| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 3 | 269 | G→A | intergenic (–/‑978) | – / → unknown | –/DNA transformation protein TfoX |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 3 | 269 | 0 | G | A | 100.0% | 182.5 / NA | 65 | intergenic (–/‑978) | –/unknown | –/DNA transformation protein TfoX |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (29/36); total (29/36) | |||||||||||
ATGCTGTACTTCCTTTTTAATTCATTATACACGACTAATTTTTATTTTAATTCTATTAAATAATCATTTAAGCCGATTTATCGTATTTTTCAATGTCTGAATCTGTATATCGTTCAGACGTGAATAATAGTCCATATTGTAACGGTCTAACTTTCAGCAACACCTCAAGCCTGATAAAACCAATCATTAGTTAAATTAACAAGTTAATGTGCAGGCAAAAACCGGGGGGGTAGGCAGGTGACATTATTTATGCATAGCTATGCTGACTGTATTTAGCCATAGTCATTGACCTTTACTCCTGTCAAATTGTGGGTTGACGCTGTTCCGCTGAGATCCATATAGCATTGAGTAAACAGGCGTTAGGTTCGAAGATTCACTGCAGACAACCGAAGCGGCTTCAGCCTTAGGCAATTTATTACTAATGATGTTTGAAGCGAAAAAATGTTTTTAAAATAAATTTATCTTTGTTGTAT > 3/41‑513 | aTGCTGTACTTCCTTTTTAATTCATTATACACGACTAATTTTTATTTTAATTCTATTAAATAATCATTTAAGCCGATTTACCGTATTTTTCAATGTCTGAATCTGTATATCGTTCAGACGTGAATAATAGTCCATATTGTAACGGTCTAACTTTCAGCAACACCTCAAGCCTGATAAAACCAATCATTAGTTAAATTAACAAGTTAATGTGCAGGCAAAAACCGGGGGAGTAGGCAGGTGACAttattta < 1:813837/250‑1 (MQ=255) 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tCTGTATATCGTTCAGACGTGAATAATAGTCCATATTGTAACGGTCTAACTTTCAGCAACACCTCAAGCCTGATAAAACCAATCATTAGTTAAATTAACAAGTTAATGTGCAGGCAAAAACCGGGGGAGTAGGCAGGTGACATTATTTATGCATAGCTATGCTGACTGTATTTAGCCATAGTCATTGACCTTTACTCCTGTCAAATTGTGGGTTGACGCTGTTCCGCTGAGATCCATATAGCATTGAGTaa > 1:606216/1‑251 (MQ=255) gTATATCGTTCAGACGTGAATAATAGTCCATATTGTAACGGTCTAACTTTCAGCAACACCTCAAGCCTGATAAAACCAATCATTAGTTAAATTAACAAGTTAATGTGCAGGCAAAAACCGGGGGAGTAGGCAGGTGACATTATTTATGCATAGCTATGCTGACTGTATTTAGCCATAGTCATTGACCTTTACTCCTGTCAAATTGTGGGTTGACGCTGTTc > 1:358617/1‑221 (MQ=255) gTATATCGTTCAGACGTGAATAATAGTCCATATTGTAACGGTCTAACTTTCAGCAACACCTCAAGCCTGATAAAACCAATCATTAGTTAAATTAACAAGTTAATGTGCAGGCAAAAACCGGGGGAGTAGGCAGGTGACATTATTTATGCATAGCTATGCTGACTGTATTTAGCCATAGTCATTGACCTTTACTCCTGTCAAATTGTGGGTTGACGCTGTTCCGCTGAGATCCatat < 1:157832/236‑1 (MQ=255) 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atatTGTAACGGTCTAACTTTCAGCAACACCTCAAGCCTGATAAAACCAATCATTAGTTAAATTAACAAGTTAATGTGCAGGCAAAAACCGGGGGAGTAGGCAGGTGACATTATTTATGCATAGCTATGCTGACTGTATTTAGCCATAGTCATTGACCTTTACTCCTGTCAAATTGTGGGTTGACGCTGTTCCGCTGAGATCCATATAGCATTGAGTAAACAGGCGTTAGGtt > 1:727478/1‑233 (MQ=255) ttGTAACGGTCTAACTTTCAGCAACACCTCAAGCCTGATAAAACCAATCATTAGTTAAATTAACAAGTTAATGTGCAGGCAAAAACCGGGGGAGTAGGCAGGTGACATTATTTATGCATAGCTATGCTGACTGTATTTAGCCATAGTCATTGACCTTTACTCCTGTCAAATTGTGGGTTGACGCTGTTCCGCTGAGATCCATATAGc > 1:215911/1‑207 (MQ=255) ttGTAACGGTCTAACTTTCAGCAACACCTCAAGCCTGATAAAACCAATCATTAGTTAAATTAACAAGTTAATGTGCAGGCAAAAACCGGGGGAGTAGGCAGGTGACATTATTTATGCATAGCTATGCTGACTGTATTTAGCCATAGTCATTGACCTTTACTCCTGTCAAATTGTGGGTTGACGCTGTTCCGCTGAGATCCATATAGCATTGAGt < 1:164005/214‑1 (MQ=255) ttGTAACGGTCTAACTTTCAGCAACACCTCAAGCCTGATAAAACCAATCATTAGTTAAATTAACAAGTTAATGTGCAGGCAAAAACCGGGGGAGTAGGCAGGTGACATTATTTATGCATAGCTATGCTGACTGTATTTAGCCATAGTCATTGACCTTTACTCCTGTCAAATTGTGGGTTGACGCTGTTCCGCTGAGATCCATATAGCATTGAGTAAACAGGCGTTAGGTTCGAAGATTCACTGCAGACAAc < 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cGGGGGAGTAGGCAGGTGACATTATTTATGCATAGCTATGCTGACTGTATTTAGCCATAGTCATTGACCTTTACTCCTGTCAAATTGTGGGTTGACGCTGTTCCGCTGAGATCCATATAGCATTGAGTAAACAGGCGTTAGGTTCGAAGATTCACTGCAGACAACCGAAGCGGCTTCAGCCTTAGGCAATTTATTACTAATGATGTTTGAAGCGAAAAAATGTTTTTAAAATAAATTTATCTTTGTTGTAt < 1:378757/251‑1 (MQ=255) | ATGCTGTACTTCCTTTTTAATTCATTATACACGACTAATTTTTATTTTAATTCTATTAAATAATCATTTAAGCCGATTTATCGTATTTTTCAATGTCTGAATCTGTATATCGTTCAGACGTGAATAATAGTCCATATTGTAACGGTCTAACTTTCAGCAACACCTCAAGCCTGATAAAACCAATCATTAGTTAAATTAACAAGTTAATGTGCAGGCAAAAACCGGGGGGGTAGGCAGGTGACATTATTTATGCATAGCTATGCTGACTGTATTTAGCCATAGTCATTGACCTTTACTCCTGTCAAATTGTGGGTTGACGCTGTTCCGCTGAGATCCATATAGCATTGAGTAAACAGGCGTTAGGTTCGAAGATTCACTGCAGACAACCGAAGCGGCTTCAGCCTTAGGCAATTTATTACTAATGATGTTTGAAGCGAAAAAATGTTTTTAAAATAAATTTATCTTTGTTGTAT > 3/41‑513 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |