| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 383,475 | A→C | intergenic (+175/‑126) | unknown → / → unknown | Myo‑inositol 2‑dehydrogenase 2 (EC 1.1.1.18)/Inositol transport system sugar‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 383,475 | 0 | A | C | 97.7% | 98.9 / NA | 43 | intergenic (+175/‑126) | unknown/unknown | Myo‑inositol 2‑dehydrogenase 2 (EC 1.1.1.18)/Inositol transport system sugar‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base C (23/19); minor base T (1/0); total (24/19) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.95e-01 | |||||||||||
ATGCTATTGCGTTTTCATGTGAACAAAAGCGTTGGATAGACGTAGAAGAGGTTGCGTAACGAATTCGTATTGAGCATGAACATAGGAGTCTTTGGACTCCTATTTTTTTGCTAAAAATAAAATATTTAGTTTATTTTTGCAGTAGTTAAATTTTCCTTCCAAAAAATAAGATCTATCTCACACTTTCAAAAAATGGCGGTTGCAGGAAATCTTCTTTTAATGATATAGATACT‑AAACGGACGATTTGTTT‑CAAATTGTATATTGGTGAAATTTATATTCGCATGTGATTGTTGTGGTGGGGTATAGCAGTATTTCAATTTTTGTTGTTATTCGTTTAACCGATAAAAGGGAGTAGCATTATGAAAAAGACACTACTTGCGTTACTTTGTGGTGGAATCCTATTAACGTCTCAAGCTGTTATTGCTAAAAATGTTGTAATTGGCGCTCCGATGGTTGCCTTCTCCGATAAATGGCAAAC > 1/383242‑383719 | aTGCTATTGCGTTTTCATGTGAACAAAAGCGTTGGATAGACGTAGAAGAGGTTGCGTAACGAATTCGTATTGAGCATGAACATAGGAGTCTTTGGACTCCTATTTTTTTGCTAAAAATAAAATATTTAGTTTATTTTTGCAGTAGTTAAATTTTCCTTCCAAAAAATAAGATCTATCTCACACTTTCAAAAAATGGCGGTTGCAGGAAATCTTTTTTTTATGATATATATACT‑CAACGGACGATttttttt > 1:501722/1‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |