| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 38,571 | G→C | A241P (GCA→CCA) | unknown → | L‑threonate/D‑erythronate transcriptional regulator, DeoR family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 38,571 | 0 | G | C | 100.0% | 260.9 / NA | 90 | A241P (GCA→CCA) | unknown | L‑threonate/D‑erythronate transcriptional regulator, DeoR family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (43/47); total (43/47) | |||||||||||
TACGTCAGCTGTCGGTTGACATTGCTTTTATCTCTACCTCTTCTTGGACATTGACGGGCTTAACTACGCCGGATGAAATGAAGCTACCGGTGAAAAAAACGATAATTGAGTCAAGCAATAAGCGGATCTTAGTCTCAGACTCTTCAAAATACGGCAAAGTTGCCACCTTCAAAATTGCAGCCTTAAGCGTTTTCAATACGATTATTTGTGATAAGAATTTATTGCCTAATACAAAAGAAGCAATCCATGATATGGATATTGAATTGTTGCTGGTATAACAAAATGTCGGGGCTAAGTTGGTATAGCTTACAAGTGCGGTTATTTTTTTGAGTATTTTTTAAGGAGCGATCATCATGAAAAAAATCGAAGCGATTATAAAACCGTTTAAACTGGACGATGTGCGTGAAGCCTTGTCGGACATTGGCATTACCGGCATGACGGTGACTGAGGTGCGCGGTTTCGGGCGGCAAAAAGGGCATACG > 1/38332‑38813 | tACGTCAGCTGTCGGTTGACATTGCTTTTATCTCTACCTCTTCTTGGACATTGACGGGCTTAACTACGCCGGATGAAATGAAGCTACCGGTGAAAAAAACGATAATTGAGTCAAGCAATAAGCGGATCTTAGTCTCAGACTCTTCAAAATACGGCAAAGTTGCCACCTTCAAAATTGCAGCCTTAAGCGTTTTCAATACGATTATTTGTGATAAGAATTTATTGCCTAATACAAAAGAACCAATCCATGat < 1:728454/251‑1 (MQ=255) 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1:528350/1‑251 (MQ=255) aaaaGAACCAATCCATGATATGGATATTGAATTGTTGCTGGTATAACAAAATGTCGGGGCTAAGTTGGTATAGCTTACAAg > 1:572886/1‑81 (MQ=255) | TACGTCAGCTGTCGGTTGACATTGCTTTTATCTCTACCTCTTCTTGGACATTGACGGGCTTAACTACGCCGGATGAAATGAAGCTACCGGTGAAAAAAACGATAATTGAGTCAAGCAATAAGCGGATCTTAGTCTCAGACTCTTCAAAATACGGCAAAGTTGCCACCTTCAAAATTGCAGCCTTAAGCGTTTTCAATACGATTATTTGTGATAAGAATTTATTGCCTAATACAAAAGAAGCAATCCATGATATGGATATTGAATTGTTGCTGGTATAACAAAATGTCGGGGCTAAGTTGGTATAGCTTACAAGTGCGGTTATTTTTTTGAGTATTTTTTAAGGAGCGATCATCATGAAAAAAATCGAAGCGATTATAAAACCGTTTAAACTGGACGATGTGCGTGAAGCCTTGTCGGACATTGGCATTACCGGCATGACGGTGACTGAGGTGCGCGGTTTCGGGCGGCAAAAAGGGCATACG > 1/38332‑38813 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |