| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 3 | 1,712 | T→G | F156V (TTT→GTT) | unknown → | DNA transformation protein TfoX |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 3 | 1,712 | 0 | T | G | 100.0% | 216.4 / NA | 75 | F156V (TTT→GTT) | unknown | DNA transformation protein TfoX |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (29/46); total (29/46) | |||||||||||
AATAAACTGGCACTCCACCGTTACTATCAACTTCCTCATTCTATTCGTAAAAATAAGCCGTTATTTGAAAAAACCGTTAAATTGTCTATTCAACAGGCAAAATTTAAGAAAGTCGCTGAAGATTTGACAAAAAAAGAGCGAATTAAAGAATTGGCTAATTTTTCCATTAAGCATGAAAGATTGCTGGCTAAAATTAATATTTATACGGTAAGTGAATTTCAGAAGATCGGCGCAATTCACAGCTATTTTAGGTTAAAGAAACTGGGTGTTTCTGCCAACGTAGAATTGTTATGGACTTTATGCGCCGCATTAAAAAATAAGCATGCTTCGTTGCTTACGGAAAAGGAAAAATCGGCAATTTTGACTAAATTAAATGTTTTACTTGCAGCAAATGGTTTGCGGAAAGTAAAGGCCTAAGAATCGCAAAAAGAAAAAAACCGCTCTATTGAGCGTTTTTTCATTTATAGAACACCTTAAAACACTTTAGAAA > 3/1466‑1955 | aaTAAACTGGCACTCCACCGTTACTATCAACTTCCTCATTCTATTCGTAAAAATAAGCCGTTATTTGAAAAAACCGTTAAATTGTCTATTCAACAGGCAAAATTTAAGAAAGTCGCTGAAGATTTGACAAAAAAAGAGCGAATTAAAGAATTGGCTAATTTTTCCATTAAGCATGAAAGATTGCTGGCTAAAATTAATATTTATACGGTAAGTGAATTTCAGAAGATCGGCGCAATTCACAGCTATGTTa < 1:305184/250‑1 (MQ=255) 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cgcAATTCACAGCTATGTTAGGTTAAAGAAACTGGGTGTTTCTGCCAACGTAGAATTGTTATGGACTTTATGCGCCGCATTAAAAAATAAGCATGCTTCGTTGCTTACGGAAAAGGAAAAATCGGCAATTTTGACTAAATTAAATGTTTTACTTGCAGCAAATGGTTTGCGGAAAGTAAAGGCCTAAGAATCGCAAAAAGAAAAAAACCGCTCTATTGAGCGTTTTTTCATTTATAGAACACCTTAAAac < 1:604078/250‑1 (MQ=255) cgcAATTCACAGCTATGTTAGGTTAAAGAAACTGGGTGTTTCTGCCAACGTAGAATTGTTATGGACTTTATGCGCCGCATTAAAAAATAAGCATGCTTCGTTGCTTACGGAAAAGGAAAAATCGGCAATTTTGACTAAATTAAATGTTTTACTTGCAGCAAATGGTTTGCGGAAAGTAAAGGCCTAAGAATCGCAAAAAGAAAAAAACCGCTCTATTGAGCGTTTTTTCATTTATAGAACACCTTAAAac < 1:508763/250‑1 (MQ=255) aTTCACAGCTATGTTAGGTTAAAGAAACTGGGTGTTTCTGCCAACGTAGAATTGTTATGGGCTTTATGCGCCGCATTAAAAAATAAGCATGCTTCGTTGCTTACGGAAAAGGAAAAATCGGCAATTTTGACTAAATTAAATGTTTTACtt < 1:419285/150‑1 (MQ=255) aTTCACAGCTATGTTAGGTTAAAGAAACTGGGTGTTTCTGCCAACGTAGAATTGTTATGGACTTTATGCGCCGCATTAAAAAATAAGCATGCTTCGTTGCTTACGGAAAAGGAAAAATCGGCAATTTTGACTAAATTAAATGTTTTACTTGCAGCAAATGGTTTGCGGAAAGTAAAGGCCTAAGa > 1:399787/1‑185 (MQ=255) aTTCACAGCTATGTTAGGTTAAAGAAACTGGGTGTTTCTGCCAACGTAGAATTGTTATGGACTTTATGCGCCGCATTAAAAAATAAGCATGCTTCGTTGCTTACGGAAAAGGAAAAATCGGCAATTTTGACTAAATTAAATGTTTTACTTGCAGCAAATGGTTTGCGGAAAGTAAAGGCCTAAGAATCGCaa > 1:306501/1‑192 (MQ=255) aTTCACAGCTATGTTAGGTTAAAGAAACTGGGTGTTTCTGCCAACGTAGAATTGTTATGGACTTTATGCGCCGCATTAAAAAATAAGCATGCTTCGTTGCTTACGGAAAAGGAAAAATCGGCAATTTTGACTAAATTAAATGTTTTACTTGCAGCAAATGGTTTGCGGAAAGTAAAGGCCTAAGAATCGCAAAAAGAAAAAAACCGCTCTATTGAGCGTTTTTTCATTTATAGAACACCTTAAAac < 1:511415/246‑1 (MQ=255) aTTCACAGCTATGTTAGGTTAAAGAAACTGGGTGTTTCTGCCAACGTAGAATTGTTATGGACTTTATGCGCCGCATTAAAAAATAAGCATGCTTCGTTGCTTACGGAAAAGGAAAAATCGGCAATTTTGACTAAATTAAATGTTTTACTTGCAGCAAATGGTTTGCGGAAAGTAAAGGCCTAAGAATCGCAAAAAGAAAAAAACCGCTCTATTGAGCGTTTTTTCATTTATAGAACACCTTAAAac < 1:105839/246‑1 (MQ=255) aTTCACAGCTATGTTAGGTTAAAGAAACTGGGTGTTTCTGCCAACGTAGAATTGTTAGGGACTTTATGCGCCGCATTAAAAAATAAGCATGCTTCGTTGCTTACGGAAAAGGAAAAATCGGCAATTTTGACTAAATTAAATGTTTTACTTGCAGCAAATGGTTTGCGGAAAGTAAAGGCCTAAGAATCGCAAAAAGAAAAAAACCGCTCTATTGAGCGTTTTTTCAt < 1:430301/227‑1 (MQ=255) tCACAGCTATGTTAGGTTAAAGAAACTGGGTGTTTCTGCCAACGTAGAATTGTTATGGACTTTATGCGCCGCATTAAAAAATAAGCATGCTTCGTTGCTTACGGAAAAGGAAAAATCGGCAATTTTGACTAAATTAAATGTTTTACTTGCAGCAAATGGTTTGCGGAAAGTAAAGGCCTAAGAATCGCAAAAAGAAAAAAACCGCTCTATTGAGCGTTTTTTCATTTATAg < 1:837061/231‑1 (MQ=255) caGCTATGTTAGGTTAAAGAAACTGGGTGTTTCTGCCAACGTAGAATTGTTATGGACTTTATGCGCCGCATTAAAAAATAAGCATGCTTCGTTGCTTACGGAAAAGGAAAAATCGGCAATTTTGACTAAATTAAATGTTTTACTTGCAGCAAATGGTTTGCGGAAAGTAAAGGCCTAAGAATCGCAAAAAGAAAAAAACCGCTCTATTGAGCGTTTTTTCATTTATAGAACACCTTAAAac < 1:11880/241‑1 (MQ=255) cTATGTTAGGTTAAAGAAACTGGGTGTTTCTGCCAACGTAGAATTGTTATGGACTTTATGCGCCGCATTAAAAAATAAGCATGCTTCGTTGCTTACGGAAAAGGAAAAATCGGCAATTTTGACTAAATTAAATGTTTTACTTGCAGCAAATGGTTTGCGGAAAGTAAAGGCCTAAGAATCGCAAAAAGAAAAAAACCGCTCTATTGAGCGTTTTTTCATTTATAGAACACCTTAAAACACTTTAGaaa < 1:378438/248‑1 (MQ=255) cTATGTTAGGTTAAAGAAACTGGGTGTTTCTGCCAACGTAGAATTGTTATGGACTTTATGCGCCGCATTAAAAAATAAGCATGCTTCGTTGCTTACGGAAAAGGAAAAATCGGCAATTTTGACTAAATTAAATGTTTTACTTGCAGCAAATGGTTTGCGGAAAGTAAAGGCCTAAGAATCGCAAAAAGAAAAAAACCGCTCTATTGAGCGTTTTTTCATTTATAGAACACCTTAAAACACTTTAGaaa < 1:476127/248‑1 (MQ=255) | AATAAACTGGCACTCCACCGTTACTATCAACTTCCTCATTCTATTCGTAAAAATAAGCCGTTATTTGAAAAAACCGTTAAATTGTCTATTCAACAGGCAAAATTTAAGAAAGTCGCTGAAGATTTGACAAAAAAAGAGCGAATTAAAGAATTGGCTAATTTTTCCATTAAGCATGAAAGATTGCTGGCTAAAATTAATATTTATACGGTAAGTGAATTTCAGAAGATCGGCGCAATTCACAGCTATTTTAGGTTAAAGAAACTGGGTGTTTCTGCCAACGTAGAATTGTTATGGACTTTATGCGCCGCATTAAAAAATAAGCATGCTTCGTTGCTTACGGAAAAGGAAAAATCGGCAATTTTGACTAAATTAAATGTTTTACTTGCAGCAAATGGTTTGCGGAAAGTAAAGGCCTAAGAATCGCAAAAAGAAAAAAACCGCTCTATTGAGCGTTTTTTCATTTATAGAACACCTTAAAACACTTTAGAAA > 3/1466‑1955 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |