| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 403,798 | C→G | intergenic (‑194/‑234) | unknown ← / → unknown | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 403,798 | 0 | C | G | 100.0% | 218.0 / NA | 77 | intergenic (‑194/‑234) | unknown/unknown | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (39/38); total (39/38) | |||||||||||
CGAGTGCGCCCGCTGTGTCGCGCAAGAAACAGGCTGCGCAGAAGCCCATATTGCCGGGATTGCCATTGTAGGTTAGAAGTGGAGCAACGATACCAAGTGCAGCACCTGCAACCACAGGCCAAGTTAAGATTTTCATAATAAGACCCTTGTGATATCTGAAGTAAATGTGAATGGTGTTTTTAATGTTTTAAAAACGCTTTCATTGTAAAAAGACGCTCAAAATAAGAAAAGCATCTTGTGGTCATATTGTGAGCGGGATCAAGGATTTATTTTTAAATGCAAAAACGACCGCACTTTTGGCGACGGGGAGCGTATTTTTCTCTAAAGTGCGGTGGTTTTTGGCGATGTTTTTTTGATGTAAACCAATAAATATTCAGATGATAATGAATTGCATTTGTTGTAGGGGTATAATCGGCTTGTCGCCTATTTATTGAGCGACAAGCAGTTTGATTTGACGATTTAAAAGGAGCAAAAATATGTTAAAAAAC > 1/403556‑404043 | cGAGTGCGCCCGCTGTGTCGCGCAAGAAACAGGCTGCGCAGAAGCCCATATTGCCGGGATTGCCATTGTAGGTTAGAAGTGGAGCAACGATACCAAGTGCAGCACCTGCAACCACAGGCCAAGTTAAGATTTTCATAATAAGACCCTTGTGATATCTGAAGTAAATGTGAATGGTGTTTTTAATGTTTTAAAAACGCTTTCATTGTAAAAAGACGCTCAAAATAAGAAAAGCATCTTGTGGTGATATtgtg < 1:242308/251‑1 (MQ=255) 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CGAGTGCGCCCGCTGTGTCGCGCAAGAAACAGGCTGCGCAGAAGCCCATATTGCCGGGATTGCCATTGTAGGTTAGAAGTGGAGCAACGATACCAAGTGCAGCACCTGCAACCACAGGCCAAGTTAAGATTTTCATAATAAGACCCTTGTGATATCTGAAGTAAATGTGAATGGTGTTTTTAATGTTTTAAAAACGCTTTCATTGTAAAAAGACGCTCAAAATAAGAAAAGCATCTTGTGGTCATATTGTGAGCGGGATCAAGGATTTATTTTTAAATGCAAAAACGACCGCACTTTTGGCGACGGGGAGCGTATTTTTCTCTAAAGTGCGGTGGTTTTTGGCGATGTTTTTTTGATGTAAACCAATAAATATTCAGATGATAATGAATTGCATTTGTTGTAGGGGTATAATCGGCTTGTCGCCTATTTATTGAGCGACAAGCAGTTTGATTTGACGATTTAAAAGGAGCAAAAATATGTTAAAAAAC > 1/403556‑404043 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |