| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 3 | 101,257 | C→T | A254T (GCT→ACT) | unknown ← | Methionine ABC transporter substrate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 3 | 101,257 | 0 | C | T | 100.0% | 218.6 / NA | 81 | A254T (GCT→ACT) | unknown | Methionine ABC transporter substrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (35/46); total (35/46) | |||||||||||
TTTTCCGTATTTGTCGGCGAAATGCCCGTTTTCAATGGCTAAACTGGTGACTTTCATCTTAATTTTCTCCTTAAAAAACACTCAAAAGAATAACCGCACTTTTTGCCCTGATGGGCTGAAAAGTGCGGGCATATTTTACGGTGTTTTT‑CGCGGGGCTTCAAATTACCAGCCTTTTACCACGCCGTCTTTAAAGTGTTTTTTCGCTTCTTGTTCCACTTCCGGGGTTTGGTAGGCTTTCACGAAAGCCTGTACGGCTTTGCTGTCTTTGTTATCGGTCCGTGCCACGATAATATTTACATACGGTGAATCTTTATCTTCCACAAATACGCCGTGATCTTGCGCATTTAAGCCTACTTGACCGGCGTAGTTGTTATTCACTACCGCCAAATCAACGTCATCTAAGGCACGTGCCGCAACGGAGGTATCCACTTCTTTGATTTGTAAATTTTTCGGATTTTCAATGATATCTATAGAAGTGGAGAACAGG > 3/101012‑101498 | ttttCCGTATTTGTCGGCGAAATGCCCGTTTTCAATGGCTAAACTGGTGACTTTCATCTTAATTTTCTCCTTAAAAAACACTCAAAAGAATAACCGCACTTTTTGCCCTGATGGGCTGAAAAGTGCGGGCATATTTTACGGTGTTTTT‑CGCGGGGCTTCAAATTACCAGCCTTTTACCACGCCGTCTTTAAAGTGTTTTTTCGCTTCTTGTTCCACTTCCGGGGTTTGGTAGGCTTTCACGAAAGTCTGt < 1:141376/250‑1 (MQ=255) 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TTTTCCGTATTTGTCGGCGAAATGCCCGTTTTCAATGGCTAAACTGGTGACTTTCATCTTAATTTTCTCCTTAAAAAACACTCAAAAGAATAACCGCACTTTTTGCCCTGATGGGCTGAAAAGTGCGGGCATATTTTACGGTGTTTTT‑CGCGGGGCTTCAAATTACCAGCCTTTTACCACGCCGTCTTTAAAGTGTTTTTTCGCTTCTTGTTCCACTTCCGGGGTTTGGTAGGCTTTCACGAAAGCCTGTACGGCTTTGCTGTCTTTGTTATCGGTCCGTGCCACGATAATATTTACATACGGTGAATCTTTATCTTCCACAAATACGCCGTGATCTTGCGCATTTAAGCCTACTTGACCGGCGTAGTTGTTATTCACTACCGCCAAATCAACGTCATCTAAGGCACGTGCCGCAACGGAGGTATCCACTTCTTTGATTTGTAAATTTTTCGGATTTTCAATGATATCTATAGAAGTGGAGAACAGG > 3/101012‑101498 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |