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gCTGGTTAGGCCGTAAAGCGCCACTAACGGGCGATCGGTCGCCGCGGCAATGTGCATTAAACCGCTGTCGTTACTGACGACGGCGGTGCAGTTGGCGATTAAATCCACCGCCTGATTGAGATTGGTTTGTCCCGCCAGATTCAAGCAGAAAGGCTGCAGTTCGACAGGCAAGGCGTTACGGa > 1:280280/1‑182 (MQ=255) ggTTAGGCCGTAAAGCGCCACTAACGGGCGATCGGTCGCCGCGGCAATGTGCATTAAACCGCTGTCGTTACTGACGACGGCGGTGCAGTTGGCGATTAAATCCACCGCCTGATTGAGATTGGTTTGTCCCGCCAGATTCAAGCAGAAAGGCTGCAGTTCGACAGGCAAGGCGTTACGGAt < 1:811587/180‑1 (MQ=255) ggTTAGGCCGTAAAGCGCCACTAACGGGCGATCGGTCGCCGCGGCAATGTGCATTAAACCGCTGTCGTTACTGACGACGGCGGTGCAGTTGGCGATTAAATCCACCGCCTGATTGAGATTGGTTTGTCCCGCCAGATTCAAGCAGAAAGGCTGCAGTTCGACAGGCAAGGCGTTACGGATTTGTTCGCCGGCGTCCACATCTTTCGGCGAGCCGAAAAGTTCCACTGCATAACCTTTTTCAATAAGCATc > 1:10494/1‑250 (MQ=255) | TATTGCCCCCAAAGGGTTTAATGCGAAATTCAAAGAAAAAAATGACCGCACTTTTGTGCGGTCAGGTGGCTATTGATTGAGTAATCCCATTAACTTTTCAAACACCAGCTGCGGCGTAATATCGATCAAACTCTGATGATAGCCTTCCGTGCTGTCGGCGCTTTTGCGTACTTTAATCAAATCCCCTTCTATTAACCGAATGATTTCGGCATTGTCCGATAAC‑GGGGGGGTGTAAGC‑GGGGCTGGTTGGGCCGTAAAGCGCCACTAACGGGCGATCGGTCGCCGCGGCAATGTGCATTAAACCGCTGTCGTTACTGACGACGGCGGTGCAGTTGGCGATTAAATCCACCGCCTGATTGAGATTGGTTTGTCCCGCCAGATTCAAGCAGAAAGGCTGCAGTTCGACAGGCAAGGCGTTACGGATTTGTTCGCCGGCGTCCACATCTTTCGGCGAGCCGAAAAGTTCCACTGCATAACCTTTTTCAAGAAGCATC > 3/14069‑14561 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |