| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 3 | 43,599 | G→A | G457G (GGC→GGT) | unknown ← | Biofilm PGA synthesis deacetylase PgaB (EC 3.‑) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 3 | 43,599 | 0 | G | A | 100.0% | 210.7 / NA | 78 | G457G (GGC→GGT) | unknown | Biofilm PGA synthesis deacetylase PgaB (EC 3.‑) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (49/29); total (49/29) | |||||||||||
TAGTATCATAGTGTTTAGTTAAGGTAGTCAGATTTTGTGCAAACCATTCTTCCGCTTTCGGATTGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACGCCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACGGCGAAAGGCGTAAGTATTTATCTTTTGCCGGTTGGTTTGTGCGGTGATCTACCACATAGGTTGCCTCTTTAACATGATTGCGCAAGTCAAACGCCAAAACCGGCATCCACGCATATACC > 3/43370‑43833 | tagtaTCATAGTGTTTAGTTAAGGTAGTCAGATTTTGTGCAAACCATTCTTCCGCTTTCGGATTGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAAc < 1:590561/251‑1 (MQ=255) gtaTCATAGTGTTTAGTTAAGGTAGTCAGATTTTGTGCAAACCATTCTTCCGCTTTCGGATTGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATc > 1:276372/1‑239 (MQ=255) gtaTCATAGTGTTTAGTTAAGGTAGTCAGATTTTGTGCAAACCATTCTTCCGCTTTCGGATTGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACg > 1:438582/1‑250 (MQ=255) gtaTCATAGTGTTTAGTTAAGGTAGTCAGATTTTGTGCAAACCATTCTTCCGCTTTCGGATTGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACg > 1:718331/1‑250 (MQ=255) aTCATAGTGTTTAGTTAAGGTAGTCAGATTTTGTGCAAACCATTCTTCCGCTTTCGGATTGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAAc < 1:170367/247‑1 (MQ=255) gtgtTTAGTTAAGGTAGTCAGATTTTGTGCAAACCATTCTTCCGCTTTCGGATTGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGcatcatcat > 1:370206/1‑251 (MQ=255) gtgtTTAGTTAAGGTAGTCAGATTTTGTGCAAACCATTCTTCCGCTTTCGGATTGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGcatcatcat > 1:19469/1‑251 (MQ=255) gtTTAGTTAAGGTAGTCAGATTTTGTGCAAACCATTCTTCCGCTTTCGGATTGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATgg > 1:497853/1‑251 (MQ=255) aGTTAAGGTAGTCAGATTTTGTGCAAACCATTCTTCCGCTTTCGGATTGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCaaaa < 1:501757/223‑1 (MQ=255) aGTTAAGGTAGTCAGATTTTGTGCAAACCATTCTTCCGCTTTCGGATTGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATa > 1:52099/1‑251 (MQ=255) gTAGTCAGATTTTGTGCAAACCATTCTTCCGCTTTCGGATTGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTc < 1:239380/250‑1 (MQ=255) gTCAGATTTTGTGCAAACCATTCTTCCGCTTTCGGATTGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGt > 1:298164/1‑250 (MQ=255) gATTTTGTGCAAACCATTCTTCCGCTTTCGGATTGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGaa < 1:397285/235‑1 (MQ=255) gATTTTGTGCAAACCATTCTTCCGCTTTCGGATTGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAAt > 1:647583/1‑251 (MQ=255) gATTTTGTGCAAACCATTCTTCCGCTTTCGGATTGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAAt > 1:691554/1‑251 (MQ=255) ccATTCTTCCGCTTTCGGATTGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAAt > 1:337853/1‑228 (MQ=255) ccATTCTTCCGCTTTCGGATTGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATg > 1:222805/1‑251 (MQ=255) tcttcCGCTTTCGGATTGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATaa < 1:484746/251‑1 (MQ=255) tcttcCGCTTTCGGATTGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATaa < 1:809054/251‑1 (MQ=255) cttcCGCTTTCGGATTGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATaaa > 1:808531/1‑251 (MQ=255) ttcCGCTTTCGGATTGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGC‑GGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATc < 1:462897/251‑1 (MQ=255) gATTGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATa > 1:590088/1‑251 (MQ=255) tGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGAc < 1:705470/251‑1 (MQ=255) ggTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATc > 1:830542/1‑237 (MQ=255) ggTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTAATTAGGAAATAAGGATTCAGCGCGTTCGACAGCCCATCAGTCACACCAATTAAAACTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACCCCATCACCTTCACCATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGa > 1:797848/1‑249 (MQ=255) ggTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTA‑GGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATgg > 1:870559/1‑198 (MQ=255) tCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGa < 1:676959/195‑1 (MQ=255) tCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAat > 1:208726/1‑250 (MQ=255) cATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAACAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCcaca > 1:438126/1‑251 (MQ=255) aGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATaa > 1:144677/1‑214 (MQ=255) cGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTc < 1:602091/251‑1 (MQ=255) cGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATa > 1:856263/1‑250 (MQ=255) gTTTTTAGGGCGGGCGTACTGCTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATc < 1:38500/206‑1 (MQ=255) gTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAatc < 1:701294/225‑1 (MQ=255) gTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACgg > 1:820409/1‑251 (MQ=255) gTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACgg > 1:580365/1‑251 (MQ=255) gTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACgg > 1:30982/1‑251 (MQ=255) ttttAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATc > 1:532497/1‑204 (MQ=255) ggcgTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAAt > 1:74982/1‑203 (MQ=255) ggcgTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTc > 1:359380/1‑225 (MQ=255) ggcgTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACGGCGAAAGGCGTaa > 1:760397/1‑251 (MQ=255) gcgTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCttt > 1:797013/1‑227 (MQ=255) ctactTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACGGCGAAAGGCGTAAGTAttt > 1:438709/1‑251 (MQ=255) ctactTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACGGCGAAAGGCGTAAGTAttt < 1:383678/251‑1 (MQ=255) ctactTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACGGCGAAAGGCGTAAGTAttt > 1:226731/1‑251 (MQ=255) actTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACt > 1:22141/1‑200 (MQ=255) actTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAatc < 1:691090/205‑1 (MQ=255) ggAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATc < 1:271141/181‑1 (MQ=255) ggAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTcc > 1:167298/1‑206 (MQ=255) ggAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCcac > 1:702906/1‑208 (MQ=255) gTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATaa > 1:381511/1‑169 (MQ=255) gTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACGGCGAAAGGCGTAAGTATTTATCTTTTGCCggtt < 1:654815/249‑1 (MQ=255) gTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGACATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACGGCGAAAGGCGTAAGTATTTATCTTTTGCCggttgg > 1:878423/1‑251 (MQ=255) cgcgTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACGGCGAAAGGCGTAAGTATTTATCTTTTGCCGGTTGGTTtg < 1:159373/248‑1 (MQ=255) gCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACGGCGAAAGGCGTAAGTATTTATCTTTTGCCGGTTGGTTTGTGCGGTGa > 1:641481/1‑245 (MQ=255) cTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACGGCGAAAGGCGTAAGTATTTATCTTTTGCCGGTTGGTTTGTGCGGTGATCTAc < 1:287097/249‑1 (MQ=255) gTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACGGCGAAAGGCGTAAGTa > 1:599903/1‑206 (MQ=255) tCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACGGCGAAAGGCGTAAGTATTTATCTTTTGCCGGTTGGTTTGTGCGGTGATCTACCACATAgg < 1:547818/249‑1 (MQ=255) cacaCCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACGGCGAAAGGCGTAAGTATTTATCTTTTGCCGGTTGGTTTGTGCGGTGATCTACCACAt > 1:118264/1‑245 (MQ=255) cacCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGcatcat > 1:176994/1‑99 (MQ=255) cacCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAAt > 1:275490/1‑112 (MQ=255) cacCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAAt > 1:405367/1‑151 (MQ=255) cacCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAAt < 1:665331/151‑1 (MQ=255) cAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACGGCGAAAGGCGTAAGTATTTATCTTTTGCCGGTTGGTTTGTGCGGTGATCTACCACATAGGTTGCCTCTTTAACATGATTGCGCAAGTCAAACGCCAAAAc < 1:633619/250‑1 (MQ=255) cAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACGGCGAAAGGCGTAAGTATTTATCTTTTGCCGGTTGGTTTGTGCGGTGATCTACCACATAGGTTGCCTCTTTAACATGATTGCGCAAGTCAAACGCCAAAAc < 1:786829/250‑1 (MQ=255) aTCACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACGGCGAAAGGCGTAAGTATTTATCTTTTGCCGGTTGGTTTGTGCGGTGATCTACCACATAGGTTGCCTCTTTAAc > 1:804116/1‑213 (MQ=255) cACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGaa > 1:146352/1‑58 (MQ=255) cACCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACGGCGAAAGGCGTAAGTATTTATCTTTTGCCGGTTGGTTTGTGCGGTGATCTACCACATAGGTTGcc < 1:169377/203‑1 (MQ=255) aCCTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACGGCGAAAGGCGTAAGTATTTATc < 1:197421/159‑1 (MQ=255) ccTTCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATaa > 1:267673/1‑89 (MQ=255) tCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATaaaa < 1:829516/58‑1 (MQ=255) tCACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACGGCGAAAGGCGTAAGTATTTATCTTTTGCCGGTTGGTTTGTGCGGTGATCTACCACATAGGTTGCCTCTTTAACATGATTGCGCAAGTCAAACGCCAAAACCGGCATCCACGCATATAc < 1:466681/251‑1 (MQ=255) cACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAAt > 1:652594/1‑97 (MQ=255) cACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACGGCGAAAGGCGTAAGTATTTATCTTTTGCCGGTTGGTTTGTGCGGTGATCTACCACATAg > 1:293013/1‑191 (MQ=255) cACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACGGCGAAAGGCGTAAGTATTTATCTTTTGCCGGTTGGTTTGTGCGGTGATCTACCACATAGGTTGCCTCTTTAACATGATTGCGCAAGTCAAACGCCAAAACCGGCATCCACGCATATAcc < 1:392943/251‑1 (MQ=255) cACTATGGCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACGGCGAAAGGCGTAAGTATTTATCTTTTGCCGGTTGGTTTGTGCGGTGATCTACCACATAGGTTGCCTCTTTAACATGATTGCGCAAGTCAAACGCCAAAACCGGCATCCACGCATATAc > 1:525403/1‑250 (MQ=255) gCTTTCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACGGCGAAAGGCGTAAGTATTTATCTTTTGCCGGTTGGTTTGTGCGGTGATCTACCACATAGGTTGCCTCTTTAACAt < 1:677477/200‑1 (MQ=255) tttCTACACCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACgg > 1:433612/1‑124 (MQ=255) | TAGTATCATAGTGTTTAGTTAAGGTAGTCAGATTTTGTGCAAACCATTCTTCCGCTTTCGGATTGGTAATCACCGACGCATGCAAGCTACGCACGGTTTTTAGGGCGGGCGTACTACTTAGGAAATAAGGTTTCAGCGCGTTCGTCAGCTCATCAGTCACACCAATTAAATCTAACGTTTTTTGTTTTGCAGCGGCAGTCACGCCATCACCTTCACTATGGCTTTCTACGCCTTCAAAATCCGTTAAAAACGCATCATCATGGAATAAAATTCCGTCAAATTTTGCATAGAATGATAAATCATTATAAATAGACTTAATCATCTCCACATTCTTTCGGTCATACGGCGAAAGGCGTAAGTATTTATCTTTTGCCGGTTGGTTTGTGCGGTGATCTACCACATAGGTTGCCTCTTTAACATGATTGCGCAAGTCAAACGCCAAAACCGGCATCCACGCATATACC > 3/43370‑43833 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |