| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 3 | 37,672 | A→C | I351L (ATT→CTT) | unknown → | USG protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 3 | 37,672 | 0 | A | C | 100.0% | 230.7 / NA | 83 | I351L (ATT→CTT) | unknown | USG protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (44/39); total (44/39) | |||||||||||
ATATTGATGGAAATAGAACAAGCTCAAAAACGTAAAACTATTTTTATCTCAGGGGCAGCAGAAAATTATTCTCCTTATTCTCAGCAAGAAGTTGAACAATTTGTTTCTTCTCTTTCTCAAGAGATTTTAAAACTAGGGTATCGTATTGTTACAGGTTTTGGATTAGGAATAGGTAGCTCAGTTATTTCAGGCGCAATAAAACATCTTACGGAACAAAATTTAAAAATAGATGAGGACTATTTGATAATTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTTGCTGCTACTGGATATATGGCAAAACAACTCTGGGATAATGAGATGAATA > 3/37426‑37912 | atatTGATGGAAATAGAACAAGCTCAAAAACGTAAAACTATTTTTATCTCAGGGGCAGCAGAAAATTATTCTCCTTATTCTCAGCAAGAAGTTGAACAATTTGTTTCTTCTCTTTCTCAAGAGATTTTAAAACTAGGGTATCGTATTGTTACAGGTTTTGGATTAGGAATAGGTAGCTCAGTTATTTCAGGCGCAATAAAACATCTTACGGAACAAAATTTAAAAATAGATGAGGACTATTTGATACTTCg > 1:533447/1‑251 (MQ=255) 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ggTAGCTCAGTTATTTCAGGCGCAATAAAACATCTTACGGAACAAAATTTAAAAATAGATGAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGa > 1:356694/1‑134 (MQ=255) gTAGCTCAGTTATTTCAGGCGCAATAAAACATCTTACGGAACAAAATTTAAAAATAGATGAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGaaa < 1:815882/250‑1 (MQ=255) gTTATTTCAGGCGCAATAAAACATCTTACGGAACAAAATTTAAAAATAGATGAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAAt > 1:561768/1‑251 (MQ=255) ttATTTCAGGCGCAATAAAACATCTTACGGAACAAAATTTAAAAATAGATGAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATc < 1:850362/251‑1 (MQ=255) cAATAAAACATCTTACGGAACAAAATTTAAAAATAGATGAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGAttt > 1:852576/1‑120 (MQ=255) cAATAAAACATCTTACGGAACAAAATTTAAAAATAGATGAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTtgctg > 1:814346/1‑249 (MQ=255) aTAAAACATCTTACGGAACAAAATTTAAAAATAGATGAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTtgctg < 1:804277/247‑1 (MQ=255) aCATCTTACGGAACAAAATTTAAAAATAGATGAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTTGCTGCTACTGGat < 1:345567/251‑1 (MQ=255) aTCTTACGGAACAAAATTTAAAAATAGATGAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTa > 1:739151/1‑137 (MQ=255) aTCTTACGGAACAAAATTTAAAAATAGATGAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTTGCTGCTACTGGatat > 1:298049/1‑251 (MQ=255) ttACGGAACAAAATTTAAAAATAGATGAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTc > 1:473381/1‑132 (MQ=255) aCAAAATTTAAAAATAGATGAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTTGCTGCTACTGGATATATGGCAAaac < 1:341768/251‑1 (MQ=255) 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gATGAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGCTTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTTGCTGCTACTGGATATATGGCAAAACAACTCTGGGATAATga > 1:391999/1‑251 (MQ=255) gATGAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCaggag > 1:473492/1‑165 (MQ=255) gATGAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGaa < 1:275272/168‑1 (MQ=255) gAGGACTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTAAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGt > 1:884370/1‑69 (MQ=255) cTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTAtc < 1:245853/91‑1 (MQ=255) cTATTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTTGCTGCTACTGGATATATGGCAAAACAACTCTGGGATAATGAGATGAATa > 1:425568/1‑251 (MQ=255) gaTTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCtata > 1:744840/2‑96 (MQ=255) aTTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATg < 1:677143/81‑1 (MQ=255) aTTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTc > 1:631790/1‑99 (MQ=255) aTTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTc > 1:310542/1‑99 (MQ=255) aTTTGATACTTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTTGCTGCTACTGGATATATGGCAAAACAACTCTGGGa > 1:900992/1‑235 (MQ=255) | ATATTGATGGAAATAGAACAAGCTCAAAAACGTAAAACTATTTTTATCTCAGGGGCAGCAGAAAATTATTCTCCTTATTCTCAGCAAGAAGTTGAACAATTTGTTTCTTCTCTTTCTCAAGAGATTTTAAAACTAGGGTATCGTATTGTTACAGGTTTTGGATTAGGAATAGGTAGCTCAGTTATTTCAGGCGCAATAAAACATCTTACGGAACAAAATTTAAAAATAGATGAGGACTATTTGATAATTCGCCCATTCCCTCAGAATAAAGAAGGGAAAGAATTGTGGTCTGCTTGGCGTGAAGATATGATTTCTTATGCTGGTATCTCTATATTTCTATTCGGAAATAAATTACAGAATGGAAATTTGATTTTATCAAATGGTATGCAGGAGGAATTTGATATTTCCAAAAGGAATGGAAATGTTTTAATCCCTGTTGCTGCTACTGGATATATGGCAAAACAACTCTGGGATAATGAGATGAATA > 3/37426‑37912 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |