQ=255) cGGTAGCAAAATAAATAGCCGCAGGACATCGTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGcat < 1:733630/212‑1 (MQ=255) aaataaatAGCCGCAGGACATCGTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAAttt < 1:842993/251‑1 (MQ=255) ccGCAGGACATCGTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCAcc > 1:519756/1‑105 (MQ=255) gTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGttt > 1:888548/1‑132 (MQ=255) gTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCAc < 1:107901/212‑1 (MQ=255) gTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCa > 1:787472/1‑251 (MQ=255) taATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTg < 1:376575/251‑1 (MQ=255) gTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCAc < 1:442981/191‑1 (MQ=255) gTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGa > 1:869453/1‑251 (MQ=255) aTAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACt > 1:53421/1‑162 (MQ=255) aTAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTaa > 1:369791/1‑251 (MQ=255) gTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGAt > 1:228590/1‑237 (MQ=255) gTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAg > 1:674979/1‑251 (MQ=255) gTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAg > 1:354880/1‑251 (MQ=255) tAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAg < 1:814028/250‑1 (MQ=255) ggAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTaaaa < 1:75815/246‑1 (MQ=255) gAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAGt > 1:139054/1‑247 (MQ=255) aTCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAgg < 1:552423/69‑1 (MQ=255) aTCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTat < 1:144602/94‑1 (MQ=255) tCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAGTCTGTCaa > 1:61647/1‑251 (MQ=255) gAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAGTCTGTCAATATGa > 1:386973/1‑251 (MQ=255) cATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAGTCTGTCAATATGAAg < 1:184148/250‑1 (MQ=255) tatCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAGTCTGTCAATATGAAg > 1:520312/1‑248 (MQ=255) tCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAGTCTGTCAATATGAAGCTGAc < 1:228134/251‑1 (MQ=255) atttatttATCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAGTCTGTCAATATGAAGCTGACGGc < 1:90001/251‑1 (MQ=255) tatCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAGTCTGTCAATATGAAGCTGACGGCATTgcgc < 1:777118/251‑1 (MQ=255) atCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCAtt > 1:83298/1‑186 (MQ=255) atCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATgg > 1:216472/1‑199 (MQ=255) atCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAGTCTGTCAATATGAAGCTGACGGCATTGCGCa > 1:67486/1‑251 (MQ=255) atCTTAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAGTCTGTCAATATGAAGCTGACGGCATTGCGCa > 1:526401/1‑251 (MQ=255) tAAATATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTc > 1:896859/1‑197 (MQ=255) aaaTATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAGTCTGTCAATATGAAGCTGACGGCATTGCGCATTTTg < 1:420944/251‑1 (MQ=255) aaaTATCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAGTCTGTCAATATGAAGCTGACGGCATTGCGCATTTTg > 1:844731/1‑251 (MQ=255) atatCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAGTCTGTCAATATGAAGCTGACGGCATTGCGCATTTTGTa > 1:726110/1‑251 (MQ=255) atatCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAGTCTGTCAATATGAAGCTGACGGCATTGCGCATTTTGTa > 1:438515/1‑251 (MQ=255) atCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGAt > 1:188684/1‑197 (MQ=255) atCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAGTCTGTCAATATGAAGCTGACGGCATTGCGCATTTTGTAt > 1:117819/1‑250 (MQ=255) atCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAGTCTGTCAATATGAAGCTGACGGCATTGCGCATTTTGTAt > 1:306985/1‑250 (MQ=255) atCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAGTCTGTCAATATGAAGCTGACGGCATTGCGCATTTTGTAt > 1:778054/1‑250 (MQ=255) atCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAGTCTGTCAATATGAAGCTGACGGCATTGCGCATTTTGTAt > 1:801857/1‑250 (MQ=255) atCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAGTCTGTCAATATGAAGCTGACGGCATTGCGCATTTTGTAt > 1:132817/1‑250 (MQ=255) atCCGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGAGGCTTAAAAGTCTGTCAATATGAAGCTGACGGCATTGCGCATTTTGTAt > 1:394054/1‑250 (MQ=255) ccGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGt > 1:229966/1‑178 (MQ=255) ccGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTc > 1:120778/1‑190 (MQ=255) ccGATATAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATtggtg < 1:863429/200‑1 (MQ=255) atatAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAAt < 1:58684/154‑1 (MQ=255) atatAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTAc < 1:556227/161‑1 (MQ=255) atatAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAGTCTGTCAATATg > 1:617626/1‑218 (MQ=255) atatAGTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAGTCTGTCAATATGAAGCTGACGGCATTGCGCATTTTGTATCTAATa > 1:461530/1‑251 (MQ=255) | CAAGATTCATTCAGTTTATTTTACTTAAATTGAATTTTATTTAAATTTATATCGTATTTTTTAATATATTTCTAATTACGAGTCTTTCATTGGCGTCTACTCGGTAGCAAAATAAATAGCCGCAGGACATCGTTATAATCTTAAGTTCATCTGTTTTAGTATCAATAGTAAGGAATCTTGGAGCATATCAATTTATTTATCTTAAATATCCGATATACTTCACCAAACCTAATTCTACTTAGGTAAATAACCGCTAAAGGTTTCGTATCATCCACTTAATTATGAATTTCCGTGAGGCTAAAAATGAATGCATTCATTGAATTACTTGCTAAAATTGTTGCACCGATGCAACGCCAATTTATTAATTTTGTACGCATTGCCATTTGTATCGTAATGGTCTGGATTGGTGGCTTAAAAGTCTGTCAATATGAAGCTGACGGCATTGCGCATTTTGTATCTAATA > 4/2735‑3197 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |