| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 3 | 65,652 | A→G | T47A (ACA→GCA) | unknown → | Nickel ABC transporter, substrate‑binding protein NikA (TC 3.A.1.5.3) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 3 | 65,652 | 0 | A | G | 100.0% | 227.7 / NA | 79 | T47A (ACA→GCA) | unknown | Nickel ABC transporter, substrate‑binding protein NikA (TC 3.A.1.5.3) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (46/33); total (46/33) | |||||||||||
ATCGAAAACGAAGATTTAAGCCGCTTTATTCTTTAATCTTTCTCTTTTGATTTTAGGCATGATAGTTGTATCATGCCTTTTGTTTATAGATGGAGAGATTCATGAAAAAAATAACTTTAATTCTGACCGCACTTTTCACCGCCTTGCCAAGCTGGGCGAATATGCAAAACAACGAATTGGATTACGCCAGCACGAAAGATATTCGTGATATTAATCCGCATTTGTATAGCGGTGAAATGACAGCGCAGAATATGGTGTTTGAGCCCTTGGTGCTGAATACGGAATTCGGTCCACAGCCGTATTTGGCGGAAAGTTGGAGTATCTCGCCGGATGGCAAAACCTATATTTTCAAATTACGCAAAGATGTCAAATTCAGCGACGGCGAACCATTCAATGCTCAGGCGGTGAAGCTGAACATCGATGCCGTACTGGATAATTATACCCGTCATGCATGGTTGGAGCTGGTGCAACAAATCGACAGCGT > 3/65413‑65896 | aTCGAAAACGAAGATTTAAGCCGCTTTATTCTTTAATCTTTCTCTTTTGATTTTAGGCATGATAGTTGTATCATGCCTTTTGTTTATAGATGGAGAGATTCATGAAAAAAATAACTTTAATTCTGACCGCACTTTTCACCGCCTTGCCAAGCTGGGCGAATATGCAAAACAACGAATTGGATTACGCCAGCACGAAAGATATTCGTGATATTAATCCGCATTTGTATAGCGGTGAAATGGCAGCGCAGAat < 1:741788/251‑1 (MQ=255) 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atatTAATCCGCATTTGTATAGCGGTGAAATGGCAGCGCAGAATATGGTGTTTGAGCCCTTGGTGCTGAATACGGAATTCGGTCCACAGCCGTAttt > 1:857543/1‑97 (MQ=255) atatTAATCCGCATTTGTATAGCGGTGAAATGGCAGCGCAGAATATGGTGTTTGAGCCCTTGGTGCTGAATACGGAATTCGGTCCACAGCCGTATTTGGCGGAAAGTTGGAGTATCTCGCCGGATGGCAAAACCTATATTTTCAAATTACGCAAAGATGTCAAATTCAGCGACGGCGAACCATTCAATGCTCAGGCgg > 1:4857/1‑198 (MQ=255) atatTAATCCGCATTTGTATAGCGGTGAAATGGCAGCGCAGAATATGGTGTTTGAGCCCTTGGTGCTGAATACGGAATTCGGTCCACAGCCGTATTTGGCGGAAAGTTGGAGTATCTCGCCGGATGGCAAAACCTATATTTTCAAATTACGCAAAGATGTCAAATTCAGCGACGGCGAACCATTCAATGCTCAGGCGGTGAAGCTGAACATCGATGCCGTACTGGAt < 1:684217/227‑1 (MQ=255) atatTAATCCGCATTTGTATAGCGGTGAAATGGCAGCGCAGAATATGGTGTTTGAGCCCTTGGTGCTGAATACGGAATTCGGTCCACAGCCGTATTTGGCGGAAAGTTGGAGTATCTCGCCGGATGGCAAAACCTATATTTTCAAATTACGCAAAGATGTCAAATTCAGCGACGGCGAACCATTCAATGCTCAGGCGGTGAAGCTGAACATCGATGCCGTACTGGATAATta > 1:651232/1‑232 (MQ=255) atatTAATCCGCATTTGTATAGCGGTGAAATGGCAGCGCAGAATATGGTGTTTGAGCCCTTGGTGCTGAATACGGAATTCGGTCCACAGCCGTATTTGGCGGAAAGTTGGAGTATCTCGCCGGATGGCAAAACCTATATTTTCAAATTACGCAAAGATGTCAAATTCAGCGACGGCGAACCATTCAATGCTCAGGCGGTGAAGCTGAACATCGATGCCGTACTGGATAATTATACCCGTCATGCATGGTTg > 1:344658/1‑251 (MQ=255) tAATCCGCATTTGTATAGCGGTGAAATGGCAGCGCAGAATATGGTGTTTGAGCCCTTGGTGCTGAATACGGAATTCGGTCCACAGCCGTATTTGGCGGAAAGTTGGAGTATCTCGCCGGATGGCAAAACCTATATTTTCAAATTACGCAAAGATGTCAAATTCAGCGACGGCGAACCATTCAATGCTCAGGCGGTGAAGCTGAACATCGATGCCGTACTGGATAATTATACCCGTCATGCATGGTTGGAGc < 1:844778/251‑1 (MQ=255) cGCATTTGTATAGCGGTGAAATGGCAGCGCAGAATATGGTGTTTGAGCCCTTGGTGCTGAATACGGAATTCGGTCCACAGCCGTATTTGGCGGAAAGTTGGAGTATCTCGCCGGATGGCAAAACCTATATTTTCAAATTACGCAAAGATGTCAAATTCAGCGACGGCGAACCATTCAATGCTCAGGCGGTGAAGCTGAACATCGATGCCGTACTGGATAATTATACCCGTCATGCATGGTTGGAGCTGGTg < 1:710010/251‑1 (MQ=255) cATTTGTATAGCGGTGAAATGGCAGCGCAGAATATGGTGTTTGAGCCCTTGGTGCTGAATACgg < 1:332465/64‑1 (MQ=255) cATTTGTATAGCGGTGAAATGGCAGCGCAGAATATGGTGTTTGAGCCCTTGGTGCTGAATACGGAATTCGGTCCACAGCCGTATTTGGCGGAAAGTTGGAGTATCTCGCCGGATGGc < 1:815781/117‑1 (MQ=255) cATTTGTATAGCGGTGAAATGGCAGCGCAGAATATGGTGTTTGAGCCCTTGGTGCTGAATACGGAATTCGGTCCACAGCCGTATTTGGCGGAAAGTTGGAGTATCTCGCCGGATGGCAAAACCTATATTTTCaaa > 1:602893/1‑135 (MQ=255) cATTTGTATAGCGGTGAAATGGCAGCGCAGAATATGGTGTTTGAGCCCTTGGTGCTGAATACGGAATTCGGTCCACAGCCGTATTTGGCGGAAAGTTGGAGTATCTCGCCGGATGGCAAAACCTATATTTTCAAATTACGCAAAGATGTCAAATTCAGCGACGGCGAACCATTCAATGCTCAGGCGGTGAAGCTGAACATCGATGCCGTACTGGATAATTATAcc > 1:263288/1‑225 (MQ=255) cATTTGTATAGCGGTGAAATGGCAGCGCAGAATATGGTGTTTGAGCCCTTGGTGCTGAATACGGAATTCGGTCCACAGCCGTATTTGGCGGAAAGTTGGAGTATCTCGCCGGATGGCAAAACCTATATTTTCAAATTACGCAAAGATGTCAAATTCAGCGACGGCGAACCATTCAATGCTCAGGCGGTGAAGCTGAACATCGATGCCGTACTGGATAATTATACCCGTCATGCATGGTTGGAGCTGGTGca > 1:116208/1‑251 (MQ=255) 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ttGTATAGCGGTGAAATGGCAGCGCAGAATATGGTGTTTGAGCCCTTGGTGCTGAATACGGAATTCGGTCCACAGCCGTATTTGGCGGAAAGTTGGAGTATCTCGCCGGATGGCAAAACCTATATTTTCAAATTACGCAAAGATGTCAAATTCAGCGACGGCGAACCATTCAATGCTCAGGCGGTGAAGCTGAACATCGATGCCGTACTGGATAATTATACCCGTCATGCATGGTTGGAGCTGGTGcaaca < 1:829875/251‑1 (MQ=255) gTATAGCGGTGAAATGGCAGCGCAGAATATGGTGTTTGAGCCCTTGGTGCTGAATACGGAATTCGGTCCACAGCCGTATTTGGCGGAAAGTTGGAGTATCTCGCCGGATGGCAAAACCTATATTTTCAAATTACGCAAAGATGTCAAATTCAGCGACGGCGAACCATTCAATGCTCAGGCg < 1:690661/181‑1 (MQ=255) gTATAGCGGTGAAATGGCAGCGCAGAATATGGTGTTTGAGCCCTTGGTGCTGAATACGGAATTCGGTCCACAGCCGTATTTGGCGGAAAGTTGGAGTATCTCGCCGGATGGCAAAACCTATATTTTCAAATTACGCAAAGATGTCAAATTCAGCGACGGCGAACCATTCAATGCTCAGGCGGTGAAGCTGAACATCGATGCCGTACTGGAt > 1:661538/1‑211 (MQ=255) gTATAGCGGTGAAATGGCAGCGCAGAATATGGTGTTTGAGCCCTTGGTGCTGAATACGGAATTCGGTCCACAGCCGTATTTGGCGGAAAGTTGGAGTATCTCGCCGGATGGCAAAACCTATATTTTCAAATTACGCAAAGATGTCAAATTCAGCGACGGCGAACCATTCAATGCTCAGGCGGTGAAGCTGAACATCGATGCCGTACTGGATAATTATACCCGTCATGCATGGTTGGAGCTGGTGCAACaaa > 1:210228/1‑251 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |