| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 394,220 | G→C | V260V (GTC→GTG) | unknown ← | Protein translocase subunit SecF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 394,220 | 0 | G | C | 100.0% | 215.9 / NA | 79 | V260V (GTC→GTG) | unknown | Protein translocase subunit SecF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (44/35); total (44/35) | |||||||||||
AGTAAAAAGTGCGGTCGAAATTCACTATGAATTTTAACCGCACTTTTGTTATTGACTAAGGCAGCTCATCAATATCATCTTTGTTCACTTTGGGTTGCACCATGTGTTCACGGTCAAGACCTAAGTCATATGCAATAGCAATCGCAACGAAGATAGAAGAGTATGTCCCGAATCCGATACCTATTAAGAGGGCCAACGAGAAACTATGGATTGTCGGACCGCCGAAGACAAAAAGGGCGATGACCACAATTAACGTCGTCACTGAAGTCATAATAGTTCGGGAGAGAGTTTGTGTTAATGAAATGTTAATAATGTCGATAGAAGCAATCCGTCTGATTTTACGGAAGTTCTCACGCACACGATCGAATACCACGATACTGTCATTGAGGGAATAGCCCACCACGGAAAGAATCGCTGCGATAAAGGTTAAATCCATTTCAATTTGCAAGTAGGAGAAAGCACCTAAGGTAACAATCACAT > 1/393979‑394458 | aGTAAAAAGTGCGGTCGAAATTCACTATGAATTTTAACCGCACTTTTGTTATTGACTAAGGCAGCTCATCAATATCATCTTTGTTCACTTTGGGTTGCACCATGTGTTCACGGTCAAGACCTAAGTCATATGCAATAGCAATCGCAACGAAGATAGAAGAGTATGTCCCAAATCCGATACCTATTAAGAGGGCCAACGAGAAACTATGGATTGTCGGACCGCCGAAGACAAAAAGGGCGATCACCACAAtt > 1:441060/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |